RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548847.1

SLC25A3-211, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-211ENST00000548847 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.53■■■□□ 2.48
SLC25A3-211ENST00000548847 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.52■■■□□ 2.48
SLC25A3-211ENST00000548847 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.52■■■□□ 2.48
SLC25A3-211ENST00000548847 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.51■■■□□ 2.47
SLC25A3-211ENST00000548847 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.5■■■□□ 2.47
SLC25A3-211ENST00000548847 TIAM1Q13009 1591 aa30.48■■■□□ 2.47
SLC25A3-211ENST00000548847 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.48■■■□□ 2.47
SLC25A3-211ENST00000548847 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.48■■■□□ 2.47
SLC25A3-211ENST00000548847 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
SLC25A3-211ENST00000548847 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.42■■■□□ 2.46
SLC25A3-211ENST00000548847 ABCC1P33527 1531 aa30.41■■■□□ 2.46
SLC25A3-211ENST00000548847 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
SLC25A3-211ENST00000548847 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.39■■■□□ 2.46
SLC25A3-211ENST00000548847 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.38■■■□□ 2.45
SLC25A3-211ENST00000548847 MAP3K1Q13233 1512 aa30.37■■■□□ 2.45
SLC25A3-211ENST00000548847 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.37■■■□□ 2.45
SLC25A3-211ENST00000548847 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.36■■■□□ 2.45
SLC25A3-211ENST00000548847 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.36■■■□□ 2.45
SLC25A3-211ENST00000548847 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.35■■■□□ 2.45
SLC25A3-211ENST00000548847 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.35■■■□□ 2.45
SLC25A3-211ENST00000548847 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.35■■■□□ 2.45
SLC25A3-211ENST00000548847 KDM5CP41229 1560 aa30.35■■■□□ 2.45
SLC25A3-211ENST00000548847 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.34■■■□□ 2.45
SLC25A3-211ENST00000548847 AFAP1Q8N556 730 aa30.33■■■□□ 2.45
SLC25A3-211ENST00000548847 NCOA2Q15596 1464 aa30.33■■■□□ 2.45
SLC25A3-211ENST00000548847 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
SLC25A3-211ENST00000548847 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.32■■■□□ 2.44
SLC25A3-211ENST00000548847 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
SLC25A3-211ENST00000548847 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
SLC25A3-211ENST00000548847 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
SLC25A3-211ENST00000548847 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.27■■■□□ 2.44
SLC25A3-211ENST00000548847 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.27■■■□□ 2.44
SLC25A3-211ENST00000548847 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.24■■■□□ 2.43
SLC25A3-211ENST00000548847 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.23■■■□□ 2.43
SLC25A3-211ENST00000548847 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.23■■■□□ 2.43
SLC25A3-211ENST00000548847 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.21■■■□□ 2.43
SLC25A3-211ENST00000548847 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
SLC25A3-211ENST00000548847 ATP10AO60312 1499 aa30.2■■■□□ 2.43
SLC25A3-211ENST00000548847 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.2■■■□□ 2.42
SLC25A3-211ENST00000548847 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.19■■■□□ 2.42
SLC25A3-211ENST00000548847 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.19■■■□□ 2.42
SLC25A3-211ENST00000548847 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.18■■■□□ 2.42
SLC25A3-211ENST00000548847 ABCA6Q8N139 1617 aa30.17■■■□□ 2.42
SLC25A3-211ENST00000548847 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
SLC25A3-211ENST00000548847 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.16■■■□□ 2.42
SLC25A3-211ENST00000548847 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.16■■■□□ 2.42
SLC25A3-211ENST00000548847 MBD5Q9P267 1494 aa30.15■■■□□ 2.42
SLC25A3-211ENST00000548847 APLP2Q06481 763 aa30.12■■■□□ 2.41
SLC25A3-211ENST00000548847 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.11■■■□□ 2.41
SLC25A3-211ENST00000548847 REREQ9P2R6 1566 aa30.1■■■□□ 2.41
SLC25A3-211ENST00000548847 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.09■■■□□ 2.41
SLC25A3-211ENST00000548847 MADDQ8WXG6 1647 aa30.08■■■□□ 2.41
SLC25A3-211ENST00000548847 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
SLC25A3-211ENST00000548847 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
SLC25A3-211ENST00000548847 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.06■■■□□ 2.4
SLC25A3-211ENST00000548847 ATP7AQ04656 1500 aa30.05■■■□□ 2.4
SLC25A3-211ENST00000548847 PTPRMP28827 1452 aa30.02■■■□□ 2.4
SLC25A3-211ENST00000548847 MIA2Q96PC5 1412 aa30.01■■■□□ 2.39
SLC25A3-211ENST00000548847 AGLP35573 1532 aa29.99■■■□□ 2.39
SLC25A3-211ENST00000548847 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.99■■■□□ 2.39
SLC25A3-211ENST00000548847 MLECQ14165 292 aa29.99■■■□□ 2.39
SLC25A3-211ENST00000548847 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.98■■■□□ 2.39
SLC25A3-211ENST00000548847 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
SLC25A3-211ENST00000548847 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.94■■■□□ 2.38
SLC25A3-211ENST00000548847 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.93■■■□□ 2.38
SLC25A3-211ENST00000548847 PLXNC1O60486 1568 aa29.93■■■□□ 2.38
SLC25A3-211ENST00000548847 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.92■■■□□ 2.38
SLC25A3-211ENST00000548847 A2MP01023 1474 aa29.9■■■□□ 2.38
SLC25A3-211ENST00000548847 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.89■■■□□ 2.37
SLC25A3-211ENST00000548847 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.88■■■□□ 2.37
SLC25A3-211ENST00000548847 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.87■■■□□ 2.37
SLC25A3-211ENST00000548847 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
SLC25A3-211ENST00000548847 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.82■■■□□ 2.36
SLC25A3-211ENST00000548847 TSPY4P0CV99 314 aa29.8■■■□□ 2.36
SLC25A3-211ENST00000548847 TSPY10P0CW01 314 aa29.8■■■□□ 2.36
SLC25A3-211ENST00000548847 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
SLC25A3-211ENST00000548847 ABCC5O15440 1437 aa29.77■■■□□ 2.36
SLC25A3-211ENST00000548847 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.74■■■□□ 2.35
SLC25A3-211ENST00000548847 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
SLC25A3-211ENST00000548847 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.73■■■□□ 2.35
SLC25A3-211ENST00000548847 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.72■■■□□ 2.35
SLC25A3-211ENST00000548847 DAPK1P53355 1430 aa29.72■■■□□ 2.35
SLC25A3-211ENST00000548847 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
SLC25A3-211ENST00000548847 C3P01024 1663 aa29.69■■■□□ 2.34
SLC25A3-211ENST00000548847 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.69■■■□□ 2.34
SLC25A3-211ENST00000548847 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
SLC25A3-211ENST00000548847 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.67■■■□□ 2.34
SLC25A3-211ENST00000548847 GGT6Q6P531 493 aa29.66■■■□□ 2.34
SLC25A3-211ENST00000548847 MROH2AA6NES4 1674 aa29.65■■■□□ 2.34
SLC25A3-211ENST00000548847 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
SLC25A3-211ENST00000548847 KIF3BO15066 747 aa29.64■■■□□ 2.33
SLC25A3-211ENST00000548847 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
SLC25A3-211ENST00000548847 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
SLC25A3-211ENST00000548847 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.6■■■□□ 2.33
SLC25A3-211ENST00000548847 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.59■■■□□ 2.33
SLC25A3-211ENST00000548847 ZMYM3Q14202 1370 aa29.59■■■□□ 2.33
SLC25A3-211ENST00000548847 KIF15Q9NS87 1388 aa29.58■■■□□ 2.33
SLC25A3-211ENST00000548847 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
SLC25A3-211ENST00000548847 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
SLC25A3-211ENST00000548847 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.55■■■□□ 2.32
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