RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575009.5

SRRM2-222, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 2, human

TSL 5

Gene SRRM2, Length 1,146 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM2-222	ENST00000575009	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		41.75	■■■■■ 4.27
SRRM2-222	ENST00000575009	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		41.75	■■■■■ 4.27
SRRM2-222	ENST00000575009	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		41.74	■■■■■ 4.27
SRRM2-222	ENST00000575009	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		41.71	■■■■■ 4.27
SRRM2-222	ENST00000575009	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		41.71	■■■■■ 4.27
SRRM2-222	ENST00000575009	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		41.64	■■■■■ 4.26
SRRM2-222	ENST00000575009	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		41.63	■■■■■ 4.26
SRRM2-222	ENST00000575009	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		41.62	■■■■■ 4.25
SRRM2-222	ENST00000575009	TIAM1	Q13009	1591 aa		41.61	■■■■■ 4.25
SRRM2-222	ENST00000575009	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.59	■■■■■ 4.25
SRRM2-222	ENST00000575009	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	41.59	■■■■■ 4.25
SRRM2-222	ENST00000575009	ABCC1	P33527	1531 aa		41.54	■■■■■ 4.24
SRRM2-222	ENST00000575009	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		41.52	■■■■■ 4.24
SRRM2-222	ENST00000575009	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		41.51	■■■■■ 4.24
SRRM2-222	ENST00000575009	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		41.5	■■■■■ 4.23
SRRM2-222	ENST00000575009	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		41.5	■■■■■ 4.23
SRRM2-222	ENST00000575009	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		41.5	■■■■■ 4.23
SRRM2-222	ENST00000575009	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		41.5	■■■■■ 4.23
SRRM2-222	ENST00000575009	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	41.47	■■■■■ 4.23
SRRM2-222	ENST00000575009	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		41.47	■■■■■ 4.23
SRRM2-222	ENST00000575009	AFAP1	Q8N556	730 aa		41.45	■■■■■ 4.23
SRRM2-222	ENST00000575009	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	41.44	■■■■■ 4.22
SRRM2-222	ENST00000575009	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		41.44	■■■■■ 4.22
SRRM2-222	ENST00000575009	KDM5C	P41229	1560 aa		41.44	■■■■■ 4.22
SRRM2-222	ENST00000575009	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		41.43	■■■■■ 4.22
SRRM2-222	ENST00000575009	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		41.41	■■■■■ 4.22
SRRM2-222	ENST00000575009	NCOA2	Q15596	1464 aa		41.41	■■■■■ 4.22
SRRM2-222	ENST00000575009	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		41.41	■■■■■ 4.22
SRRM2-222	ENST00000575009	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	41.4	■■■■■ 4.22
SRRM2-222	ENST00000575009	MAP3K1	Q13233	1512 aa		41.38	■■■■■ 4.21
SRRM2-222	ENST00000575009	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		41.38	■■■■■ 4.21
SRRM2-222	ENST00000575009	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		41.35	■■■■■ 4.21
SRRM2-222	ENST00000575009	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	41.35	■■■■■ 4.21
SRRM2-222	ENST00000575009	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.35	■■■■■ 4.21
SRRM2-222	ENST00000575009	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		41.33	■■■■■ 4.21
SRRM2-222	ENST00000575009	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		41.3	■■■■■ 4.2
SRRM2-222	ENST00000575009	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	41.29	■■■■■ 4.2	8e-9	■■■■■ 32.4
SRRM2-222	ENST00000575009	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	41.27	■■■■■ 4.2
SRRM2-222	ENST00000575009	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		41.27	■■■■■ 4.2
SRRM2-222	ENST00000575009	ATP10A	O60312	1499 aa		41.27	■■■■■ 4.2
SRRM2-222	ENST00000575009	ABCA6	Q8N139	1617 aa		41.26	■■■■■ 4.2
SRRM2-222	ENST00000575009	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		41.26	■■■■■ 4.2
SRRM2-222	ENST00000575009	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		41.25	■■■■■ 4.19
SRRM2-222	ENST00000575009	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		41.24	■■■■■ 4.19
SRRM2-222	ENST00000575009	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		41.23	■■■■■ 4.19
SRRM2-222	ENST00000575009	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		41.23	■■■■■ 4.19
SRRM2-222	ENST00000575009	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		41.22	■■■■■ 4.19
SRRM2-222	ENST00000575009	MADD	Q8WXG6	1647 aa		41.21	■■■■■ 4.19
SRRM2-222	ENST00000575009	APLP2	Q06481	763 aa		41.17	■■■■■ 4.18
SRRM2-222	ENST00000575009	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		41.13	■■■■■ 4.17
SRRM2-222	ENST00000575009	MBD5	Q9P267	1494 aa		41.11	■■■■■ 4.17
SRRM2-222	ENST00000575009	MLEC	Q14165	292 aa		41.11	■■■■■ 4.17
SRRM2-222	ENST00000575009	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	41.1	■■■■■ 4.17
SRRM2-222	ENST00000575009	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	41.1	■■■■■ 4.17
SRRM2-222	ENST00000575009	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	41.09	■■■■■ 4.17
SRRM2-222	ENST00000575009	ATP7A	Q04656	1500 aa		41.08	■■■■■ 4.17
SRRM2-222	ENST00000575009	RERE	Q9P2R6	1566 aa		41.08	■■■■■ 4.17
SRRM2-222	ENST00000575009	PTPRM	P28827	1452 aa		41.07	■■■■■ 4.16
SRRM2-222	ENST00000575009	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		41.02	■■■■■ 4.16
SRRM2-222	ENST00000575009	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		41.02	■■■■■ 4.16
SRRM2-222	ENST00000575009	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		40.96	■■■■■ 4.15
SRRM2-222	ENST00000575009	AGL	P35573	1532 aa		40.93	■■■■■ 4.14
SRRM2-222	ENST00000575009	MIA2	Q96PC5	1412 aa		40.92	■■■■■ 4.14
SRRM2-222	ENST00000575009	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		40.91	■■■■■ 4.14
SRRM2-222	ENST00000575009	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		40.86	■■■■■ 4.13
SRRM2-222	ENST00000575009	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		40.86	■■■■■ 4.13
SRRM2-222	ENST00000575009	PLXNC1	O60486	1568 aa		40.86	■■■■■ 4.13
SRRM2-222	ENST00000575009	A2M	P01023	1474 aa		40.85	■■■■■ 4.13
SRRM2-222	ENST00000575009	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		40.84	■■■■■ 4.13
SRRM2-222	ENST00000575009	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		40.82	■■■■■ 4.12
SRRM2-222	ENST00000575009	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		40.8	■■■■■ 4.12
SRRM2-222	ENST00000575009	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		40.76	■■■■■ 4.12
SRRM2-222	ENST00000575009	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		40.71	■■■■■ 4.11
SRRM2-222	ENST00000575009	TSPY4	P0CV99	314 aa		40.71	■■■■■ 4.11
SRRM2-222	ENST00000575009	TSPY10	P0CW01	314 aa		40.71	■■■■■ 4.11
SRRM2-222	ENST00000575009	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	40.68	■■■■■ 4.1
SRRM2-222	ENST00000575009	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	40.68	■■■■■ 4.1
SRRM2-222	ENST00000575009	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		40.66	■■■■■ 4.1
SRRM2-222	ENST00000575009	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	40.66	■■■■■ 4.1
SRRM2-222	ENST00000575009	C3	P01024	1663 aa		40.64	■■■■■ 4.1
SRRM2-222	ENST00000575009	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	40.63	■■■■■ 4.09
SRRM2-222	ENST00000575009	ABCC5	O15440	1437 aa		40.61	■■■■■ 4.09
SRRM2-222	ENST00000575009	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	40.61	■■■■■ 4.09
SRRM2-222	ENST00000575009	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	40.6	■■■■■ 4.09
SRRM2-222	ENST00000575009	GGT6	Q6P531	493 aa		40.59	■■■■■ 4.09
SRRM2-222	ENST00000575009	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	40.58	■■■■■ 4.09
SRRM2-222	ENST00000575009	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		40.58	■■■■■ 4.09
SRRM2-222	ENST00000575009	DAPK1	P53355	1430 aa		40.57	■■■■■ 4.08
SRRM2-222	ENST00000575009	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		40.55	■■■■■ 4.08
SRRM2-222	ENST00000575009	MROH2A	A6NES4	1674 aa		40.53	■■■■■ 4.08
SRRM2-222	ENST00000575009	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		40.53	■■■■■ 4.08
SRRM2-222	ENST00000575009	KIF3B	O15066	747 aa		40.52	■■■■■ 4.08
SRRM2-222	ENST00000575009	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	40.49	■■■■■ 4.07
SRRM2-222	ENST00000575009	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		40.47	■■■■■ 4.07
SRRM2-222	ENST00000575009	ZMYM3	Q14202	1370 aa		40.43	■■■■■ 4.06
SRRM2-222	ENST00000575009	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		40.41	■■■■■ 4.06
SRRM2-222	ENST00000575009	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		40.41	■■■■■ 4.06
SRRM2-222	ENST00000575009	HSPA2	P54652	639 aa		40.4	■■■■■ 4.06
SRRM2-222	ENST00000575009	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	40.4	■■■■■ 4.06
SRRM2-222	ENST00000575009	KIF15	Q9NS87	1388 aa		40.39	■■■■■ 4.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms