RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 KIF14Q15058 1648 aa15.67■□□□□ 0.1
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GGA3-209ENST00000580646 TSPY10P0CW01 314 aa15.28■□□□□ 0.04
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GGA3-209ENST00000580646 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.25■□□□□ 0.03
GGA3-209ENST00000580646 ZMYM3Q14202 1370 aa15.24■□□□□ 0.03
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GGA3-209ENST00000580646 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
GGA3-209ENST00000580646 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.23■□□□□ 0.03
GGA3-209ENST00000580646 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.23■□□□□ 0.03
GGA3-209ENST00000580646 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
GGA3-209ENST00000580646 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.22■□□□□ 0.03
GGA3-209ENST00000580646 C3P01024 1663 aa15.21■□□□□ 0.03
GGA3-209ENST00000580646 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
GGA3-209ENST00000580646 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.2■□□□□ 0.02
GGA3-209ENST00000580646 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.2■□□□□ 0.02
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