RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557694.1

LGMN-218, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 2

Gene LGMN, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-218ENST00000557694 PTPRMP28827 1452 aa25.27■■□□□ 1.64
LGMN-218ENST00000557694 CLIP1P30622 1438 aa25.25■■□□□ 1.63
LGMN-218ENST00000557694 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.25■■□□□ 1.63
LGMN-218ENST00000557694 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.25■■□□□ 1.63
LGMN-218ENST00000557694 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.22■■□□□ 1.63
LGMN-218ENST00000557694 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.22■■□□□ 1.63
LGMN-218ENST00000557694 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
LGMN-218ENST00000557694 AFAP1Q8N556 730 aa25.19■■□□□ 1.62
LGMN-218ENST00000557694 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
LGMN-218ENST00000557694 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.18■■□□□ 1.62
LGMN-218ENST00000557694 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.17■■□□□ 1.62
LGMN-218ENST00000557694 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
LGMN-218ENST00000557694 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.15■■□□□ 1.62
LGMN-218ENST00000557694 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.14■■□□□ 1.62
LGMN-218ENST00000557694 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.14■■□□□ 1.61
LGMN-218ENST00000557694 PREX2Q70Z35 1606 aa25.13■■□□□ 1.61
LGMN-218ENST00000557694 MLECQ14165 292 aa25.13■■□□□ 1.61
LGMN-218ENST00000557694 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.13■■□□□ 1.61
LGMN-218ENST00000557694 KDM5CP41229 1560 aa25.11■■□□□ 1.61
LGMN-218ENST00000557694 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.1■■□□□ 1.61
LGMN-218ENST00000557694 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.1■■□□□ 1.61
LGMN-218ENST00000557694 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.09■■□□□ 1.61
LGMN-218ENST00000557694 ABCC1P33527 1531 aa25.08■■□□□ 1.61
LGMN-218ENST00000557694 ATP10AO60312 1499 aa25.07■■□□□ 1.6
LGMN-218ENST00000557694 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.06■■□□□ 1.6
LGMN-218ENST00000557694 ABCA6Q8N139 1617 aa25.06■■□□□ 1.6
LGMN-218ENST00000557694 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.05■■□□□ 1.6
LGMN-218ENST00000557694 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.05■■□□□ 1.6
LGMN-218ENST00000557694 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
LGMN-218ENST00000557694 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.05■■□□□ 1.6
LGMN-218ENST00000557694 CEP162Q5TB80 1403 aa25.04■■□□□ 1.6
LGMN-218ENST00000557694 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.04■■□□□ 1.6
LGMN-218ENST00000557694 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
LGMN-218ENST00000557694 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.02■■□□□ 1.6
LGMN-218ENST00000557694 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25■■□□□ 1.59
LGMN-218ENST00000557694 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
LGMN-218ENST00000557694 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25■■□□□ 1.59
LGMN-218ENST00000557694 HSPA2P54652 639 aa24.99■■□□□ 1.59
LGMN-218ENST00000557694 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
LGMN-218ENST00000557694 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.96■■□□□ 1.59
LGMN-218ENST00000557694 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
LGMN-218ENST00000557694 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
LGMN-218ENST00000557694 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.96■■□□□ 1.59
LGMN-218ENST00000557694 TIAM1Q13009 1591 aa24.91■■□□□ 1.58
LGMN-218ENST00000557694 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.89■■□□□ 1.58
LGMN-218ENST00000557694 REREQ9P2R6 1566 aa24.88■■□□□ 1.57
LGMN-218ENST00000557694 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.88■■□□□ 1.57
LGMN-218ENST00000557694 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.85■■□□□ 1.57
LGMN-218ENST00000557694 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
LGMN-218ENST00000557694 AGLP35573 1532 aa24.82■■□□□ 1.56
LGMN-218ENST00000557694 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.82■■□□□ 1.56
LGMN-218ENST00000557694 MBD5Q9P267 1494 aa24.81■■□□□ 1.56
LGMN-218ENST00000557694 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
LGMN-218ENST00000557694 C3P01024 1663 aa24.8■■□□□ 1.56
LGMN-218ENST00000557694 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.78■■□□□ 1.56
LGMN-218ENST00000557694 ATP7AQ04656 1500 aa24.78■■□□□ 1.56
LGMN-218ENST00000557694 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
LGMN-218ENST00000557694 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
LGMN-218ENST00000557694 NCOA2Q15596 1464 aa24.77■■□□□ 1.56
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LGMN-218ENST00000557694 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.72■■□□□ 1.55
LGMN-218ENST00000557694 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.72■■□□□ 1.55
LGMN-218ENST00000557694 STRCQ7RTU9 1775 aa24.7■■□□□ 1.55
LGMN-218ENST00000557694 A2MP01023 1474 aa24.69■■□□□ 1.54
LGMN-218ENST00000557694 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.68■■□□□ 1.54
LGMN-218ENST00000557694 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.67■■□□□ 1.54
LGMN-218ENST00000557694 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.66■■□□□ 1.54
LGMN-218ENST00000557694 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.65■■□□□ 1.54
LGMN-218ENST00000557694 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
LGMN-218ENST00000557694 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
LGMN-218ENST00000557694 ZMYM3Q14202 1370 aa24.6■■□□□ 1.53
LGMN-218ENST00000557694 GGT6Q6P531 493 aa24.6■■□□□ 1.53
LGMN-218ENST00000557694 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.59■■□□□ 1.53
LGMN-218ENST00000557694 MROH2AA6NES4 1674 aa24.57■■□□□ 1.52
LGMN-218ENST00000557694 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.56■■□□□ 1.52
LGMN-218ENST00000557694 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.55■■□□□ 1.52
LGMN-218ENST00000557694 FBXO41Q8TF61 875 aa24.55■■□□□ 1.52
LGMN-218ENST00000557694 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.54■■□□□ 1.52
LGMN-218ENST00000557694 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
LGMN-218ENST00000557694 PTPRKQ15262 1439 aa24.53■■□□□ 1.52
LGMN-218ENST00000557694 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.51■■□□□ 1.51
LGMN-218ENST00000557694 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
LGMN-218ENST00000557694 MAP3K1Q13233 1512 aa24.51■■□□□ 1.51
LGMN-218ENST00000557694 KIF3BO15066 747 aa24.48■■□□□ 1.51
LGMN-218ENST00000557694 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
LGMN-218ENST00000557694 NPATQ14207 1427 aa24.47■■□□□ 1.51
LGMN-218ENST00000557694 CERKQ8TCT0 537 aa24.46■■□□□ 1.51
LGMN-218ENST00000557694 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.46■■□□□ 1.51
LGMN-218ENST00000557694 NCOA1Q15788 1441 aa24.45■■□□□ 1.51
LGMN-218ENST00000557694 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.45■■□□□ 1.51
LGMN-218ENST00000557694 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.44■■□□□ 1.5
LGMN-218ENST00000557694 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.43■■□□□ 1.5
LGMN-218ENST00000557694 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.4■■□□□ 1.5
LGMN-218ENST00000557694 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
LGMN-218ENST00000557694 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
LGMN-218ENST00000557694 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.39■■□□□ 1.49
LGMN-218ENST00000557694 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.39■■□□□ 1.49
LGMN-218ENST00000557694 PTPRTO14522 1441 aa24.37■■□□□ 1.49
LGMN-218ENST00000557694 MIA2Q96PC5 1412 aa24.36■■□□□ 1.49
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