RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
ATG13-223	ENST00000577256	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		28	■■■□□ 2.07
ATG13-223	ENST00000577256	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		27.99	■■■□□ 2.07
ATG13-223	ENST00000577256	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ATG13-223	ENST00000577256	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		27.97	■■■□□ 2.07
ATG13-223	ENST00000577256	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ATG13-223	ENST00000577256	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ATG13-223	ENST00000577256	TIAM1	Q13009	1591 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ATG13-223	ENST00000577256	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ATG13-223	ENST00000577256	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
ATG13-223	ENST00000577256	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ATG13-223	ENST00000577256	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ATG13-223	ENST00000577256	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		27.89	■■■□□ 2.05
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ATG13-223	ENST00000577256	MAP3K1	Q13233	1512 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ATG13-223	ENST00000577256	ABCC1	P33527	1531 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ATG13-223	ENST00000577256	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ATG13-223	ENST00000577256	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
ATG13-223	ENST00000577256	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
ATG13-223	ENST00000577256	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ATG13-223	ENST00000577256	KDM5C	P41229	1560 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ATG13-223	ENST00000577256	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
ATG13-223	ENST00000577256	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ATG13-223	ENST00000577256	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ATG13-223	ENST00000577256	NCOA2	Q15596	1464 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ATG13-223	ENST00000577256	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ATG13-223	ENST00000577256	AFAP1	Q8N556	730 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ATG13-223	ENST00000577256	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ATG13-223	ENST00000577256	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ATG13-223	ENST00000577256	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ATG13-223	ENST00000577256	APLP2	Q06481	763 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ATG13-223	ENST00000577256	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ATG13-223	ENST00000577256	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ATG13-223	ENST00000577256	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
ATG13-223	ENST00000577256	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ATG13-223	ENST00000577256	ATP10A	O60312	1499 aa		27.7	■■■□□ 2.03
ATG13-223	ENST00000577256	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
ATG13-223	ENST00000577256	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ATG13-223	ENST00000577256	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ATG13-223	ENST00000577256	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ATG13-223	ENST00000577256	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	27.67	■■■□□ 2.02
ATG13-223	ENST00000577256	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		27.66	■■■□□ 2.02
ATG13-223	ENST00000577256	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATG13-223	ENST00000577256	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
ATG13-223	ENST00000577256	ABCA6	Q8N139	1617 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ATG13-223	ENST00000577256	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ATG13-223	ENST00000577256	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
ATG13-223	ENST00000577256	RERE	Q9P2R6	1566 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ATG13-223	ENST00000577256	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATG13-223	ENST00000577256	MBD5	Q9P267	1494 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATG13-223	ENST00000577256	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.57	■■■□□ 2
ATG13-223	ENST00000577256	MADD	Q8WXG6	1647 aa		27.56	■■■□□ 2
ATG13-223	ENST00000577256	ATP7A	Q04656	1500 aa		27.56	■■■□□ 2
ATG13-223	ENST00000577256	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
ATG13-223	ENST00000577256	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.54	■■■□□ 2
ATG13-223	ENST00000577256	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		27.53	■■■□□ 2
ATG13-223	ENST00000577256	PTPRM	P28827	1452 aa		27.52	■■■□□ 2
ATG13-223	ENST00000577256	AGL	P35573	1532 aa		27.51	■■■□□ 2
ATG13-223	ENST00000577256	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		27.51	■■■□□ 2
ATG13-223	ENST00000577256	MLEC	Q14165	292 aa		27.51	■■□□□ 1.99
ATG13-223	ENST00000577256	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		27.49	■■□□□ 1.99
ATG13-223	ENST00000577256	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	27.49	■■□□□ 1.99
ATG13-223	ENST00000577256	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		27.49	■■□□□ 1.99
ATG13-223	ENST00000577256	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		27.47	■■□□□ 1.99
ATG13-223	ENST00000577256	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		27.43	■■□□□ 1.98
ATG13-223	ENST00000577256	A2M	P01023	1474 aa		27.43	■■□□□ 1.98
ATG13-223	ENST00000577256	PLXNC1	O60486	1568 aa		27.41	■■□□□ 1.98
ATG13-223	ENST00000577256	TSPY4	P0CV99	314 aa		27.4	■■□□□ 1.98
ATG13-223	ENST00000577256	TSPY10	P0CW01	314 aa		27.4	■■□□□ 1.98
ATG13-223	ENST00000577256	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.39	■■□□□ 1.98
ATG13-223	ENST00000577256	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		27.39	■■□□□ 1.97
ATG13-223	ENST00000577256	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		27.35	■■□□□ 1.97
ATG13-223	ENST00000577256	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	27.33	■■□□□ 1.97
ATG13-223	ENST00000577256	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	27.33	■■□□□ 1.97
ATG13-223	ENST00000577256	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	27.32	■■□□□ 1.96
ATG13-223	ENST00000577256	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		27.29	■■□□□ 1.96
ATG13-223	ENST00000577256	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		27.27	■■□□□ 1.96
ATG13-223	ENST00000577256	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		27.26	■■□□□ 1.95
ATG13-223	ENST00000577256	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		27.26	■■□□□ 1.95
ATG13-223	ENST00000577256	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	27.26	■■□□□ 1.95
ATG13-223	ENST00000577256	ABCC5	O15440	1437 aa		27.25	■■□□□ 1.95
ATG13-223	ENST00000577256	DAPK1	P53355	1430 aa		27.24	■■□□□ 1.95
ATG13-223	ENST00000577256	GGT6	Q6P531	493 aa		27.23	■■□□□ 1.95
ATG13-223	ENST00000577256	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		27.23	■■□□□ 1.95
ATG13-223	ENST00000577256	MROH2A	A6NES4	1674 aa		27.21	■■□□□ 1.95
ATG13-223	ENST00000577256	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	27.21	■■□□□ 1.95
ATG13-223	ENST00000577256	C3	P01024	1663 aa		27.21	■■□□□ 1.95
ATG13-223	ENST00000577256	KIF3B	O15066	747 aa		27.2	■■□□□ 1.94
ATG13-223	ENST00000577256	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	27.17	■■□□□ 1.94
ATG13-223	ENST00000577256	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		27.17	■■□□□ 1.94
ATG13-223	ENST00000577256	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	27.17	■■□□□ 1.94
ATG13-223	ENST00000577256	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	27.17	■■□□□ 1.94
ATG13-223	ENST00000577256	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		27.16	■■□□□ 1.94
ATG13-223	ENST00000577256	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	27.15	■■□□□ 1.94
ATG13-223	ENST00000577256	KIF15	Q9NS87	1388 aa		27.14	■■□□□ 1.94
ATG13-223	ENST00000577256	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	27.14	■■□□□ 1.94
ATG13-223	ENST00000577256	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		27.14	■■□□□ 1.94
ATG13-223	ENST00000577256	ZMYM3	Q14202	1370 aa		27.13	■■□□□ 1.93

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