RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593701.5

SLC27A1-202, Transcript of solute carrier family 27 member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SLC27A1, Length 688 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1-202ENST00000593701 LMTK3Q96Q04 1460 aa32.46■■■□□ 2.79
SLC27A1-202ENST00000593701 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.45■■■□□ 2.79
SLC27A1-202ENST00000593701 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.44■■■□□ 2.78
SLC27A1-202ENST00000593701 KIF14Q15058 1648 aa32.44■■■□□ 2.78
SLC27A1-202ENST00000593701 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.41■■■□□ 2.78
SLC27A1-202ENST00000593701 MLECQ14165 292 aa32.4■■■□□ 2.78
SLC27A1-202ENST00000593701 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.4■■■□□ 2.78
SLC27A1-202ENST00000593701 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.37■■■□□ 2.77
SLC27A1-202ENST00000593701 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.35■■■□□ 2.77
SLC27A1-202ENST00000593701 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
SLC27A1-202ENST00000593701 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
SLC27A1-202ENST00000593701 HSPA2P54652 639 aa32.33■■■□□ 2.77
SLC27A1-202ENST00000593701 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.3■■■□□ 2.76
SLC27A1-202ENST00000593701 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.28■■■□□ 2.76
SLC27A1-202ENST00000593701 FBXO41Q8TF61 875 aa32.28■■■□□ 2.76
SLC27A1-202ENST00000593701 ATP10AO60312 1499 aa32.28■■■□□ 2.76
SLC27A1-202ENST00000593701 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.26■■■□□ 2.76
SLC27A1-202ENST00000593701 CLIP1P30622 1438 aa32.25■■■□□ 2.75
SLC27A1-202ENST00000593701 AFAP1Q8N556 730 aa32.24■■■□□ 2.75
SLC27A1-202ENST00000593701 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.22■■■□□ 2.75
SLC27A1-202ENST00000593701 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.22■■■□□ 2.75
SLC27A1-202ENST00000593701 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.2■■■□□ 2.74
SLC27A1-202ENST00000593701 KDM5CP41229 1560 aa32.19■■■□□ 2.74
SLC27A1-202ENST00000593701 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.16■■■□□ 2.74
SLC27A1-202ENST00000593701 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
SLC27A1-202ENST00000593701 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.14■■■□□ 2.74
SLC27A1-202ENST00000593701 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.13■■■□□ 2.73
SLC27A1-202ENST00000593701 PREX2Q70Z35 1606 aa32.12■■■□□ 2.73
SLC27A1-202ENST00000593701 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.11■■■□□ 2.73
SLC27A1-202ENST00000593701 ABCA6Q8N139 1617 aa32.1■■■□□ 2.73
SLC27A1-202ENST00000593701 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.09■■■□□ 2.73
SLC27A1-202ENST00000593701 ABCC1P33527 1531 aa32.08■■■□□ 2.73
SLC27A1-202ENST00000593701 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.04■■■□□ 2.72
SLC27A1-202ENST00000593701 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.04■■■□□ 2.72
SLC27A1-202ENST00000593701 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.04■■■□□ 2.72
SLC27A1-202ENST00000593701 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.03■■■□□ 2.72
SLC27A1-202ENST00000593701 REREQ9P2R6 1566 aa32.02■■■□□ 2.72
SLC27A1-202ENST00000593701 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.01■■■□□ 2.71
SLC27A1-202ENST00000593701 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.96■■■□□ 2.71
SLC27A1-202ENST00000593701 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
SLC27A1-202ENST00000593701 C3P01024 1663 aa31.92■■■□□ 2.7
SLC27A1-202ENST00000593701 AGLP35573 1532 aa31.92■■■□□ 2.7
SLC27A1-202ENST00000593701 CERKQ8TCT0 537 aa31.92■■■□□ 2.7
SLC27A1-202ENST00000593701 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.92■■■□□ 2.7
SLC27A1-202ENST00000593701 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.91■■■□□ 2.7
SLC27A1-202ENST00000593701 STRCQ7RTU9 1775 aa31.89■■■□□ 2.7
SLC27A1-202ENST00000593701 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.89■■■□□ 2.7
SLC27A1-202ENST00000593701 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
SLC27A1-202ENST00000593701 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.84■■■□□ 2.69
SLC27A1-202ENST00000593701 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
SLC27A1-202ENST00000593701 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
SLC27A1-202ENST00000593701 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
SLC27A1-202ENST00000593701 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
SLC27A1-202ENST00000593701 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
SLC27A1-202ENST00000593701 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.74■■■□□ 2.67
SLC27A1-202ENST00000593701 ATP7AQ04656 1500 aa31.74■■■□□ 2.67
SLC27A1-202ENST00000593701 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.73■■■□□ 2.67
SLC27A1-202ENST00000593701 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.73■■■□□ 2.67
SLC27A1-202ENST00000593701 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.73■■■□□ 2.67
SLC27A1-202ENST00000593701 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.71■■■□□ 2.67
SLC27A1-202ENST00000593701 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
SLC27A1-202ENST00000593701 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.67■■■□□ 2.66
SLC27A1-202ENST00000593701 PLXNC1O60486 1568 aa31.67■■■□□ 2.66
SLC27A1-202ENST00000593701 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
SLC27A1-202ENST00000593701 MROH2AA6NES4 1674 aa31.67■■■□□ 2.66
SLC27A1-202ENST00000593701 ZMYM3Q14202 1370 aa31.66■■■□□ 2.66
SLC27A1-202ENST00000593701 A2MP01023 1474 aa31.65■■■□□ 2.66
SLC27A1-202ENST00000593701 TIAM1Q13009 1591 aa31.65■■■□□ 2.66
SLC27A1-202ENST00000593701 PTPRTO14522 1441 aa31.65■■■□□ 2.66
SLC27A1-202ENST00000593701 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.65
SLC27A1-202ENST00000593701 NCOA1Q15788 1441 aa31.62■■■□□ 2.65
SLC27A1-202ENST00000593701 NPATQ14207 1427 aa31.61■■■□□ 2.65
SLC27A1-202ENST00000593701 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.6■■■□□ 2.65
SLC27A1-202ENST00000593701 GGT6Q6P531 493 aa31.59■■■□□ 2.65
SLC27A1-202ENST00000593701 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.58■■■□□ 2.65
SLC27A1-202ENST00000593701 MBD5Q9P267 1494 aa31.57■■■□□ 2.64
SLC27A1-202ENST00000593701 CEP162Q5TB80 1403 aa31.57■■■□□ 2.64
SLC27A1-202ENST00000593701 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.55■■■□□ 2.64
SLC27A1-202ENST00000593701 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.53■■■□□ 2.64
SLC27A1-202ENST00000593701 PTPRKQ15262 1439 aa31.51■■■□□ 2.64
SLC27A1-202ENST00000593701 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.51■■■□□ 2.63
SLC27A1-202ENST00000593701 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.5■■■□□ 2.63
SLC27A1-202ENST00000593701 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
SLC27A1-202ENST00000593701 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
SLC27A1-202ENST00000593701 NCOA2Q15596 1464 aa31.44■■■□□ 2.62
SLC27A1-202ENST00000593701 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.43■■■□□ 2.62
SLC27A1-202ENST00000593701 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
SLC27A1-202ENST00000593701 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.4■■■□□ 2.62
SLC27A1-202ENST00000593701 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
SLC27A1-202ENST00000593701 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.39■■■□□ 2.62
SLC27A1-202ENST00000593701 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.38■■■□□ 2.61
SLC27A1-202ENST00000593701 PLA2R1Q13018 1463 aa31.38■■■□□ 2.61
SLC27A1-202ENST00000593701 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
SLC27A1-202ENST00000593701 KIF3BO15066 747 aa31.35■■■□□ 2.61
SLC27A1-202ENST00000593701 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.33■■■□□ 2.61
SLC27A1-202ENST00000593701 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.33■■■□□ 2.61
SLC27A1-202ENST00000593701 PKD2Q13563 968 aa31.32■■■□□ 2.6
SLC27A1-202ENST00000593701 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
SLC27A1-202ENST00000593701 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.3■■■□□ 2.6
SLC27A1-202ENST00000593701 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms