RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557694.1

LGMN-218, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 2

Gene LGMN, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-218ENST00000557694 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.73■■■■□ 3.79
LGMN-218ENST00000557694 ABCC9O60706 1549 aa34.56■■■■□ 3.12
LGMN-218ENST00000557694 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.52■■■■□ 3.12
LGMN-218ENST00000557694 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.76■■■□□ 2.84
LGMN-218ENST00000557694 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.6■■■□□ 2.81
LGMN-218ENST00000557694 NACADO15069 1562 aa32.58■■■□□ 2.81
LGMN-218ENST00000557694 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.47■■■□□ 2.79
LGMN-218ENST00000557694 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.28■■■□□ 2.76
LGMN-218ENST00000557694 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.27■■■□□ 2.76
LGMN-218ENST00000557694 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.16■■■□□ 2.74
LGMN-218ENST00000557694 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
LGMN-218ENST00000557694 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.08■■■□□ 2.73
LGMN-218ENST00000557694 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.87■■■□□ 2.69
LGMN-218ENST00000557694 SCRIBQ14160 1630 aa31.67■■■□□ 2.66
LGMN-218ENST00000557694 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.24■■■□□ 2.59
LGMN-218ENST00000557694 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.18■■■□□ 2.58
LGMN-218ENST00000557694 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
LGMN-218ENST00000557694 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.01■■■□□ 2.56
LGMN-218ENST00000557694 SMARCA4P51532 1647 aa30.17■■■□□ 2.42
LGMN-218ENST00000557694 NCAPD3P42695 1498 aa30.17■■■□□ 2.42
LGMN-218ENST00000557694 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.17■■■□□ 2.42
LGMN-218ENST00000557694 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.97■■■□□ 2.39
LGMN-218ENST00000557694 SMARCA2P51531 1590 aa29.93■■■□□ 2.38
LGMN-218ENST00000557694 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
LGMN-218ENST00000557694 HMGXB3Q12766 1538 aa29.91■■■□□ 2.38
LGMN-218ENST00000557694 NESP48681 1621 aa29.84■■■□□ 2.37
LGMN-218ENST00000557694 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.82■■■□□ 2.36
LGMN-218ENST00000557694 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
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LGMN-218ENST00000557694 WIZO95785 1651 aa29.61■■■□□ 2.33
LGMN-218ENST00000557694 CUX2O14529 1486 aa29.48■■■□□ 2.31
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LGMN-218ENST00000557694 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.38■■■□□ 2.29
LGMN-218ENST00000557694 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.38■■■□□ 2.29
LGMN-218ENST00000557694 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.37■■■□□ 2.29
LGMN-218ENST00000557694 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
LGMN-218ENST00000557694 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.26■■■□□ 2.27
LGMN-218ENST00000557694 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.15■■■□□ 2.26
LGMN-218ENST00000557694 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
LGMN-218ENST00000557694 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.99■■■□□ 2.23
LGMN-218ENST00000557694 CFTRP13569 1480 aa28.98■■■□□ 2.23
LGMN-218ENST00000557694 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.95■■■□□ 2.22
LGMN-218ENST00000557694 WDR62O43379 1518 aa28.94■■■□□ 2.22
LGMN-218ENST00000557694 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.89■■■□□ 2.22
LGMN-218ENST00000557694 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.87■■■□□ 2.21
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LGMN-218ENST00000557694 PRDM2Q13029 1718 aa28.64■■■□□ 2.18
LGMN-218ENST00000557694 TOPBP1Q92547 1522 aa28.46■■■□□ 2.15
LGMN-218ENST00000557694 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
LGMN-218ENST00000557694 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.3■■■□□ 2.12
LGMN-218ENST00000557694 IFT140Q96RY7 1462 aa28.28■■■□□ 2.12
LGMN-218ENST00000557694 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
LGMN-218ENST00000557694 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
LGMN-218ENST00000557694 TRIM41Q8WV44 630 aa28.21■■■□□ 2.11
LGMN-218ENST00000557694 OSCARQ8IYS5 282 aa28.19■■■□□ 2.1
LGMN-218ENST00000557694 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
LGMN-218ENST00000557694 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
LGMN-218ENST00000557694 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
LGMN-218ENST00000557694 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.18■■■□□ 2.1
LGMN-218ENST00000557694 ABCC8Q09428 1581 aa28.16■■■□□ 2.1
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LGMN-218ENST00000557694 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.04■■■□□ 2.08
LGMN-218ENST00000557694 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
LGMN-218ENST00000557694 SOGA1O94964 1423 aa28.01■■■□□ 2.07
LGMN-218ENST00000557694 CHD1O14646 1710 aa27.98■■■□□ 2.07
LGMN-218ENST00000557694 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.96■■■□□ 2.07
LGMN-218ENST00000557694 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.96■■■□□ 2.07
LGMN-218ENST00000557694 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.96■■■□□ 2.07
LGMN-218ENST00000557694 ARHGEF11O15085 1522 aa27.86■■■□□ 2.05
LGMN-218ENST00000557694 WDR97A6NE52 1622 aa27.85■■■□□ 2.05
LGMN-218ENST00000557694 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.83■■■□□ 2.05
LGMN-218ENST00000557694 FBLN2P98095 1184 aa27.83■■■□□ 2.05
LGMN-218ENST00000557694 SYNJ1O43426 1573 aa27.71■■■□□ 2.03
LGMN-218ENST00000557694 GRIN2BQ13224 1484 aa27.69■■■□□ 2.02
LGMN-218ENST00000557694 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.67■■■□□ 2.02
LGMN-218ENST00000557694 ARAP1Q96P48 1450 aa27.67■■■□□ 2.02
LGMN-218ENST00000557694 PBRM1Q86U86 1689 aa27.66■■■□□ 2.02
LGMN-218ENST00000557694 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.66■■■□□ 2.02
LGMN-218ENST00000557694 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.66■■■□□ 2.02
LGMN-218ENST00000557694 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.66■■■□□ 2.02
LGMN-218ENST00000557694 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.64■■■□□ 2.02
LGMN-218ENST00000557694 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
LGMN-218ENST00000557694 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.61■■■□□ 2.01
LGMN-218ENST00000557694 TOP2BQ02880 1626 aa27.59■■■□□ 2.01
LGMN-218ENST00000557694 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.01
LGMN-218ENST00000557694 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
LGMN-218ENST00000557694 SYNJ2O15056 1496 aa27.58■■■□□ 2.01
LGMN-218ENST00000557694 ADAMTS12P58397 1594 aa27.43■■□□□ 1.98
LGMN-218ENST00000557694 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.42■■□□□ 1.98
LGMN-218ENST00000557694 CEP170Q5SW79 1584 aa27.39■■□□□ 1.97
LGMN-218ENST00000557694 GRIN2AQ12879 1464 aa27.38■■□□□ 1.97
LGMN-218ENST00000557694 NUP160Q12769 1436 aa27.31■■□□□ 1.96
LGMN-218ENST00000557694 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.27■■□□□ 1.96
LGMN-218ENST00000557694 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.26■■□□□ 1.96
LGMN-218ENST00000557694 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
LGMN-218ENST00000557694 SHROOM2Q13796 1616 aa27.17■■□□□ 1.94
LGMN-218ENST00000557694 IGF1RP08069 1367 aa27.1■■□□□ 1.93
LGMN-218ENST00000557694 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.04■■□□□ 1.92
LGMN-218ENST00000557694 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
LGMN-218ENST00000557694 JPH4Q96JJ6 628 aa27.01■■□□□ 1.91
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