RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559365.5

PSMA4-212, Transcript of proteasome subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSMA4, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4-212ENST00000559365 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.86■■■■■ 4.61
PSMA4-212ENST00000559365 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.86■■■■■ 4.61
PSMA4-212ENST00000559365 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.84■■■■■ 4.61
PSMA4-212ENST00000559365 HECW2Q9P2P5 1572 aa43.84■■■■■ 4.61
PSMA4-212ENST00000559365 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43.82■■■■■ 4.61
PSMA4-212ENST00000559365 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP43.82■■■■■ 4.61
PSMA4-212ENST00000559365 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.82■■■■■ 4.61
PSMA4-212ENST00000559365 YEATS2Q9ULM3 1422 aa43.82■■■■■ 4.6
PSMA4-212ENST00000559365 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.81■■■■■ 4.6
PSMA4-212ENST00000559365 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa43.78■■■■■ 4.6
PSMA4-212ENST00000559365 MADDQ8WXG6 1647 aa43.77■■■■■ 4.6
PSMA4-212ENST00000559365 PTPRMP28827 1452 aa43.75■■■■■ 4.59
PSMA4-212ENST00000559365 PREX2Q70Z35 1606 aa43.74■■■■■ 4.59
PSMA4-212ENST00000559365 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa43.68■■■■■ 4.58
PSMA4-212ENST00000559365 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa43.65■■■■■ 4.58
PSMA4-212ENST00000559365 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
PSMA4-212ENST00000559365 KDM5CP41229 1560 aa43.63■■■■■ 4.58
PSMA4-212ENST00000559365 ABCC1P33527 1531 aa43.58■■■■■ 4.57
PSMA4-212ENST00000559365 ATP10AO60312 1499 aa43.57■■■■■ 4.57
PSMA4-212ENST00000559365 CEP162Q5TB80 1403 aa43.57■■■■■ 4.57
PSMA4-212ENST00000559365 AFAP1Q8N556 730 aa43.57■■■■■ 4.57
PSMA4-212ENST00000559365 ITSN2Q9NZM3 1697 aa43.56■■■■■ 4.56
PSMA4-212ENST00000559365 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.53■■■■■ 4.56
PSMA4-212ENST00000559365 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.53■■■■■ 4.56
PSMA4-212ENST00000559365 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa43.49■■■■■ 4.55
PSMA4-212ENST00000559365 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.48■■■■■ 4.55
PSMA4-212ENST00000559365 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa43.46■■■■■ 4.55
PSMA4-212ENST00000559365 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
PSMA4-212ENST00000559365 MLECQ14165 292 aa43.45■■■■■ 4.55
PSMA4-212ENST00000559365 ABCA6Q8N139 1617 aa43.43■■■■■ 4.54
PSMA4-212ENST00000559365 MLH3Q9UHC1 1453 aa43.43■■■■■ 4.54
PSMA4-212ENST00000559365 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.42■■■■■ 4.54
PSMA4-212ENST00000559365 MTUS2Q5JR59 1369 aa43.4■■■■■ 4.54
PSMA4-212ENST00000559365 MYT1LQ9UL68 1186 aa43.39■■■■■ 4.54
PSMA4-212ENST00000559365 REREQ9P2R6 1566 aa43.36■■■■■ 4.53
PSMA4-212ENST00000559365 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
PSMA4-212ENST00000559365 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa43.35■■■■■ 4.53
PSMA4-212ENST00000559365 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa43.32■■■■■ 4.53
PSMA4-212ENST00000559365 SYCP2Q9BX26 1530 aa43.32■■■■■ 4.53
PSMA4-212ENST00000559365 CCNB3Q8WWL7 1395 aa43.3■■■■■ 4.52
PSMA4-212ENST00000559365 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.3■■■■■ 4.52
PSMA4-212ENST00000559365 LMTK3Q96Q04 1460 aa43.3■■■■■ 4.52
PSMA4-212ENST00000559365 PLPPR3Q6T4P5 718 aa43.29■■■■■ 4.52
PSMA4-212ENST00000559365 TIAM1Q13009 1591 aa43.25■■■■■ 4.51
PSMA4-212ENST00000559365 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
PSMA4-212ENST00000559365 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP43.21■■■■■ 4.51
PSMA4-212ENST00000559365 AGLP35573 1532 aa43.2■■■■■ 4.51
PSMA4-212ENST00000559365 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.19■■■■■ 4.51
PSMA4-212ENST00000559365 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.19■■■■■ 4.5
PSMA4-212ENST00000559365 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
PSMA4-212ENST00000559365 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
PSMA4-212ENST00000559365 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.1■■■■■ 4.49
PSMA4-212ENST00000559365 ATP7AQ04656 1500 aa43.1■■■■■ 4.49
PSMA4-212ENST00000559365 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
PSMA4-212ENST00000559365 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.49
PSMA4-212ENST00000559365 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
PSMA4-212ENST00000559365 NCOA2Q15596 1464 aa43.05■■■■■ 4.48
PSMA4-212ENST00000559365 PREX1Q8TCU6 1659 aa43.04■■■■■ 4.48
PSMA4-212ENST00000559365 HSPA2P54652 639 aa43.03■■■■■ 4.48
PSMA4-212ENST00000559365 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP43.01■■■■■ 4.48
PSMA4-212ENST00000559365 C3P01024 1663 aa43.01■■■■■ 4.48
PSMA4-212ENST00000559365 MBD5Q9P267 1494 aa43■■■■■ 4.47
PSMA4-212ENST00000559365 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
PSMA4-212ENST00000559365 PLXNC1O60486 1568 aa42.95■■■■■ 4.47
PSMA4-212ENST00000559365 A2MP01023 1474 aa42.92■■■■■ 4.46
PSMA4-212ENST00000559365 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.92■■■■■ 4.46
PSMA4-212ENST00000559365 ADGBQ8N7X0 1667 aa42.92■■■■■ 4.46
PSMA4-212ENST00000559365 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
PSMA4-212ENST00000559365 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa42.88■■■■■ 4.46
PSMA4-212ENST00000559365 CNTLNQ9NXG0 1405 aa42.87■■■■■ 4.45
PSMA4-212ENST00000559365 MROH2AA6NES4 1674 aa42.84■■■■■ 4.45
PSMA4-212ENST00000559365 MAP3K1Q13233 1512 aa42.84■■■■■ 4.45
PSMA4-212ENST00000559365 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.81■■■■■ 4.44
PSMA4-212ENST00000559365 CCDC141Q6ZP82 1450 aa42.8■■■■■ 4.44
PSMA4-212ENST00000559365 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa42.8■■■■■ 4.44
PSMA4-212ENST00000559365 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
PSMA4-212ENST00000559365 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.77■■■■■ 4.44
PSMA4-212ENST00000559365 ARHGEF5Q12774 1597 aa42.73■■■■■ 4.43
PSMA4-212ENST00000559365 STRCQ7RTU9 1775 aa42.7■■■■■ 4.43
PSMA4-212ENST00000559365 RSPH4AQ5TD94 716 aa42.69■■■■■ 4.42
PSMA4-212ENST00000559365 ZMYM3Q14202 1370 aa42.68■■■■■ 4.42
PSMA4-212ENST00000559365 GGT6Q6P531 493 aa42.67■■■■■ 4.42
PSMA4-212ENST00000559365 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
PSMA4-212ENST00000559365 NPATQ14207 1427 aa42.63■■■■■ 4.41
PSMA4-212ENST00000559365 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.6■■■■■ 4.41
PSMA4-212ENST00000559365 PPP6R1Q9UPN7 881 aa42.56■■■■■ 4.4
PSMA4-212ENST00000559365 MIA2Q96PC5 1412 aa42.55■■■■■ 4.4
PSMA4-212ENST00000559365 FBXO41Q8TF61 875 aa42.54■■■■■ 4.4
PSMA4-212ENST00000559365 MAST1Q9Y2H9 1570 aa42.52■■■■■ 4.4
PSMA4-212ENST00000559365 TSPY4P0CV99 314 aa42.52■■■■■ 4.4
PSMA4-212ENST00000559365 TSPY10P0CW01 314 aa42.52■■■■■ 4.4
PSMA4-212ENST00000559365 PTPRKQ15262 1439 aa42.51■■■■■ 4.4
PSMA4-212ENST00000559365 KIF3BO15066 747 aa42.5■■■■■ 4.39
PSMA4-212ENST00000559365 MYO3AQ8NEV4 1616 aa42.48■■■■■ 4.39
PSMA4-212ENST00000559365 APLP2Q06481 763 aa42.47■■■■■ 4.39
PSMA4-212ENST00000559365 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.45■■■■■ 4.39
PSMA4-212ENST00000559365 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.39
PSMA4-212ENST00000559365 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.41■■■■■ 4.38
PSMA4-212ENST00000559365 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.41■■■■■ 4.38
PSMA4-212ENST00000559365 NCOA1Q15788 1441 aa42.4■■■■■ 4.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms