RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 RAPGEF3O95398 923 aa27.59■■■□□ 2.01
HERC3-214ENST00000601319 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.58■■■□□ 2.01
HERC3-214ENST00000601319 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.58■■■□□ 2
HERC3-214ENST00000601319 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.57■■■□□ 2
HERC3-214ENST00000601319 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.57■■■□□ 2
HERC3-214ENST00000601319 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.54■■■□□ 2
HERC3-214ENST00000601319 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.54■■■□□ 2
HERC3-214ENST00000601319 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.53■■■□□ 2
HERC3-214ENST00000601319 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.53■■■□□ 2
HERC3-214ENST00000601319 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.52■■■□□ 2
HERC3-214ENST00000601319 ABCC1P33527 1531 aa27.52■■■□□ 2
HERC3-214ENST00000601319 KDM5CP41229 1560 aa27.52■■■□□ 2
HERC3-214ENST00000601319 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.51■■■□□ 2
HERC3-214ENST00000601319 TIAM1Q13009 1591 aa27.51■■□□□ 1.99
HERC3-214ENST00000601319 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.49■■□□□ 1.99
HERC3-214ENST00000601319 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.48■■□□□ 1.99
HERC3-214ENST00000601319 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
HERC3-214ENST00000601319 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.45■■□□□ 1.99
HERC3-214ENST00000601319 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.45■■□□□ 1.99
HERC3-214ENST00000601319 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.45■■□□□ 1.98
HERC3-214ENST00000601319 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
HERC3-214ENST00000601319 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.44■■□□□ 1.98
HERC3-214ENST00000601319 MAP3K1Q13233 1512 aa27.41■■□□□ 1.98
HERC3-214ENST00000601319 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.41■■□□□ 1.98
HERC3-214ENST00000601319 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.4■■□□□ 1.98
HERC3-214ENST00000601319 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.39■■□□□ 1.98
HERC3-214ENST00000601319 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.36■■□□□ 1.97
HERC3-214ENST00000601319 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.36■■□□□ 1.97
HERC3-214ENST00000601319 REREQ9P2R6 1566 aa27.35■■□□□ 1.97
HERC3-214ENST00000601319 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.34■■□□□ 1.97
HERC3-214ENST00000601319 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.34■■□□□ 1.97
HERC3-214ENST00000601319 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.34■■□□□ 1.97
HERC3-214ENST00000601319 ABCA6Q8N139 1617 aa27.34■■□□□ 1.97
HERC3-214ENST00000601319 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.32■■□□□ 1.96
HERC3-214ENST00000601319 MADDQ8WXG6 1647 aa27.32■■□□□ 1.96
HERC3-214ENST00000601319 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.32■■□□□ 1.96
HERC3-214ENST00000601319 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.32■■□□□ 1.96
HERC3-214ENST00000601319 ATP10AO60312 1499 aa27.32■■□□□ 1.96
HERC3-214ENST00000601319 NCOA2Q15596 1464 aa27.32■■□□□ 1.96
HERC3-214ENST00000601319 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.31■■□□□ 1.96
HERC3-214ENST00000601319 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.31■■□□□ 1.96
HERC3-214ENST00000601319 AFAP1Q8N556 730 aa27.27■■□□□ 1.96
HERC3-214ENST00000601319 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.96
HERC3-214ENST00000601319 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
HERC3-214ENST00000601319 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.25■■□□□ 1.95
HERC3-214ENST00000601319 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
HERC3-214ENST00000601319 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
HERC3-214ENST00000601319 PTPRMP28827 1452 aa27.21■■□□□ 1.95
HERC3-214ENST00000601319 ATP7AQ04656 1500 aa27.21■■□□□ 1.95
HERC3-214ENST00000601319 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
HERC3-214ENST00000601319 AGLP35573 1532 aa27.19■■□□□ 1.94
HERC3-214ENST00000601319 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.17■■□□□ 1.94
HERC3-214ENST00000601319 MBD5Q9P267 1494 aa27.17■■□□□ 1.94
HERC3-214ENST00000601319 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.15■■□□□ 1.94
HERC3-214ENST00000601319 PLXNC1O60486 1568 aa27.13■■□□□ 1.93
HERC3-214ENST00000601319 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.13■■□□□ 1.93
HERC3-214ENST00000601319 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.12■■□□□ 1.93
HERC3-214ENST00000601319 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
HERC3-214ENST00000601319 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.09■■□□□ 1.93
HERC3-214ENST00000601319 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
HERC3-214ENST00000601319 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.09■■□□□ 1.93
HERC3-214ENST00000601319 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
HERC3-214ENST00000601319 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.07■■□□□ 1.92
HERC3-214ENST00000601319 MIA2Q96PC5 1412 aa27.07■■□□□ 1.92
HERC3-214ENST00000601319 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.06■■□□□ 1.92
HERC3-214ENST00000601319 APLP2Q06481 763 aa27.03■■□□□ 1.92
HERC3-214ENST00000601319 A2MP01023 1474 aa27.01■■□□□ 1.91
HERC3-214ENST00000601319 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.01■■□□□ 1.91
HERC3-214ENST00000601319 MROH2AA6NES4 1674 aa26.99■■□□□ 1.91
HERC3-214ENST00000601319 MLECQ14165 292 aa26.98■■□□□ 1.91
HERC3-214ENST00000601319 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.98■■□□□ 1.91
HERC3-214ENST00000601319 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.98■■□□□ 1.91
HERC3-214ENST00000601319 C3P01024 1663 aa26.97■■□□□ 1.91
HERC3-214ENST00000601319 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.97■■□□□ 1.91
HERC3-214ENST00000601319 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.94■■□□□ 1.9
HERC3-214ENST00000601319 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.92■■□□□ 1.9
HERC3-214ENST00000601319 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.91■■□□□ 1.9
HERC3-214ENST00000601319 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.9■■□□□ 1.9
HERC3-214ENST00000601319 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
HERC3-214ENST00000601319 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
HERC3-214ENST00000601319 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
HERC3-214ENST00000601319 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.87■■□□□ 1.89
HERC3-214ENST00000601319 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.85■■□□□ 1.89
HERC3-214ENST00000601319 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
HERC3-214ENST00000601319 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
HERC3-214ENST00000601319 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
HERC3-214ENST00000601319 TSPY4P0CV99 314 aa26.82■■□□□ 1.88
HERC3-214ENST00000601319 TSPY10P0CW01 314 aa26.82■■□□□ 1.88
HERC3-214ENST00000601319 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
HERC3-214ENST00000601319 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
HERC3-214ENST00000601319 ABCC5O15440 1437 aa26.76■■□□□ 1.87
HERC3-214ENST00000601319 DAPK1P53355 1430 aa26.76■■□□□ 1.87
HERC3-214ENST00000601319 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.75■■□□□ 1.87
HERC3-214ENST00000601319 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.75■■□□□ 1.87
HERC3-214ENST00000601319 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.75■■□□□ 1.87
HERC3-214ENST00000601319 NPATQ14207 1427 aa26.74■■□□□ 1.87
HERC3-214ENST00000601319 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
HERC3-214ENST00000601319 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
HERC3-214ENST00000601319 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.73■■□□□ 1.87
HERC3-214ENST00000601319 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.71■■□□□ 1.87
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