RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583689.5

NAT9-223, Transcript of N-acetyltransferase 9 (putative), human

TSL 2

Gene NAT9, Length 563 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NAT9-223	ENST00000583689	PTPRM	P28827	1452 aa		27.99	■■■□□ 2.07
NAT9-223	ENST00000583689	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		27.98	■■■□□ 2.07
NAT9-223	ENST00000583689	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		27.97	■■■□□ 2.07
NAT9-223	ENST00000583689	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		27.96	■■■□□ 2.07
NAT9-223	ENST00000583689	CEP162	Q5TB80	1403 aa		27.95	■■■□□ 2.07
NAT9-223	ENST00000583689	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		27.95	■■■□□ 2.06
NAT9-223	ENST00000583689	MADD	Q8WXG6	1647 aa		27.94	■■■□□ 2.06
NAT9-223	ENST00000583689	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		27.94	■■■□□ 2.06
NAT9-223	ENST00000583689	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		27.92	■■■□□ 2.06
NAT9-223	ENST00000583689	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		27.92	■■■□□ 2.06
NAT9-223	ENST00000583689	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		27.91	■■■□□ 2.06
NAT9-223	ENST00000583689	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		27.91	■■■□□ 2.06
NAT9-223	ENST00000583689	PREX2	Q70Z35	1606 aa		27.89	■■■□□ 2.05
NAT9-223	ENST00000583689	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NAT9-223	ENST00000583689	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
NAT9-223	ENST00000583689	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NAT9-223	ENST00000583689	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NAT9-223	ENST00000583689	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NAT9-223	ENST00000583689	ATP10A	O60312	1499 aa		27.79	■■■□□ 2.04
NAT9-223	ENST00000583689	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
NAT9-223	ENST00000583689	KDM5C	P41229	1560 aa		27.78	■■■□□ 2.04
NAT9-223	ENST00000583689	MLEC	Q14165	292 aa		27.78	■■■□□ 2.04
NAT9-223	ENST00000583689	ABCC1	P33527	1531 aa		27.77	■■■□□ 2.04
NAT9-223	ENST00000583689	AFAP1	Q8N556	730 aa		27.77	■■■□□ 2.04
NAT9-223	ENST00000583689	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		27.77	■■■□□ 2.04
NAT9-223	ENST00000583689	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
NAT9-223	ENST00000583689	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		27.75	■■■□□ 2.03
NAT9-223	ENST00000583689	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		27.74	■■■□□ 2.03
NAT9-223	ENST00000583689	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		27.74	■■■□□ 2.03
NAT9-223	ENST00000583689	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		27.73	■■■□□ 2.03
NAT9-223	ENST00000583689	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		27.73	■■■□□ 2.03
NAT9-223	ENST00000583689	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		27.72	■■■□□ 2.03
NAT9-223	ENST00000583689	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		27.72	■■■□□ 2.03
NAT9-223	ENST00000583689	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		27.7	■■■□□ 2.03
NAT9-223	ENST00000583689	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		27.7	■■■□□ 2.03
NAT9-223	ENST00000583689	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		27.69	■■■□□ 2.02
NAT9-223	ENST00000583689	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		27.66	■■■□□ 2.02
NAT9-223	ENST00000583689	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
NAT9-223	ENST00000583689	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		27.65	■■■□□ 2.02
NAT9-223	ENST00000583689	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		27.65	■■■□□ 2.02
NAT9-223	ENST00000583689	ABCA6	Q8N139	1617 aa		27.64	■■■□□ 2.02
NAT9-223	ENST00000583689	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		27.64	■■■□□ 2.02
NAT9-223	ENST00000583689	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		27.63	■■■□□ 2.01
NAT9-223	ENST00000583689	TIAM1	Q13009	1591 aa		27.63	■■■□□ 2.01
NAT9-223	ENST00000583689	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
NAT9-223	ENST00000583689	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		27.59	■■■□□ 2.01
NAT9-223	ENST00000583689	RERE	Q9P2R6	1566 aa		27.59	■■■□□ 2.01
