RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.16■■■□□ 2.58
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.74■■■□□ 2.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ABCC9O60706 1549 aa26.84■■□□□ 1.89
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NACADO15069 1562 aa25.99■■□□□ 1.75
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.98■■□□□ 1.75
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.9■■□□□ 1.74
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.84■■□□□ 1.73
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.81■■□□□ 1.72
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.46■■□□□ 1.67
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SCRIBQ14160 1630 aa25.24■■□□□ 1.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.24■■□□□ 1.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.17■■□□□ 1.62
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.97■■□□□ 1.59
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.35■■□□□ 1.49
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.2■■□□□ 1.47
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SMARCA4P51532 1647 aa24.19■■□□□ 1.46
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.99■■□□□ 1.43
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SMARCA2P51531 1590 aa23.99■■□□□ 1.43
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.97■■□□□ 1.43
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.95■■□□□ 1.42
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NCAPD3P42695 1498 aa23.93■■□□□ 1.42
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HMGXB3Q12766 1538 aa23.89■■□□□ 1.41
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WIZO95785 1651 aa23.78■■□□□ 1.4
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.32■■□□□ 1.32
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NESP48681 1621 aa23.27■■□□□ 1.32
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.21■■□□□ 1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.21■■□□□ 1.31
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CFTRP13569 1480 aa23.14■■□□□ 1.29
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ERCC6Q03468 1493 aa23.14■■□□□ 1.29
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRDM2Q13029 1718 aa23.13■■□□□ 1.29
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.11■■□□□ 1.29
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.11■■□□□ 1.29
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.1■■□□□ 1.29
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CUX2O14529 1486 aa23.07■■□□□ 1.28
SRP54-AS1-202ENST00000555015 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.96■■□□□ 1.27
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.94■■□□□ 1.26
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.87■■□□□ 1.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WDR62O43379 1518 aa22.83■■□□□ 1.25
SRP54-AS1-202ENST00000555015 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ABCC8Q09428 1581 aa22.66■■□□□ 1.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.66■■□□□ 1.22
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TOPBP1Q92547 1522 aa22.62■■□□□ 1.21
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CUX1P39880 1505 aa22.52■■□□□ 1.19
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IFT140Q96RY7 1462 aa22.45■■□□□ 1.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.43■■□□□ 1.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.41■■□□□ 1.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TOP2BQ02880 1626 aa22.41■■□□□ 1.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SYNJ1O43426 1573 aa22.39■■□□□ 1.18
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WDR97A6NE52 1622 aa22.32■■□□□ 1.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SOGA1O94964 1423 aa22.31■■□□□ 1.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.3■■□□□ 1.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.24■■□□□ 1.15
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.21■■□□□ 1.15
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.141e-6■■■■□ 25.1
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.17■■□□□ 1.14
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PBRM1Q86U86 1689 aa22.14■■□□□ 1.13
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.09■■□□□ 1.13
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRIM41Q8WV44 630 aa22.08■■□□□ 1.13
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GRIN2BQ13224 1484 aa22.07■■□□□ 1.12
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CHD1O14646 1710 aa22.02■■□□□ 1.12
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.02■■□□□ 1.12
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.98■■□□□ 1.11
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIF27Q86VH2 1401 aa21.94■■□□□ 1.1
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ADAMTS12P58397 1594 aa21.93■■□□□ 1.1
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.92■■□□□ 1.1
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.92■■□□□ 1.1
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.92■■□□□ 1.1
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SYNJ2O15056 1496 aa21.92■■□□□ 1.1
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OSCARQ8IYS5 282 aa21.87■■□□□ 1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CUL7Q14999 1698 aa21.85■■□□□ 1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.84■■□□□ 1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FBLN2P98095 1184 aa21.83■■□□□ 1.09
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GRIN2AQ12879 1464 aa21.8■■□□□ 1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGF1RP08069 1367 aa21.78■■□□□ 1.08
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARHGEF11O15085 1522 aa21.74■■□□□ 1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.74■■□□□ 1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.74■■□□□ 1.07
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CEP170Q5SW79 1584 aa21.7■■□□□ 1.06
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NUP160Q12769 1436 aa21.69■■□□□ 1.06
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.66■■□□□ 1.06
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EEA1Q15075 1411 aa21.64■■□□□ 1.06
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms