RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576393.5

HGS-215, Transcript of hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate, human

TSL 2

Gene HGS, Length 922 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HGS-215	ENST00000576393	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		33.82	■■■■□ 3
HGS-215	ENST00000576393	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.81	■■■■□ 3
HGS-215	ENST00000576393	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.79	■■■■□ 3
HGS-215	ENST00000576393	PTPRM	P28827	1452 aa		33.78	■■■■□ 3
HGS-215	ENST00000576393	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.78	■■■■□ 3
HGS-215	ENST00000576393	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
HGS-215	ENST00000576393	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.73	■■■□□ 2.99
HGS-215	ENST00000576393	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.71	■■■□□ 2.99
HGS-215	ENST00000576393	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.71	■■■□□ 2.99
HGS-215	ENST00000576393	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.7	■■■□□ 2.99
HGS-215	ENST00000576393	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.65	■■■□□ 2.98
HGS-215	ENST00000576393	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.62	■■■□□ 2.97
HGS-215	ENST00000576393	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
HGS-215	ENST00000576393	ATP10A	O60312	1499 aa		33.61	■■■□□ 2.97
HGS-215	ENST00000576393	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.6	■■■□□ 2.97
HGS-215	ENST00000576393	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.57	■■■□□ 2.96
HGS-215	ENST00000576393	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.56	■■■□□ 2.96
HGS-215	ENST00000576393	KDM5C	P41229	1560 aa		33.55	■■■□□ 2.96
HGS-215	ENST00000576393	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.55	■■■□□ 2.96
HGS-215	ENST00000576393	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.55	■■■□□ 2.96
HGS-215	ENST00000576393	MLEC	Q14165	292 aa		33.52	■■■□□ 2.96
HGS-215	ENST00000576393	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.5	■■■□□ 2.95
HGS-215	ENST00000576393	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.49	■■■□□ 2.95
HGS-215	ENST00000576393	ABCC1	P33527	1531 aa		33.48	■■■□□ 2.95
HGS-215	ENST00000576393	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.46	■■■□□ 2.95
HGS-215	ENST00000576393	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.45	■■■□□ 2.94
HGS-215	ENST00000576393	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.43	■■■□□ 2.94
HGS-215	ENST00000576393	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.42	■■■□□ 2.94
HGS-215	ENST00000576393	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.41	■■■□□ 2.94
HGS-215	ENST00000576393	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.41	■■■□□ 2.94
HGS-215	ENST00000576393	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.41	■■■□□ 2.94
HGS-215	ENST00000576393	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.4	■■■□□ 2.94
HGS-215	ENST00000576393	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.39	■■■□□ 2.94
HGS-215	ENST00000576393	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
HGS-215	ENST00000576393	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
HGS-215	ENST00000576393	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
HGS-215	ENST00000576393	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.37	■■■□□ 2.93
HGS-215	ENST00000576393	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.35	■■■□□ 2.93
HGS-215	ENST00000576393	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.34	■■■□□ 2.93
HGS-215	ENST00000576393	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.32	■■■□□ 2.92
HGS-215	ENST00000576393	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
HGS-215	ENST00000576393	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.31	■■■□□ 2.92
HGS-215	ENST00000576393	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.29	■■■□□ 2.92
HGS-215	ENST00000576393	AGL	P35573	1532 aa		33.29	■■■□□ 2.92
HGS-215	ENST00000576393	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.28	■■■□□ 2.92
HGS-215	ENST00000576393	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.28	■■■□□ 2.92
HGS-215	ENST00000576393	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.26	■■■□□ 2.91
HGS-215	ENST00000576393	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
HGS-215	ENST00000576393	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.24	■■■□□ 2.91	1e-8	■■■■■ 33.3
HGS-215	ENST00000576393	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
HGS-215	ENST00000576393	HSPA2	P54652	639 aa		33.21	■■■□□ 2.91
HGS-215	ENST00000576393	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
HGS-215	ENST00000576393	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.2	■■■□□ 2.9
HGS-215	ENST00000576393	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
HGS-215	ENST00000576393	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.17	■■■□□ 2.9
HGS-215	ENST00000576393	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.14	■■■□□ 2.9
HGS-215	ENST00000576393	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.12	■■■□□ 2.89
HGS-215	ENST00000576393	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
HGS-215	ENST00000576393	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
HGS-215	ENST00000576393	C3	P01024	1663 aa		33.09	■■■□□ 2.89
HGS-215	ENST00000576393	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.09	■■■□□ 2.89
HGS-215	ENST00000576393	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.08	■■■□□ 2.89
HGS-215	ENST00000576393	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.05	■■■□□ 2.88
HGS-215	ENST00000576393	A2M	P01023	1474 aa		33.05	■■■□□ 2.88
HGS-215	ENST00000576393	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
HGS-215	ENST00000576393	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.04	■■■□□ 2.88
HGS-215	ENST00000576393	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.03	■■■□□ 2.88
HGS-215	ENST00000576393	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.02	■■■□□ 2.88
HGS-215	ENST00000576393	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.01	■■■□□ 2.88
HGS-215	ENST00000576393	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.01	■■■□□ 2.88
HGS-215	ENST00000576393	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33	■■■□□ 2.87
HGS-215	ENST00000576393	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.99	■■■□□ 2.87
HGS-215	ENST00000576393	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.98	■■■□□ 2.87
HGS-215	ENST00000576393	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.97	■■■□□ 2.87
HGS-215	ENST00000576393	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.93	■■■□□ 2.86
HGS-215	ENST00000576393	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.93	■■■□□ 2.86
HGS-215	ENST00000576393	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.93	■■■□□ 2.86
HGS-215	ENST00000576393	NPAT	Q14207	1427 aa		32.92	■■■□□ 2.86
HGS-215	ENST00000576393	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.92	■■■□□ 2.86
HGS-215	ENST00000576393	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.92	■■■□□ 2.86
HGS-215	ENST00000576393	GGT6	Q6P531	493 aa		32.91	■■■□□ 2.86
HGS-215	ENST00000576393	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.89	■■■□□ 2.86
HGS-215	ENST00000576393	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
HGS-215	ENST00000576393	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.88	■■■□□ 2.85
HGS-215	ENST00000576393	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
HGS-215	ENST00000576393	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.83	■■■□□ 2.85
HGS-215	ENST00000576393	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.83	■■■□□ 2.85
HGS-215	ENST00000576393	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.83	■■■□□ 2.85
HGS-215	ENST00000576393	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.81	■■■□□ 2.84
HGS-215	ENST00000576393	PTPRT	O14522	1441 aa		32.77	■■■□□ 2.84
HGS-215	ENST00000576393	KIF3B	O15066	747 aa		32.75	■■■□□ 2.83
HGS-215	ENST00000576393	APLP2	Q06481	763 aa		32.75	■■■□□ 2.83
HGS-215	ENST00000576393	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
HGS-215	ENST00000576393	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.74	■■■□□ 2.83
HGS-215	ENST00000576393	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.72	■■■□□ 2.83
HGS-215	ENST00000576393	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.72	■■■□□ 2.83
HGS-215	ENST00000576393	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.72	■■■□□ 2.83
HGS-215	ENST00000576393	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.7	■■■□□ 2.83
HGS-215	ENST00000576393	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.69	■■■□□ 2.82
HGS-215	ENST00000576393	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.69	■■■□□ 2.82

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