RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.3■□□□□ 0.84
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AKNAQ7Z591 1439 aa20.27■□□□□ 0.84
SRP54-AS1-202ENST00000555015 APLP2Q06481 763 aa20.27■□□□□ 0.84
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NCOA2Q15596 1464 aa20.25■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RICTORQ6R327 1708 aa20.25■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.24■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.24■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ADGRL1O94910 1474 aa20.24■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.23■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.23■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ABCC1P33527 1531 aa20.2■□□□□ 0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.2■□□□□ 0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.17■□□□□ 0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.17■□□□□ 0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.16■□□□□ 0.82
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.14■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.13■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RAPGEF3O95398 923 aa20.13■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KDM5CP41229 1560 aa20.12■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.12■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.11■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.11■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.1■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.1■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.09■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.08■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MIA2Q96PC5 1412 aa20.08■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.08■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.07■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.05■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.03■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.03■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MBD5Q9P267 1494 aa20.02■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.02■□□□□ 0.8
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.01■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-202ENST00000555015 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AFAP1Q8N556 730 aa20.01■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.01■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ABCA6Q8N139 1617 aa19.99■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.792e-11■■■■■ 41.3
SRP54-AS1-202ENST00000555015 YEATS2Q9ULM3 1422 aa19.99■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC141Q6ZP82 1450 aa19.99■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa19.98■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATP7AQ04656 1500 aa19.97■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CROCC2H7BZ55 1655 aa19.96■□□□□ 0.79
SRP54-AS1-202ENST00000555015 REREQ9P2R6 1566 aa19.95■□□□□ 0.78
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATP10AO60312 1499 aa19.94■□□□□ 0.78
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa19.94■□□□□ 0.78
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RSPH4AQ5TD94 716 aa19.94■□□□□ 0.78
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ADGBQ8N7X0 1667 aa19.93■□□□□ 0.78
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19.93■□□□□ 0.78
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MAST1Q9Y2H9 1570 aa19.92■□□□□ 0.78
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa19.91■□□□□ 0.78
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.9■□□□□ 0.78
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BCORL1Q5H9F3 1711 aa19.89■□□□□ 0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SHANK2Q9UPX8 1470 aa19.88■□□□□ 0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLXNC1O60486 1568 aa19.87■□□□□ 0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AGLP35573 1532 aa19.85■□□□□ 0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DAPK1P53355 1430 aa19.85■□□□□ 0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ADAMTSL3P82987 1691 aa19.84■□□□□ 0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TSPY4P0CV99 314 aa19.84■□□□□ 0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TSPY10P0CW01 314 aa19.84■□□□□ 0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ABCC5O15440 1437 aa19.84■□□□□ 0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A2MP01023 1474 aa19.82■□□□□ 0.76
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.81■□□□□ 0.76
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa19.8■□□□□ 0.76
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MADDQ8WXG6 1647 aa19.79■□□□□ 0.76
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ADGRL2O95490 1459 aa19.75■□□□□ 0.75
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DUOX2Q9NRD8 1548 aa19.74■□□□□ 0.75
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.7■□□□□ 0.74
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIF15Q9NS87 1388 aa19.7■□□□□ 0.74
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NCOA1Q15788 1441 aa19.69■□□□□ 0.74
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MLECQ14165 292 aa19.69■□□□□ 0.74
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PTPRKQ15262 1439 aa19.68■□□□□ 0.74
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ERBINQ96RT1 1412 aa19.68■□□□□ 0.74
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MROH2AA6NES4 1674 aa19.67■□□□□ 0.74
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PTPRMP28827 1452 aa19.67■□□□□ 0.74
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM135AQ9P2D6 1515 aa19.66■□□□□ 0.74
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.66■□□□□ 0.74
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ROCK1Q13464 1354 aa19.66■□□□□ 0.74
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