RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592863.2

POLRMT-208, Transcript of RNA polymerase mitochondrial, human

TSL 5

Gene POLRMT, Length 966 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLRMT-208	ENST00000592863	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.84	■■■□□ 2.85
POLRMT-208	ENST00000592863	KIF14	Q15058	1648 aa		32.84	■■■□□ 2.85
POLRMT-208	ENST00000592863	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.83	■■■□□ 2.85
POLRMT-208	ENST00000592863	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.82	■■■□□ 2.84
POLRMT-208	ENST00000592863	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
POLRMT-208	ENST00000592863	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.78	■■■□□ 2.84
POLRMT-208	ENST00000592863	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.77	■■■□□ 2.84
POLRMT-208	ENST00000592863	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.76	■■■□□ 2.84
POLRMT-208	ENST00000592863	CLIP1	P30622	1438 aa		32.74	■■■□□ 2.83
POLRMT-208	ENST00000592863	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
POLRMT-208	ENST00000592863	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.72	■■■□□ 2.83
POLRMT-208	ENST00000592863	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.71	■■■□□ 2.83
POLRMT-208	ENST00000592863	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.71	■■■□□ 2.83
POLRMT-208	ENST00000592863	MLEC	Q14165	292 aa		32.68	■■■□□ 2.82
POLRMT-208	ENST00000592863	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.67	■■■□□ 2.82
POLRMT-208	ENST00000592863	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.66	■■■□□ 2.82
POLRMT-208	ENST00000592863	ATP10A	O60312	1499 aa		32.65	■■■□□ 2.82
POLRMT-208	ENST00000592863	KDM5C	P41229	1560 aa		32.61	■■■□□ 2.81
POLRMT-208	ENST00000592863	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.6	■■■□□ 2.81
POLRMT-208	ENST00000592863	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.6	■■■□□ 2.81
POLRMT-208	ENST00000592863	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.6	■■■□□ 2.81
POLRMT-208	ENST00000592863	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.59	■■■□□ 2.81
POLRMT-208	ENST00000592863	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.57	■■■□□ 2.8
POLRMT-208	ENST00000592863	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.56	■■■□□ 2.8
POLRMT-208	ENST00000592863	HSPA2	P54652	639 aa		32.55	■■■□□ 2.8
POLRMT-208	ENST00000592863	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.53	■■■□□ 2.8
POLRMT-208	ENST00000592863	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.53	■■■□□ 2.8
POLRMT-208	ENST00000592863	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.51	■■■□□ 2.79
POLRMT-208	ENST00000592863	ABCC1	P33527	1531 aa		32.5	■■■□□ 2.79
POLRMT-208	ENST00000592863	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.5	■■■□□ 2.79
POLRMT-208	ENST00000592863	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.5	■■■□□ 2.79
POLRMT-208	ENST00000592863	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.49	■■■□□ 2.79
POLRMT-208	ENST00000592863	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.48	■■■□□ 2.79
POLRMT-208	ENST00000592863	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.46	■■■□□ 2.79
POLRMT-208	ENST00000592863	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.45	■■■□□ 2.79
POLRMT-208	ENST00000592863	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.42	■■■□□ 2.78
POLRMT-208	ENST00000592863	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.4	■■■□□ 2.78
POLRMT-208	ENST00000592863	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
POLRMT-208	ENST00000592863	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.34	■■■□□ 2.77
POLRMT-208	ENST00000592863	AGL	P35573	1532 aa		32.32	■■■□□ 2.76
POLRMT-208	ENST00000592863	C3	P01024	1663 aa		32.31	■■■□□ 2.76
POLRMT-208	ENST00000592863	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.31	■■■□□ 2.76
POLRMT-208	ENST00000592863	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.3	■■■□□ 2.76
POLRMT-208	ENST00000592863	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.29	■■■□□ 2.76
POLRMT-208	ENST00000592863	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
POLRMT-208	ENST00000592863	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
POLRMT-208	ENST00000592863	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
POLRMT-208	ENST00000592863	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
POLRMT-208	ENST00000592863	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.22	■■■□□ 2.75
POLRMT-208	ENST00000592863	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.18	■■■□□ 2.74
POLRMT-208	ENST00000592863	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.17	■■■□□ 2.74
POLRMT-208	ENST00000592863	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
POLRMT-208	ENST00000592863	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.16	■■■□□ 2.74
POLRMT-208	ENST00000592863	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
POLRMT-208	ENST00000592863	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.16	■■■□□ 2.74
POLRMT-208	ENST00000592863	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.16	■■■□□ 2.74
POLRMT-208	ENST00000592863	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.15	■■■□□ 2.74
POLRMT-208	ENST00000592863	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
POLRMT-208	ENST00000592863	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.13	■■■□□ 2.73
POLRMT-208	ENST00000592863	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.12	■■■□□ 2.73
POLRMT-208	ENST00000592863	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
POLRMT-208	ENST00000592863	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.12	■■■□□ 2.73
POLRMT-208	ENST00000592863	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.1	■■■□□ 2.73
POLRMT-208	ENST00000592863	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.08	■■■□□ 2.73
POLRMT-208	ENST00000592863	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.07	■■■□□ 2.72
POLRMT-208	ENST00000592863	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.07	■■■□□ 2.72
POLRMT-208	ENST00000592863	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
POLRMT-208	ENST00000592863	A2M	P01023	1474 aa		32.03	■■■□□ 2.72
POLRMT-208	ENST00000592863	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.02	■■■□□ 2.72
POLRMT-208	ENST00000592863	NPAT	Q14207	1427 aa		32	■■■□□ 2.71
POLRMT-208	ENST00000592863	PTPRT	O14522	1441 aa		32	■■■□□ 2.71
POLRMT-208	ENST00000592863	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.99	■■■□□ 2.71
POLRMT-208	ENST00000592863	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.97	■■■□□ 2.71
POLRMT-208	ENST00000592863	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.96	■■■□□ 2.71
POLRMT-208	ENST00000592863	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.94	■■■□□ 2.7
POLRMT-208	ENST00000592863	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.94	■■■□□ 2.7
POLRMT-208	ENST00000592863	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
POLRMT-208	ENST00000592863	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
POLRMT-208	ENST00000592863	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.9	■■■□□ 2.7
POLRMT-208	ENST00000592863	GGT6	Q6P531	493 aa		31.89	■■■□□ 2.7
POLRMT-208	ENST00000592863	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
POLRMT-208	ENST00000592863	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.84	■■■□□ 2.69
POLRMT-208	ENST00000592863	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		31.84	■■■□□ 2.69
POLRMT-208	ENST00000592863	NCOA2	Q15596	1464 aa		31.84	■■■□□ 2.69
POLRMT-208	ENST00000592863	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.83	■■■□□ 2.69
POLRMT-208	ENST00000592863	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.83	■■■□□ 2.69
POLRMT-208	ENST00000592863	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.81	■■■□□ 2.68
POLRMT-208	ENST00000592863	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.77	■■■□□ 2.68
POLRMT-208	ENST00000592863	PLA2R1	Q13018	1463 aa		31.77	■■■□□ 2.68
POLRMT-208	ENST00000592863	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
POLRMT-208	ENST00000592863	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		31.75	■■■□□ 2.67
POLRMT-208	ENST00000592863	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		31.75	■■■□□ 2.67
POLRMT-208	ENST00000592863	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		31.71	■■■□□ 2.67
POLRMT-208	ENST00000592863	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.66
POLRMT-208	ENST00000592863	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.69	■■■□□ 2.66
POLRMT-208	ENST00000592863	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		31.69	■■■□□ 2.66
POLRMT-208	ENST00000592863	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		31.68	■■■□□ 2.66
POLRMT-208	ENST00000592863	PKD2	Q13563	968 aa		31.68	■■■□□ 2.66
POLRMT-208	ENST00000592863	KIF3B	O15066	747 aa		31.67	■■■□□ 2.66
POLRMT-208	ENST00000592863	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms