RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546023.1

TCP1-217, Transcript of t-complex 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TCP1, Length 1,135 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1-217ENST00000546023 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.45■■■■■ 4.07
TCP1-217ENST00000546023 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.43■■■■■ 4.06
TCP1-217ENST00000546023 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.43■■■■■ 4.06
TCP1-217ENST00000546023 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
TCP1-217ENST00000546023 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.42■■■■■ 4.06
TCP1-217ENST00000546023 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.41■■■■■ 4.06
TCP1-217ENST00000546023 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.4■■■■■ 4.06
TCP1-217ENST00000546023 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.39■■■■■ 4.06
TCP1-217ENST00000546023 TIAM1Q13009 1591 aa40.37■■■■■ 4.05
TCP1-217ENST00000546023 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.33■■■■■ 4.05
TCP1-217ENST00000546023 ABCC1P33527 1531 aa40.31■■■■■ 4.04
TCP1-217ENST00000546023 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.28■■■■■ 4.04
TCP1-217ENST00000546023 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
TCP1-217ENST00000546023 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.26■■■■■ 4.04
TCP1-217ENST00000546023 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.26■■■■■ 4.03
TCP1-217ENST00000546023 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.24■■■■■ 4.03
TCP1-217ENST00000546023 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.23■■■■■ 4.03
TCP1-217ENST00000546023 KDM5CP41229 1560 aa40.23■■■■■ 4.03
TCP1-217ENST00000546023 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
TCP1-217ENST00000546023 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.21■■■■■ 4.03
TCP1-217ENST00000546023 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.18■■■■■ 4.02
TCP1-217ENST00000546023 MAP3K1Q13233 1512 aa40.18■■■■■ 4.02
TCP1-217ENST00000546023 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.15■■■■■ 4.02
TCP1-217ENST00000546023 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.15■■■■■ 4.02
TCP1-217ENST00000546023 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.14■■■■■ 4.02
TCP1-217ENST00000546023 NCOA2Q15596 1464 aa40.13■■■■■ 4.02
TCP1-217ENST00000546023 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.12■■■■■ 4.01
TCP1-217ENST00000546023 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.09■■■■■ 4.01
TCP1-217ENST00000546023 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
TCP1-217ENST00000546023 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
TCP1-217ENST00000546023 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.07■■■■■ 4.01
TCP1-217ENST00000546023 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.06■■■■■ 4
TCP1-217ENST00000546023 AFAP1Q8N556 730 aa40.06■■■■■ 4
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TCP1-217ENST00000546023 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.02■■■■■ 4
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TCP1-217ENST00000546023 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.01■■■■□ 3.99
TCP1-217ENST00000546023 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40■■■■□ 3.99
TCP1-217ENST00000546023 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40■■■■□ 3.99
TCP1-217ENST00000546023 ATP10AO60312 1499 aa40■■■■□ 3.99
TCP1-217ENST00000546023 ABCA6Q8N139 1617 aa39.99■■■■□ 3.99
TCP1-217ENST00000546023 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.94■■■■□ 3.98
TCP1-217ENST00000546023 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
TCP1-217ENST00000546023 MADDQ8WXG6 1647 aa39.93■■■■□ 3.98
TCP1-217ENST00000546023 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.92■■■■□ 3.98
TCP1-217ENST00000546023 APLP2Q06481 763 aa39.91■■■■□ 3.98
TCP1-217ENST00000546023 REREQ9P2R6 1566 aa39.91■■■■□ 3.98
TCP1-217ENST00000546023 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.89■■■■□ 3.98
TCP1-217ENST00000546023 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.89■■■■□ 3.98
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TCP1-217ENST00000546023 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
TCP1-217ENST00000546023 ATP7AQ04656 1500 aa39.86■■■■□ 3.97
TCP1-217ENST00000546023 MBD5Q9P267 1494 aa39.82■■■■□ 3.97
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TCP1-217ENST00000546023 AGLP35573 1532 aa39.74■■■■□ 3.95
TCP1-217ENST00000546023 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.72■■■■□ 3.95
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TCP1-217ENST00000546023 MLECQ14165 292 aa39.71■■■■□ 3.95
TCP1-217ENST00000546023 PLXNC1O60486 1568 aa39.66■■■■□ 3.94
TCP1-217ENST00000546023 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.65■■■■□ 3.94
TCP1-217ENST00000546023 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.64■■■■□ 3.94
TCP1-217ENST00000546023 A2MP01023 1474 aa39.62■■■■□ 3.93
TCP1-217ENST00000546023 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.58■■■■□ 3.93
TCP1-217ENST00000546023 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.57■■■■□ 3.92
TCP1-217ENST00000546023 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.53■■■■□ 3.92
TCP1-217ENST00000546023 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.52■■■■□ 3.92
TCP1-217ENST00000546023 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
TCP1-217ENST00000546023 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.46■■■■□ 3.91
TCP1-217ENST00000546023 TSPY4P0CV99 314 aa39.44■■■■□ 3.9
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TCP1-217ENST00000546023 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.41■■■■□ 3.9
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TCP1-217ENST00000546023 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.39■■■■□ 3.9
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TCP1-217ENST00000546023 MROH2AA6NES4 1674 aa39.35■■■■□ 3.89
TCP1-217ENST00000546023 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.33■■■■□ 3.89
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TCP1-217ENST00000546023 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.27■■■■□ 3.88
TCP1-217ENST00000546023 GGT6Q6P531 493 aa39.26■■■■□ 3.88
TCP1-217ENST00000546023 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
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TCP1-217ENST00000546023 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.21■■■■□ 3.87
TCP1-217ENST00000546023 KIF3BO15066 747 aa39.2■■■■□ 3.87
TCP1-217ENST00000546023 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP39.2■■■■□ 3.87
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TCP1-217ENST00000546023 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.16■■■■□ 3.86
TCP1-217ENST00000546023 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.16■■■■□ 3.86
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