RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.82■■■□□ 2.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLIP1P30622 1438 aa31.73■■■□□ 2.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.71■■■□□ 2.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MLECQ14165 292 aa31.7■■■□□ 2.67
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIF14Q15058 1648 aa31.7■■■□□ 2.66
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP10AO60312 1499 aa31.69■■■□□ 2.66
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.69■■■□□ 2.66
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.65■■■□□ 2.66
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.65■■■□□ 2.66
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.65■■■□□ 2.66
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AFAP1Q8N556 730 aa31.64■■■□□ 2.66
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.64■■■□□ 2.66
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.63■■■□□ 2.65
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.63■■■□□ 2.65
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.59■■■□□ 2.65
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.59■■■□□ 2.65
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXO41Q8TF61 875 aa31.59■■■□□ 2.65
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.57■■■□□ 2.64
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSPA2P54652 639 aa31.56■■■□□ 2.64
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.54■■■□□ 2.64
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KDM5CP41229 1560 aa31.53■■■□□ 2.64
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.52■■■□□ 2.64
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.49■■■□□ 2.63
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.48■■■□□ 2.63
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.46■■■□□ 2.63
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.44■■■□□ 2.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PREX2Q70Z35 1606 aa31.44■■■□□ 2.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCC1P33527 1531 aa31.41■■■□□ 2.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 REREQ9P2R6 1566 aa31.41■■■□□ 2.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.41■■■□□ 2.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCA6Q8N139 1617 aa31.35■■■□□ 2.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AGLP35573 1532 aa31.34■■■□□ 2.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.33■■■□□ 2.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.33■■■□□ 2.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.3■■■□□ 2.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.27■■■□□ 2.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.26■■■□□ 2.6
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.26■■■□□ 2.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.26■■■□□ 2.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CERKQ8TCT0 537 aa31.25■■■□□ 2.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.24■■■□□ 2.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.23■■■□□ 2.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.23■■■□□ 2.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.22■■■□□ 2.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.21■■■□□ 2.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.2■■■□□ 2.59
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.19■■■□□ 2.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C3P01024 1663 aa31.16■■■□□ 2.58
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STRCQ7RTU9 1775 aa31.1■■■□□ 2.57
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP7AQ04656 1500 aa31.09■■■□□ 2.57
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZMYM3Q14202 1370 aa31.08■■■□□ 2.57
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A2MP01023 1474 aa31.06■■■□□ 2.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTPRTO14522 1441 aa31.05■■■□□ 2.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPATQ14207 1427 aa31.05■■■□□ 2.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEP162Q5TB80 1403 aa31.05■■■□□ 2.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.03■■■□□ 2.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.02■■■□□ 2.56
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GGT6Q6P531 493 aa31.01■■■□□ 2.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLXNC1O60486 1568 aa31■■■□□ 2.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MROH2AA6NES4 1674 aa31■■■□□ 2.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TIAM1Q13009 1591 aa31■■■□□ 2.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MBD5Q9P267 1494 aa30.99■■■□□ 2.55
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.95■■■□□ 2.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NCOA1Q15788 1441 aa30.95■■■□□ 2.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.92■■■□□ 2.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.9■■■□□ 2.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTPRKQ15262 1439 aa30.89■■■□□ 2.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NCOA2Q15596 1464 aa30.88■■■□□ 2.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.87■■■□□ 2.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.83■■■□□ 2.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.82■■■□□ 2.53
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIF3BO15066 747 aa30.81■■■□□ 2.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PKD2Q13563 968 aa30.81■■■□□ 2.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.8■■■□□ 2.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.8■■■□□ 2.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.78■■■□□ 2.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSPY4P0CV99 314 aa30.78■■■□□ 2.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSPY10P0CW01 314 aa30.78■■■□□ 2.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLA2R1Q13018 1463 aa30.77■■■□□ 2.52
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.76■■■□□ 2.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.74■■■□□ 2.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.74■■■□□ 2.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.72■■■□□ 2.51
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