RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590720.5

PSME3-210, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 998 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-210ENST00000590720 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.14■■■□□ 2.9
PSME3-210ENST00000590720 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.14■■■□□ 2.9
PSME3-210ENST00000590720 PTPRMP28827 1452 aa33.13■■■□□ 2.89
PSME3-210ENST00000590720 MADDQ8WXG6 1647 aa33.13■■■□□ 2.89
PSME3-210ENST00000590720 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.12■■■□□ 2.89
PSME3-210ENST00000590720 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.12■■■□□ 2.89
PSME3-210ENST00000590720 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.11■■■□□ 2.89
PSME3-210ENST00000590720 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.09■■■□□ 2.89
PSME3-210ENST00000590720 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.07■■■□□ 2.88
PSME3-210ENST00000590720 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa33.06■■■□□ 2.88
PSME3-210ENST00000590720 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.05■■■□□ 2.88
PSME3-210ENST00000590720 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.87
PSME3-210ENST00000590720 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33■■■□□ 2.87
PSME3-210ENST00000590720 PREX2Q70Z35 1606 aa32.99■■■□□ 2.87
PSME3-210ENST00000590720 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.98■■■□□ 2.87
PSME3-210ENST00000590720 KDM5CP41229 1560 aa32.95■■■□□ 2.86
PSME3-210ENST00000590720 ATP10AO60312 1499 aa32.93■■■□□ 2.86
PSME3-210ENST00000590720 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.92■■■□□ 2.86
PSME3-210ENST00000590720 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.88■■■□□ 2.85
PSME3-210ENST00000590720 ABCC1P33527 1531 aa32.88■■■□□ 2.85
PSME3-210ENST00000590720 AFAP1Q8N556 730 aa32.87■■■□□ 2.85
PSME3-210ENST00000590720 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.86■■■□□ 2.85
PSME3-210ENST00000590720 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.85■■■□□ 2.85
PSME3-210ENST00000590720 MLECQ14165 292 aa32.84■■■□□ 2.85
PSME3-210ENST00000590720 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.82■■■□□ 2.85
PSME3-210ENST00000590720 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.82■■■□□ 2.84
PSME3-210ENST00000590720 LMTK3Q96Q04 1460 aa32.81■■■□□ 2.84
PSME3-210ENST00000590720 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.79■■■□□ 2.84
PSME3-210ENST00000590720 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.79■■■□□ 2.84
PSME3-210ENST00000590720 ABCA6Q8N139 1617 aa32.78■■■□□ 2.84
PSME3-210ENST00000590720 REREQ9P2R6 1566 aa32.76■■■□□ 2.84
PSME3-210ENST00000590720 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.76■■■□□ 2.83
PSME3-210ENST00000590720 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
PSME3-210ENST00000590720 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.74■■■□□ 2.83
PSME3-210ENST00000590720 CEP162Q5TB80 1403 aa32.74■■■□□ 2.83
PSME3-210ENST00000590720 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.74■■■□□ 2.83
PSME3-210ENST00000590720 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.72■■■□□ 2.83
PSME3-210ENST00000590720 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.69■■■□□ 2.82
PSME3-210ENST00000590720 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.68■■■□□ 2.82
PSME3-210ENST00000590720 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.68■■■□□ 2.82
PSME3-210ENST00000590720 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
PSME3-210ENST00000590720 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.64■■■□□ 2.82
PSME3-210ENST00000590720 AGLP35573 1532 aa32.63■■■□□ 2.81
PSME3-210ENST00000590720 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.63■■■□□ 2.81
PSME3-210ENST00000590720 TIAM1Q13009 1591 aa32.59■■■□□ 2.81
PSME3-210ENST00000590720 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
PSME3-210ENST00000590720 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.59■■■□□ 2.81
PSME3-210ENST00000590720 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.58■■■□□ 2.81
PSME3-210ENST00000590720 HSPA2P54652 639 aa32.57■■■□□ 2.8
PSME3-210ENST00000590720 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.56■■■□□ 2.8
PSME3-210ENST00000590720 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.56■■■□□ 2.8
PSME3-210ENST00000590720 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
PSME3-210ENST00000590720 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
PSME3-210ENST00000590720 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
PSME3-210ENST00000590720 ATP7AQ04656 1500 aa32.52■■■□□ 2.8
PSME3-210ENST00000590720 C3P01024 1663 aa32.49■■■□□ 2.79
PSME3-210ENST00000590720 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
PSME3-210ENST00000590720 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
PSME3-210ENST00000590720 PLXNC1O60486 1568 aa32.43■■■□□ 2.78
PSME3-210ENST00000590720 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.42■■■□□ 2.78
PSME3-210ENST00000590720 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
PSME3-210ENST00000590720 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.41■■■□□ 2.78
PSME3-210ENST00000590720 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.41■■■□□ 2.78
PSME3-210ENST00000590720 NCOA2Q15596 1464 aa32.41■■■□□ 2.78
PSME3-210ENST00000590720 MBD5Q9P267 1494 aa32.4■■■□□ 2.78
PSME3-210ENST00000590720 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.39■■■□□ 2.78
PSME3-210ENST00000590720 A2MP01023 1474 aa32.39■■■□□ 2.78
PSME3-210ENST00000590720 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
PSME3-210ENST00000590720 MROH2AA6NES4 1674 aa32.36■■■□□ 2.77
PSME3-210ENST00000590720 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.36■■■□□ 2.77
PSME3-210ENST00000590720 FBXO41Q8TF61 875 aa32.33■■■□□ 2.77
PSME3-210ENST00000590720 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa32.31■■■□□ 2.76
PSME3-210ENST00000590720 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.29■■■□□ 2.76
PSME3-210ENST00000590720 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
PSME3-210ENST00000590720 STRCQ7RTU9 1775 aa32.28■■■□□ 2.76
PSME3-210ENST00000590720 CCDC141Q6ZP82 1450 aa32.28■■■□□ 2.76
PSME3-210ENST00000590720 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.28■■■□□ 2.76
PSME3-210ENST00000590720 ZMYM3Q14202 1370 aa32.24■■■□□ 2.75
PSME3-210ENST00000590720 NPATQ14207 1427 aa32.24■■■□□ 2.75
PSME3-210ENST00000590720 MAP3K1Q13233 1512 aa32.21■■■□□ 2.75
PSME3-210ENST00000590720 GGT6Q6P531 493 aa32.21■■■□□ 2.75
PSME3-210ENST00000590720 ARHGEF5Q12774 1597 aa32.19■■■□□ 2.74
PSME3-210ENST00000590720 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
PSME3-210ENST00000590720 RSPH4AQ5TD94 716 aa32.16■■■□□ 2.74
PSME3-210ENST00000590720 DMRT2Q9Y5R5 561 aa32.15■■■□□ 2.74
PSME3-210ENST00000590720 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
PSME3-210ENST00000590720 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.13■■■□□ 2.73
PSME3-210ENST00000590720 MYO3AQ8NEV4 1616 aa32.11■■■□□ 2.73
PSME3-210ENST00000590720 PTPRKQ15262 1439 aa32.11■■■□□ 2.73
PSME3-210ENST00000590720 CERKQ8TCT0 537 aa32.11■■■□□ 2.73
PSME3-210ENST00000590720 NCOA1Q15788 1441 aa32.1■■■□□ 2.73
PSME3-210ENST00000590720 PTPRTO14522 1441 aa32.09■■■□□ 2.73
PSME3-210ENST00000590720 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
PSME3-210ENST00000590720 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa32.08■■■□□ 2.73
PSME3-210ENST00000590720 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.06■■■□□ 2.72
PSME3-210ENST00000590720 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.04■■■□□ 2.72
PSME3-210ENST00000590720 MIA2Q96PC5 1412 aa32.04■■■□□ 2.72
PSME3-210ENST00000590720 KIF3BO15066 747 aa32.04■■■□□ 2.72
PSME3-210ENST00000590720 TSPY4P0CV99 314 aa32.04■■■□□ 2.72
PSME3-210ENST00000590720 TSPY10P0CW01 314 aa32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms