RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593701.5

SLC27A1-202, Transcript of solute carrier family 27 member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SLC27A1, Length 688 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1-202ENST00000593701 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.44■■■■■ 5.51
SLC27A1-202ENST00000593701 ABCC9O60706 1549 aa44.64■■■■■ 4.74
SLC27A1-202ENST00000593701 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.36■■■■■ 4.69
SLC27A1-202ENST00000593701 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.31■■■■■ 4.36
SLC27A1-202ENST00000593701 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.03■■■■■ 4.32
SLC27A1-202ENST00000593701 NACADO15069 1562 aa41.97■■■■■ 4.31
SLC27A1-202ENST00000593701 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.86■■■■■ 4.29
SLC27A1-202ENST00000593701 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.56■■■■■ 4.24
SLC27A1-202ENST00000593701 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.44■■■■■ 4.22
SLC27A1-202ENST00000593701 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.3■■■■■ 4.2
SLC27A1-202ENST00000593701 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.17■■■■■ 4.18
SLC27A1-202ENST00000593701 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
SLC27A1-202ENST00000593701 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.76■■■■■ 4.12
SLC27A1-202ENST00000593701 SCRIBQ14160 1630 aa40.54■■■■■ 4.08
SLC27A1-202ENST00000593701 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.44■■■■■ 4.06
SLC27A1-202ENST00000593701 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.27■■■■■ 4.04
SLC27A1-202ENST00000593701 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.17■■■■■ 4.02
SLC27A1-202ENST00000593701 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
SLC27A1-202ENST00000593701 NCAPD3P42695 1498 aa38.78■■■■□ 3.8
SLC27A1-202ENST00000593701 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.68■■■■□ 3.78
SLC27A1-202ENST00000593701 SMARCA4P51532 1647 aa38.61■■■■□ 3.77
SLC27A1-202ENST00000593701 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.58■■■■□ 3.77
SLC27A1-202ENST00000593701 SMARCA2P51531 1590 aa38.51■■■■□ 3.76
SLC27A1-202ENST00000593701 ERCC6Q03468 1493 aa38.49■■■■□ 3.75
SLC27A1-202ENST00000593701 HMGXB3Q12766 1538 aa38.48■■■■□ 3.75
SLC27A1-202ENST00000593701 CUX2O14529 1486 aa38.41■■■■□ 3.74
SLC27A1-202ENST00000593701 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
SLC27A1-202ENST00000593701 NESP48681 1621 aa38.33■■■■□ 3.73
SLC27A1-202ENST00000593701 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
SLC27A1-202ENST00000593701 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.19■■■■□ 3.7
SLC27A1-202ENST00000593701 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.15■■■■□ 3.7
SLC27A1-202ENST00000593701 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.92■■■■□ 3.66
SLC27A1-202ENST00000593701 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
SLC27A1-202ENST00000593701 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.79■■■■□ 3.64
SLC27A1-202ENST00000593701 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.7■■■■□ 3.62
SLC27A1-202ENST00000593701 WIZO95785 1651 aa37.69■■■■□ 3.62
SLC27A1-202ENST00000593701 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.61■■■■□ 3.61
SLC27A1-202ENST00000593701 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.42■■■■□ 3.58
SLC27A1-202ENST00000593701 WDR62O43379 1518 aa37.33■■■■□ 3.57
SLC27A1-202ENST00000593701 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
SLC27A1-202ENST00000593701 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.25■■■■□ 3.55
SLC27A1-202ENST00000593701 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.21■■■■□ 3.55
SLC27A1-202ENST00000593701 CFTRP13569 1480 aa37.15■■■■□ 3.54
SLC27A1-202ENST00000593701 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
SLC27A1-202ENST00000593701 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.5
SLC27A1-202ENST00000593701 TRIM41Q8WV44 630 aa36.92■■■■□ 3.5
SLC27A1-202ENST00000593701 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.76■■■■□ 3.48
SLC27A1-202ENST00000593701 PRDM2Q13029 1718 aa36.75■■■■□ 3.47
SLC27A1-202ENST00000593701 OSCARQ8IYS5 282 aa36.65■■■■□ 3.46
SLC27A1-202ENST00000593701 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
SLC27A1-202ENST00000593701 TOPBP1Q92547 1522 aa36.49■■■■□ 3.43
SLC27A1-202ENST00000593701 IFT140Q96RY7 1462 aa36.48■■■■□ 3.43
SLC27A1-202ENST00000593701 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.32■■■■□ 3.41
SLC27A1-202ENST00000593701 ABCC8Q09428 1581 aa36.3■■■■□ 3.4
SLC27A1-202ENST00000593701 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
SLC27A1-202ENST00000593701 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.26■■■■□ 3.39
SLC27A1-202ENST00000593701 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.26■■■■□ 3.39
SLC27A1-202ENST00000593701 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.26■■■■□ 3.39
SLC27A1-202ENST00000593701 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
SLC27A1-202ENST00000593701 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.38
SLC27A1-202ENST00000593701 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
SLC27A1-202ENST00000593701 ARHGEF11O15085 1522 aa36.12■■■■□ 3.37
SLC27A1-202ENST00000593701 CHD1O14646 1710 aa36.05■■■■□ 3.36
SLC27A1-202ENST00000593701 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.04■■■■□ 3.36
SLC27A1-202ENST00000593701 FBLN2P98095 1184 aa35.95■■■■□ 3.35
SLC27A1-202ENST00000593701 SOGA1O94964 1423 aa35.93■■■■□ 3.34
SLC27A1-202ENST00000593701 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
SLC27A1-202ENST00000593701 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.88■■■■□ 3.33
SLC27A1-202ENST00000593701 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.88■■■■□ 3.33
SLC27A1-202ENST00000593701 CUX1P39880 1505 aa35.85■■■■□ 3.33
SLC27A1-202ENST00000593701 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.79■■■■□ 3.32
SLC27A1-202ENST00000593701 ARAP1Q96P48 1450 aa35.78■■■■□ 3.32
SLC27A1-202ENST00000593701 WDR97A6NE52 1622 aa35.69■■■■□ 3.3
SLC27A1-202ENST00000593701 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.62■■■■□ 3.29
SLC27A1-202ENST00000593701 GRIN2BQ13224 1484 aa35.61■■■■□ 3.29
SLC27A1-202ENST00000593701 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
SLC27A1-202ENST00000593701 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
SLC27A1-202ENST00000593701 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
SLC27A1-202ENST00000593701 SYNJ1O43426 1573 aa35.54■■■■□ 3.28
SLC27A1-202ENST00000593701 SYNJ2O15056 1496 aa35.52■■■■□ 3.28
SLC27A1-202ENST00000593701 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
SLC27A1-202ENST00000593701 PBRM1Q86U86 1689 aa35.51■■■■□ 3.28
SLC27A1-202ENST00000593701 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.49■■■■□ 3.27
SLC27A1-202ENST00000593701 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.42■■■■□ 3.26
SLC27A1-202ENST00000593701 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.41■■■■□ 3.26
SLC27A1-202ENST00000593701 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.23■■■■□ 3.23
SLC27A1-202ENST00000593701 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.19■■■■□ 3.22
SLC27A1-202ENST00000593701 TOP2BQ02880 1626 aa35.18■■■■□ 3.22
SLC27A1-202ENST00000593701 GRIN2AQ12879 1464 aa35.18■■■■□ 3.22
SLC27A1-202ENST00000593701 ADAMTS12P58397 1594 aa35.16■■■■□ 3.22
SLC27A1-202ENST00000593701 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.13■■■■□ 3.21
SLC27A1-202ENST00000593701 CEP170Q5SW79 1584 aa35.11■■■■□ 3.21
SLC27A1-202ENST00000593701 NUP160Q12769 1436 aa35.06■■■■□ 3.2
SLC27A1-202ENST00000593701 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.02■■■■□ 3.2
SLC27A1-202ENST00000593701 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.96■■■■□ 3.19
SLC27A1-202ENST00000593701 SHROOM2Q13796 1616 aa34.92■■■■□ 3.18
SLC27A1-202ENST00000593701 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
SLC27A1-202ENST00000593701 JPH4Q96JJ6 628 aa34.71■■■■□ 3.15
SLC27A1-202ENST00000593701 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.67■■■■□ 3.14
SLC27A1-202ENST00000593701 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.54■■■■□ 3.12
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