RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589070.1

SEPT9-222, Transcript of septin 9, human

TSL 3

Gene SEPT9, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEPT9-222	ENST00000589070	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		29.82	■■■□□ 2.36
SEPT9-222	ENST00000589070	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		29.82	■■■□□ 2.36
SEPT9-222	ENST00000589070	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		29.8	■■■□□ 2.36
SEPT9-222	ENST00000589070	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		29.8	■■■□□ 2.36
SEPT9-222	ENST00000589070	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SEPT9-222	ENST00000589070	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SEPT9-222	ENST00000589070	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		29.77	■■■□□ 2.36
SEPT9-222	ENST00000589070	PTPRM	P28827	1452 aa		29.74	■■■□□ 2.35
SEPT9-222	ENST00000589070	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		29.73	■■■□□ 2.35
SEPT9-222	ENST00000589070	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		29.72	■■■□□ 2.35
SEPT9-222	ENST00000589070	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		29.7	■■■□□ 2.35
SEPT9-222	ENST00000589070	AFAP1	Q8N556	730 aa		29.69	■■■□□ 2.34
SEPT9-222	ENST00000589070	MADD	Q8WXG6	1647 aa		29.68	■■■□□ 2.34
SEPT9-222	ENST00000589070	PREX2	Q70Z35	1606 aa		29.67	■■■□□ 2.34
SEPT9-222	ENST00000589070	ATP10A	O60312	1499 aa		29.67	■■■□□ 2.34
SEPT9-222	ENST00000589070	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		29.64	■■■□□ 2.34
SEPT9-222	ENST00000589070	CEP162	Q5TB80	1403 aa		29.63	■■■□□ 2.33
SEPT9-222	ENST00000589070	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		29.62	■■■□□ 2.33
SEPT9-222	ENST00000589070	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		29.62	■■■□□ 2.33
SEPT9-222	ENST00000589070	KDM5C	P41229	1560 aa		29.61	■■■□□ 2.33
SEPT9-222	ENST00000589070	MLEC	Q14165	292 aa		29.61	■■■□□ 2.33
SEPT9-222	ENST00000589070	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		29.61	■■■□□ 2.33
SEPT9-222	ENST00000589070	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	29.59	■■■□□ 2.33
SEPT9-222	ENST00000589070	ABCC1	P33527	1531 aa		29.57	■■■□□ 2.32
SEPT9-222	ENST00000589070	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		29.57	■■■□□ 2.32
SEPT9-222	ENST00000589070	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	29.57	■■■□□ 2.32
SEPT9-222	ENST00000589070	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		29.56	■■■□□ 2.32
SEPT9-222	ENST00000589070	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	29.55	■■■□□ 2.32
SEPT9-222	ENST00000589070	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		29.55	■■■□□ 2.32
SEPT9-222	ENST00000589070	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		29.55	■■■□□ 2.32
SEPT9-222	ENST00000589070	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		29.54	■■■□□ 2.32
SEPT9-222	ENST00000589070	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		29.53	■■■□□ 2.32
SEPT9-222	ENST00000589070	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		29.52	■■■□□ 2.32
SEPT9-222	ENST00000589070	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	29.51	■■■□□ 2.31
SEPT9-222	ENST00000589070	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		29.49	■■■□□ 2.31
SEPT9-222	ENST00000589070	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		29.48	■■■□□ 2.31
SEPT9-222	ENST00000589070	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		29.47	■■■□□ 2.31
SEPT9-222	ENST00000589070	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		29.47	■■■□□ 2.31
SEPT9-222	ENST00000589070	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	29.46	■■■□□ 2.31	2e-13	■■■■■ 44.7
SEPT9-222	ENST00000589070	RERE	Q9P2R6	1566 aa		29.44	■■■□□ 2.3
SEPT9-222	ENST00000589070	ABCA6	Q8N139	1617 aa		29.44	■■■□□ 2.3
SEPT9-222	ENST00000589070	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		29.43	■■■□□ 2.3
SEPT9-222	ENST00000589070	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		29.42	■■■□□ 2.3
SEPT9-222	ENST00000589070	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		29.42	■■■□□ 2.3
SEPT9-222	ENST00000589070	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		29.41	■■■□□ 2.3
SEPT9-222	ENST00000589070	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		29.41	■■■□□ 2.3
SEPT9-222	ENST00000589070	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	29.4	■■■□□ 2.3
SEPT9-222	ENST00000589070	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		29.39	■■■□□ 2.3
SEPT9-222	ENST00000589070	AGL	P35573	1532 aa		29.37	■■■□□ 2.29
SEPT9-222	ENST00000589070	TIAM1	Q13009	1591 aa		29.35	■■■□□ 2.29
SEPT9-222	ENST00000589070	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	29.33	■■■□□ 2.29
SEPT9-222	ENST00000589070	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
SEPT9-222	ENST00000589070	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		29.32	■■■□□ 2.28
SEPT9-222	ENST00000589070	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	29.32	■■■□□ 2.28
SEPT9-222	ENST00000589070	HSPA2	P54652	639 aa		29.29	■■■□□ 2.28
SEPT9-222	ENST00000589070	ATP7A	Q04656	1500 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SEPT9-222	ENST00000589070	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
SEPT9-222	ENST00000589070	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
SEPT9-222	ENST00000589070	NCOA2	Q15596	1464 aa		29.27	■■■□□ 2.28
SEPT9-222	ENST00000589070	MBD5	Q9P267	1494 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SEPT9-222	ENST00000589070	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
SEPT9-222	ENST00000589070	A2M	P01023	1474 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SEPT9-222	ENST00000589070	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SEPT9-222	ENST00000589070	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SEPT9-222	ENST00000589070	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
SEPT9-222	ENST00000589070	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SEPT9-222	ENST00000589070	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SEPT9-222	ENST00000589070	C3	P01024	1663 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SEPT9-222	ENST00000589070	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SEPT9-222	ENST00000589070	MAP3K1	Q13233	1512 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SEPT9-222	ENST00000589070	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
SEPT9-222	ENST00000589070	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SEPT9-222	ENST00000589070	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SEPT9-222	ENST00000589070	PLXNC1	O60486	1568 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SEPT9-222	ENST00000589070	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SEPT9-222	ENST00000589070	GGT6	Q6P531	493 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SEPT9-222	ENST00000589070	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SEPT9-222	ENST00000589070	ZMYM3	Q14202	1370 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SEPT9-222	ENST00000589070	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SEPT9-222	ENST00000589070	MROH2A	A6NES4	1674 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SEPT9-222	ENST00000589070	TSPY4	P0CV99	314 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SEPT9-222	ENST00000589070	TSPY10	P0CW01	314 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SEPT9-222	ENST00000589070	APLP2	Q06481	763 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SEPT9-222	ENST00000589070	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
SEPT9-222	ENST00000589070	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SEPT9-222	ENST00000589070	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SEPT9-222	ENST00000589070	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
SEPT9-222	ENST00000589070	NPAT	Q14207	1427 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SEPT9-222	ENST00000589070	FBXO41	Q8TF61	875 aa		29	■■■□□ 2.23
SEPT9-222	ENST00000589070	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SEPT9-222	ENST00000589070	MIA2	Q96PC5	1412 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SEPT9-222	ENST00000589070	KIF3B	O15066	747 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SEPT9-222	ENST00000589070	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SEPT9-222	ENST00000589070	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SEPT9-222	ENST00000589070	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SEPT9-222	ENST00000589070	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SEPT9-222	ENST00000589070	CERK	Q8TCT0	537 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SEPT9-222	ENST00000589070	PTPRT	O14522	1441 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SEPT9-222	ENST00000589070	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SEPT9-222	ENST00000589070	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.82	■■■□□ 2.2

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