RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	22.93	■■□□□ 1.26
MUC1-222	ENST00000610468	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	22.93	■■□□□ 1.26
MUC1-222	ENST00000610468	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		22.92	■■□□□ 1.26
MUC1-222	ENST00000610468	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		22.92	■■□□□ 1.26
MUC1-222	ENST00000610468	KIF14	Q15058	1648 aa		22.91	■■□□□ 1.26
MUC1-222	ENST00000610468	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		22.91	■■□□□ 1.26
MUC1-222	ENST00000610468	CLIP1	P30622	1438 aa		22.89	■■□□□ 1.25
MUC1-222	ENST00000610468	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		22.88	■■□□□ 1.25
MUC1-222	ENST00000610468	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	22.87	■■□□□ 1.25
MUC1-222	ENST00000610468	ATP10A	O60312	1499 aa		22.85	■■□□□ 1.25
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		22.85	■■□□□ 1.25
MUC1-222	ENST00000610468	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		22.85	■■□□□ 1.25
MUC1-222	ENST00000610468	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		22.84	■■□□□ 1.25
MUC1-222	ENST00000610468	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		22.83	■■□□□ 1.25
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		22.83	■■□□□ 1.25
MUC1-222	ENST00000610468	KDM5C	P41229	1560 aa		22.83	■■□□□ 1.25
MUC1-222	ENST00000610468	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		22.82	■■□□□ 1.24
MUC1-222	ENST00000610468	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		22.82	■■□□□ 1.24
MUC1-222	ENST00000610468	AFAP1	Q8N556	730 aa		22.77	■■□□□ 1.24
MUC1-222	ENST00000610468	MLEC	Q14165	292 aa		22.76	■■□□□ 1.23
MUC1-222	ENST00000610468	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		22.76	■■□□□ 1.23
MUC1-222	ENST00000610468	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		22.74	■■□□□ 1.23
MUC1-222	ENST00000610468	FBXO41	Q8TF61	875 aa		22.74	■■□□□ 1.23
MUC1-222	ENST00000610468	RERE	Q9P2R6	1566 aa		22.74	■■□□□ 1.23
MUC1-222	ENST00000610468	PREX2	Q70Z35	1606 aa		22.74	■■□□□ 1.23
MUC1-222	ENST00000610468	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		22.73	■■□□□ 1.23
MUC1-222	ENST00000610468	ABCC1	P33527	1531 aa		22.73	■■□□□ 1.23
MUC1-222	ENST00000610468	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		22.72	■■□□□ 1.23
MUC1-222	ENST00000610468	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		22.72	■■□□□ 1.23
MUC1-222	ENST00000610468	HSPA2	P54652	639 aa		22.72	■■□□□ 1.23
MUC1-222	ENST00000610468	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		22.7	■■□□□ 1.22
MUC1-222	ENST00000610468	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		22.69	■■□□□ 1.22
MUC1-222	ENST00000610468	ABCA6	Q8N139	1617 aa		22.67	■■□□□ 1.22
MUC1-222	ENST00000610468	AGL	P35573	1532 aa		22.67	■■□□□ 1.22
MUC1-222	ENST00000610468	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		22.63	■■□□□ 1.21
MUC1-222	ENST00000610468	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	22.62	■■□□□ 1.21
MUC1-222	ENST00000610468	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		22.62	■■□□□ 1.21
MUC1-222	ENST00000610468	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	22.62	■■□□□ 1.21
MUC1-222	ENST00000610468	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		22.61	■■□□□ 1.21
MUC1-222	ENST00000610468	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		22.6	■■□□□ 1.21
MUC1-222	ENST00000610468	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		22.58	■■□□□ 1.2
MUC1-222	ENST00000610468	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		22.58	■■□□□ 1.2
MUC1-222	ENST00000610468	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		22.56	■■□□□ 1.2
MUC1-222	ENST00000610468	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		22.56	■■□□□ 1.2
MUC1-222	ENST00000610468	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		22.55	■■□□□ 1.2
MUC1-222	ENST00000610468	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		22.53	■■□□□ 1.2
MUC1-222	ENST00000610468	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		22.53	■■□□□ 1.2
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	22.52	■■□□□ 1.2
MUC1-222	ENST00000610468	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	22.51	■■□□□ 1.19
MUC1-222	ENST00000610468	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		22.5	■■□□□ 1.19
MUC1-222	ENST00000610468	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	22.5	■■□□□ 1.19
MUC1-222	ENST00000610468	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		22.5	■■□□□ 1.19
MUC1-222	ENST00000610468	C3	P01024	1663 aa		22.49	■■□□□ 1.19
MUC1-222	ENST00000610468	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	22.49	■■□□□ 1.19
MUC1-222	ENST00000610468	CERK	Q8TCT0	537 aa		22.48	■■□□□ 1.19
MUC1-222	ENST00000610468	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	22.48	■■□□□ 1.19
MUC1-222	ENST00000610468	ATP7A	Q04656	1500 aa		22.47	■■□□□ 1.19
MUC1-222	ENST00000610468	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	22.47	■■□□□ 1.19
MUC1-222	ENST00000610468	PLXNC1	O60486	1568 aa		22.46	■■□□□ 1.19
MUC1-222	ENST00000610468	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		22.46	■■□□□ 1.19
MUC1-222	ENST00000610468	STRC	Q7RTU9	1775 aa		22.45	■■□□□ 1.18
MUC1-222	ENST00000610468	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	22.45	■■□□□ 1.18
MUC1-222	ENST00000610468	NPAT	Q14207	1427 aa		22.44	■■□□□ 1.18
MUC1-222	ENST00000610468	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		22.44	■■□□□ 1.18
MUC1-222	ENST00000610468	CEP162	Q5TB80	1403 aa		22.43	■■□□□ 1.18
MUC1-222	ENST00000610468	TIAM1	Q13009	1591 aa		22.42	■■□□□ 1.18
MUC1-222	ENST00000610468	A2M	P01023	1474 aa		22.42	■■□□□ 1.18
MUC1-222	ENST00000610468	MBD5	Q9P267	1494 aa		22.41	■■□□□ 1.18
MUC1-222	ENST00000610468	PTPRT	O14522	1441 aa		22.4	■■□□□ 1.18
MUC1-222	ENST00000610468	MROH2A	A6NES4	1674 aa		22.4	■■□□□ 1.18
MUC1-222	ENST00000610468	ZMYM3	Q14202	1370 aa		22.39	■■□□□ 1.18
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	22.37	■■□□□ 1.17
MUC1-222	ENST00000610468	NCOA1	Q15788	1441 aa		22.37	■■□□□ 1.17
MUC1-222	ENST00000610468	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		22.35	■■□□□ 1.17
MUC1-222	ENST00000610468	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	22.34	■■□□□ 1.17
MUC1-222	ENST00000610468	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		22.33	■■□□□ 1.17
MUC1-222	ENST00000610468	PTPRK	Q15262	1439 aa		22.31	■■□□□ 1.16
MUC1-222	ENST00000610468	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		22.3	■■□□□ 1.16
MUC1-222	ENST00000610468	NCOA2	Q15596	1464 aa		22.3	■■□□□ 1.16
MUC1-222	ENST00000610468	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	22.28	■■□□□ 1.16
MUC1-222	ENST00000610468	GGT6	Q6P531	493 aa		22.28	■■□□□ 1.16
MUC1-222	ENST00000610468	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		22.28	■■□□□ 1.16
MUC1-222	ENST00000610468	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	22.27	■■□□□ 1.16
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		22.27	■■□□□ 1.16
MUC1-222	ENST00000610468	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		22.26	■■□□□ 1.15
MUC1-222	ENST00000610468	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		22.26	■■□□□ 1.15
MUC1-222	ENST00000610468	PLA2R1	Q13018	1463 aa		22.25	■■□□□ 1.15
MUC1-222	ENST00000610468	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		22.24	■■□□□ 1.15
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	22.24	■■□□□ 1.15
MUC1-222	ENST00000610468	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		22.23	■■□□□ 1.15
MUC1-222	ENST00000610468	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		22.23	■■□□□ 1.15
MUC1-222	ENST00000610468	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	22.22	■■□□□ 1.15
MUC1-222	ENST00000610468	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	22.22	■■□□□ 1.15
MUC1-222	ENST00000610468	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		22.22	■■□□□ 1.15
MUC1-222	ENST00000610468	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		22.21	■■□□□ 1.15
MUC1-222	ENST00000610468	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		22.19	■■□□□ 1.14
MUC1-222	ENST00000610468	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		22.19	■■□□□ 1.14
MUC1-222	ENST00000610468	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		22.18	■■□□□ 1.14
MUC1-222	ENST00000610468	PKD2	Q13563	968 aa		22.18	■■□□□ 1.14
MUC1-222	ENST00000610468	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		22.16	■■□□□ 1.14

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms