RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566905.5

PKD1-232, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 3

Gene PKD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-232ENST00000566905 PREX2Q70Z35 1606 aa30.29■■■□□ 2.44
PKD1-232ENST00000566905 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.28■■■□□ 2.44
PKD1-232ENST00000566905 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.24■■■□□ 2.43
PKD1-232ENST00000566905 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
PKD1-232ENST00000566905 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.23■■■□□ 2.43
PKD1-232ENST00000566905 TIAM1Q13009 1591 aa30.21■■■□□ 2.43
PKD1-232ENST00000566905 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.16■■■□□ 2.42
PKD1-232ENST00000566905 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.15■■■□□ 2.42
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PKD1-232ENST00000566905 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.14■■■□□ 2.42
PKD1-232ENST00000566905 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.14■■■□□ 2.41
PKD1-232ENST00000566905 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
PKD1-232ENST00000566905 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.12■■■□□ 2.41
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PKD1-232ENST00000566905 ABCC1P33527 1531 aa30.11■■■□□ 2.41
PKD1-232ENST00000566905 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.09■■■□□ 2.41
PKD1-232ENST00000566905 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.08■■■□□ 2.41
PKD1-232ENST00000566905 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.07■■■□□ 2.4
PKD1-232ENST00000566905 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.07■■■□□ 2.4
PKD1-232ENST00000566905 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.06■■■□□ 2.4
PKD1-232ENST00000566905 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PKD1-232ENST00000566905 MAP3K1Q13233 1512 aa30.05■■■□□ 2.4
PKD1-232ENST00000566905 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.05■■■□□ 2.4
PKD1-232ENST00000566905 NCOA2Q15596 1464 aa30.05■■■□□ 2.4
PKD1-232ENST00000566905 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.05■■■□□ 2.4
PKD1-232ENST00000566905 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.05■■■□□ 2.4
PKD1-232ENST00000566905 AFAP1Q8N556 730 aa30.04■■■□□ 2.4
PKD1-232ENST00000566905 KDM5CP41229 1560 aa30.02■■■□□ 2.4
PKD1-232ENST00000566905 APLP2Q06481 763 aa30.01■■■□□ 2.39
PKD1-232ENST00000566905 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.01■■■□□ 2.39
PKD1-232ENST00000566905 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
PKD1-232ENST00000566905 MYT1LQ9UL68 1186 aa30■■■□□ 2.39
PKD1-232ENST00000566905 SYCP2Q9BX26 1530 aa30■■■□□ 2.39
PKD1-232ENST00000566905 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
PKD1-232ENST00000566905 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.98■■■□□ 2.39
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PKD1-232ENST00000566905 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.93■■■□□ 2.38
PKD1-232ENST00000566905 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.92■■■□□ 2.38
PKD1-232ENST00000566905 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
PKD1-232ENST00000566905 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.9■■■□□ 2.38
PKD1-232ENST00000566905 ATP10AO60312 1499 aa29.9■■■□□ 2.38
PKD1-232ENST00000566905 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.9■■■□□ 2.38
PKD1-232ENST00000566905 ABCA6Q8N139 1617 aa29.89■■■□□ 2.37
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PKD1-232ENST00000566905 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.88■■■□□ 2.37
PKD1-232ENST00000566905 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.87■■■□□ 2.37
PKD1-232ENST00000566905 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.84■■■□□ 2.37
PKD1-232ENST00000566905 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
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PKD1-232ENST00000566905 MBD5Q9P267 1494 aa29.8■■■□□ 2.36
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PKD1-232ENST00000566905 ATP7AQ04656 1500 aa29.78■■■□□ 2.36
PKD1-232ENST00000566905 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.78■■■□□ 2.36
PKD1-232ENST00000566905 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
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PKD1-232ENST00000566905 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.69■■■□□ 2.34
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PKD1-232ENST00000566905 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.66■■■□□ 2.34
PKD1-232ENST00000566905 AGLP35573 1532 aa29.66■■■□□ 2.34
PKD1-232ENST00000566905 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.64■■■□□ 2.34
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PKD1-232ENST00000566905 TSPY4P0CV99 314 aa29.6■■■□□ 2.33
PKD1-232ENST00000566905 TSPY10P0CW01 314 aa29.6■■■□□ 2.33
PKD1-232ENST00000566905 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.6■■■□□ 2.33
PKD1-232ENST00000566905 PLXNC1O60486 1568 aa29.6■■■□□ 2.33
PKD1-232ENST00000566905 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.53■■■□□ 2.32
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PKD1-232ENST00000566905 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.41■■■□□ 2.3
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PKD1-232ENST00000566905 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.35■■■□□ 2.29
PKD1-232ENST00000566905 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.33■■■□□ 2.29
PKD1-232ENST00000566905 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.33■■■□□ 2.29
PKD1-232ENST00000566905 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.32■■■□□ 2.28
PKD1-232ENST00000566905 KIF15Q9NS87 1388 aa29.32■■■□□ 2.28
PKD1-232ENST00000566905 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.32■■■□□ 2.28
PKD1-232ENST00000566905 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
PKD1-232ENST00000566905 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
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