RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556474.1

HECTD1-215, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1, human

TSL 3

Gene HECTD1, Length 1,046 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD1-215	ENST00000556474	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		29.42	■■■□□ 2.3
HECTD1-215	ENST00000556474	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		29.42	■■■□□ 2.3
HECTD1-215	ENST00000556474	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	29.41	■■■□□ 2.3
HECTD1-215	ENST00000556474	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		29.41	■■■□□ 2.3
HECTD1-215	ENST00000556474	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		29.41	■■■□□ 2.3
HECTD1-215	ENST00000556474	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		29.41	■■■□□ 2.3
HECTD1-215	ENST00000556474	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		29.4	■■■□□ 2.3
HECTD1-215	ENST00000556474	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		29.39	■■■□□ 2.3
HECTD1-215	ENST00000556474	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		29.39	■■■□□ 2.3
HECTD1-215	ENST00000556474	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		29.38	■■■□□ 2.29
HECTD1-215	ENST00000556474	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		29.38	■■■□□ 2.29
HECTD1-215	ENST00000556474	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		29.37	■■■□□ 2.29
HECTD1-215	ENST00000556474	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		29.37	■■■□□ 2.29
HECTD1-215	ENST00000556474	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		29.35	■■■□□ 2.29
HECTD1-215	ENST00000556474	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		29.35	■■■□□ 2.29
HECTD1-215	ENST00000556474	HSPA2	P54652	639 aa		29.33	■■■□□ 2.29
HECTD1-215	ENST00000556474	CEP162	Q5TB80	1403 aa		29.33	■■■□□ 2.29
HECTD1-215	ENST00000556474	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		29.3	■■■□□ 2.28
HECTD1-215	ENST00000556474	AFAP1	Q8N556	730 aa		29.3	■■■□□ 2.28
HECTD1-215	ENST00000556474	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		29.28	■■■□□ 2.28
HECTD1-215	ENST00000556474	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		29.25	■■■□□ 2.27
HECTD1-215	ENST00000556474	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		29.25	■■■□□ 2.27
HECTD1-215	ENST00000556474	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		29.25	■■■□□ 2.27
HECTD1-215	ENST00000556474	PREX2	Q70Z35	1606 aa		29.24	■■■□□ 2.27
HECTD1-215	ENST00000556474	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		29.21	■■■□□ 2.27
HECTD1-215	ENST00000556474	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
HECTD1-215	ENST00000556474	KDM5C	P41229	1560 aa		29.2	■■■□□ 2.26
HECTD1-215	ENST00000556474	ABCC1	P33527	1531 aa		29.17	■■■□□ 2.26
HECTD1-215	ENST00000556474	MLEC	Q14165	292 aa		29.17	■■■□□ 2.26
HECTD1-215	ENST00000556474	CERK	Q8TCT0	537 aa		29.16	■■■□□ 2.26
HECTD1-215	ENST00000556474	ATP10A	O60312	1499 aa		29.16	■■■□□ 2.26
HECTD1-215	ENST00000556474	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		29.15	■■■□□ 2.26
HECTD1-215	ENST00000556474	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		29.12	■■■□□ 2.25
HECTD1-215	ENST00000556474	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		29.12	■■■□□ 2.25
HECTD1-215	ENST00000556474	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		29.11	■■■□□ 2.25
HECTD1-215	ENST00000556474	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		29.09	■■■□□ 2.25
HECTD1-215	ENST00000556474	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		29.07	■■■□□ 2.24
HECTD1-215	ENST00000556474	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		29.07	■■■□□ 2.24
HECTD1-215	ENST00000556474	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
HECTD1-215	ENST00000556474	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		29.07	■■■□□ 2.24
HECTD1-215	ENST00000556474	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	29.06	■■■□□ 2.24
HECTD1-215	ENST00000556474	ABCA6	Q8N139	1617 aa		29.05	■■■□□ 2.24
HECTD1-215	ENST00000556474	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		29.04	■■■□□ 2.24
HECTD1-215	ENST00000556474	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
HECTD1-215	ENST00000556474	TIAM1	Q13009	1591 aa		29.02	■■■□□ 2.24
HECTD1-215	ENST00000556474	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		29.01	■■■□□ 2.24
HECTD1-215	ENST00000556474	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		29.01	■■■□□ 2.24
HECTD1-215	ENST00000556474	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		29.01	■■■□□ 2.23
HECTD1-215	ENST00000556474	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
HECTD1-215	ENST00000556474	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		28.99	■■■□□ 2.23
HECTD1-215	ENST00000556474	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.99	■■■□□ 2.23
HECTD1-215	ENST00000556474	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		28.98	■■■□□ 2.23
HECTD1-215	ENST00000556474	RERE	Q9P2R6	1566 aa		28.96	■■■□□ 2.23
HECTD1-215	ENST00000556474	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.96	■■■□□ 2.23
HECTD1-215	ENST00000556474	MBD5	Q9P267	1494 aa		28.93	■■■□□ 2.22
HECTD1-215	ENST00000556474	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
HECTD1-215	ENST00000556474	ILDR2	Q71H61	639 aa		28.93	■■■□□ 2.22
HECTD1-215	ENST00000556474	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		28.93	■■■□□ 2.22
HECTD1-215	ENST00000556474	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.91	■■■□□ 2.22
HECTD1-215	ENST00000556474	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
HECTD1-215	ENST00000556474	AGL	P35573	1532 aa		28.9	■■■□□ 2.22
HECTD1-215	ENST00000556474	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
HECTD1-215	ENST00000556474	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		28.86	■■■□□ 2.21
HECTD1-215	ENST00000556474	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		28.85	■■■□□ 2.21
HECTD1-215	ENST00000556474	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
HECTD1-215	ENST00000556474	SOCS7	O14512	581 aa		28.83	■■■□□ 2.21
HECTD1-215	ENST00000556474	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
HECTD1-215	ENST00000556474	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.82	■■■□□ 2.2
HECTD1-215	ENST00000556474	ATP7A	Q04656	1500 aa		28.82	■■■□□ 2.2
HECTD1-215	ENST00000556474	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.82	■■■□□ 2.2
HECTD1-215	ENST00000556474	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		28.81	■■■□□ 2.2
HECTD1-215	ENST00000556474	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		28.79	■■■□□ 2.2
HECTD1-215	ENST00000556474	MAP3K1	Q13233	1512 aa		28.79	■■■□□ 2.2
HECTD1-215	ENST00000556474	PLXNC1	O60486	1568 aa		28.76	■■■□□ 2.19
HECTD1-215	ENST00000556474	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		28.74	■■■□□ 2.19
HECTD1-215	ENST00000556474	A2M	P01023	1474 aa		28.73	■■■□□ 2.19
HECTD1-215	ENST00000556474	C3	P01024	1663 aa		28.72	■■■□□ 2.19
HECTD1-215	ENST00000556474	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		28.69	■■■□□ 2.18
HECTD1-215	ENST00000556474	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
HECTD1-215	ENST00000556474	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
HECTD1-215	ENST00000556474	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		28.65	■■■□□ 2.18
HECTD1-215	ENST00000556474	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		28.64	■■■□□ 2.17
HECTD1-215	ENST00000556474	PTPRT	O14522	1441 aa		28.63	■■■□□ 2.17
HECTD1-215	ENST00000556474	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
HECTD1-215	ENST00000556474	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		28.62	■■■□□ 2.17
HECTD1-215	ENST00000556474	ZMYM3	Q14202	1370 aa		28.62	■■■□□ 2.17
HECTD1-215	ENST00000556474	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		28.6	■■■□□ 2.17
HECTD1-215	ENST00000556474	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		28.6	■■■□□ 2.17
HECTD1-215	ENST00000556474	GGT6	Q6P531	493 aa		28.6	■■■□□ 2.17
HECTD1-215	ENST00000556474	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.59	■■■□□ 2.17
HECTD1-215	ENST00000556474	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.57	■■■□□ 2.16
HECTD1-215	ENST00000556474	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
HECTD1-215	ENST00000556474	MIA2	Q96PC5	1412 aa		28.56	■■■□□ 2.16
HECTD1-215	ENST00000556474	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.55	■■■□□ 2.16
HECTD1-215	ENST00000556474	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.52	■■■□□ 2.16
HECTD1-215	ENST00000556474	KIF3B	O15066	747 aa		28.5	■■■□□ 2.15
HECTD1-215	ENST00000556474	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.5	■■■□□ 2.15
HECTD1-215	ENST00000556474	TSPY4	P0CV99	314 aa		28.49	■■■□□ 2.15
HECTD1-215	ENST00000556474	TSPY10	P0CW01	314 aa		28.49	■■■□□ 2.15
HECTD1-215	ENST00000556474	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		28.49	■■■□□ 2.15

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