RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545882.5

CNN3-207, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,902 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-207ENST00000545882 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.43■■□□□ 1.02
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CNN3-207ENST00000545882 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.32■■□□□ 1
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CNN3-207ENST00000545882 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.84■□□□□ 0.93
CNN3-207ENST00000545882 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.93
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CNN3-207ENST00000545882 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-207ENST00000545882 KIF15Q9NS87 1388 aa20.81■□□□□ 0.92
CNN3-207ENST00000545882 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.81■□□□□ 0.926e-8■■■□□ 17.8
CNN3-207ENST00000545882 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
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