NAT9-223	ENST00000583689	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	27.57	■■■□□ 2
NAT9-223	ENST00000583689	HSPA2	P54652	639 aa		27.57	■■■□□ 2
NAT9-223	ENST00000583689	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		27.57	■■■□□ 2
NAT9-223	ENST00000583689	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		27.55	■■■□□ 2
NAT9-223	ENST00000583689	NCOA2	Q15596	1464 aa		27.53	■■■□□ 2
NAT9-223	ENST00000583689	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
NAT9-223	ENST00000583689	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
NAT9-223	ENST00000583689	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
NAT9-223	ENST00000583689	AGL	P35573	1532 aa		27.5	■■□□□ 1.99
NAT9-223	ENST00000583689	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
NAT9-223	ENST00000583689	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		27.48	■■□□□ 1.99
NAT9-223	ENST00000583689	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		27.48	■■□□□ 1.99
NAT9-223	ENST00000583689	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
NAT9-223	ENST00000583689	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
NAT9-223	ENST00000583689	ATP7A	Q04656	1500 aa		27.46	■■□□□ 1.99
NAT9-223	ENST00000583689	MBD5	Q9P267	1494 aa		27.45	■■□□□ 1.99
NAT9-223	ENST00000583689	MAP3K1	Q13233	1512 aa		27.45	■■□□□ 1.98
NAT9-223	ENST00000583689	FBXO41	Q8TF61	875 aa		27.43	■■□□□ 1.98
NAT9-223	ENST00000583689	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	27.42	■■□□□ 1.98
NAT9-223	ENST00000583689	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	27.42	■■□□□ 1.98
NAT9-223	ENST00000583689	C3	P01024	1663 aa		27.4	■■□□□ 1.98
NAT9-223	ENST00000583689	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		27.38	■■□□□ 1.97
NAT9-223	ENST00000583689	PLXNC1	O60486	1568 aa		27.37	■■□□□ 1.97
NAT9-223	ENST00000583689	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		27.37	■■□□□ 1.97
NAT9-223	ENST00000583689	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		27.35	■■□□□ 1.97
NAT9-223	ENST00000583689	A2M	P01023	1474 aa		27.35	■■□□□ 1.97
NAT9-223	ENST00000583689	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		27.32	■■□□□ 1.96
NAT9-223	ENST00000583689	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		27.32	■■□□□ 1.96
NAT9-223	ENST00000583689	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		27.31	■■□□□ 1.96
NAT9-223	ENST00000583689	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		27.27	■■□□□ 1.96
NAT9-223	ENST00000583689	MROH2A	A6NES4	1674 aa		27.27	■■□□□ 1.96
NAT9-223	ENST00000583689	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		27.26	■■□□□ 1.95
NAT9-223	ENST00000583689	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.25	■■□□□ 1.95
NAT9-223	ENST00000583689	STRC	Q7RTU9	1775 aa		27.25	■■□□□ 1.95
NAT9-223	ENST00000583689	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		27.25	■■□□□ 1.95
NAT9-223	ENST00000583689	ZMYM3	Q14202	1370 aa		27.22	■■□□□ 1.95
NAT9-223	ENST00000583689	APLP2	Q06481	763 aa		27.22	■■□□□ 1.95
NAT9-223	ENST00000583689	GGT6	Q6P531	493 aa		27.22	■■□□□ 1.95
NAT9-223	ENST00000583689	CERK	Q8TCT0	537 aa		27.22	■■□□□ 1.95
NAT9-223	ENST00000583689	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.22	■■□□□ 1.95
NAT9-223	ENST00000583689	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	27.21	■■□□□ 1.95
NAT9-223	ENST00000583689	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	27.21	■■□□□ 1.95
NAT9-223	ENST00000583689	NPAT	Q14207	1427 aa		27.2	■■□□□ 1.94
NAT9-223	ENST00000583689	TSPY4	P0CV99	314 aa		27.15	■■□□□ 1.94
NAT9-223	ENST00000583689	TSPY10	P0CW01	314 aa		27.15	■■□□□ 1.94
NAT9-223	ENST00000583689	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		27.15	■■□□□ 1.94
NAT9-223	ENST00000583689	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		27.14	■■□□□ 1.94
NAT9-223	ENST00000583689	PTPRT	O14522	1441 aa		27.11	■■□□□ 1.93
NAT9-223	ENST00000583689	KIF3B	O15066	747 aa		27.1	■■□□□ 1.93
NAT9-223	ENST00000583689	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.09	■■□□□ 1.93
NAT9-223	ENST00000583689	NCOA1	Q15788	1441 aa		27.09	■■□□□ 1.93
NAT9-223	ENST00000583689	PTPRK	Q15262	1439 aa		27.08	■■□□□ 1.93
NAT9-223	ENST00000583689	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		27.07	■■□□□ 1.92

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