RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544253.1

ANKRD49-208, Transcript of ankyrin repeat domain 49, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD49, Length 3,002 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD49-208ENST00000544253 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
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ANKRD49-208ENST00000544253 MLH3Q9UHC1 1453 aa9.6□□□□□ -0.87
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ANKRD49-208ENST00000544253 MYO3AQ8NEV4 1616 aa9.4□□□□□ -0.91
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ANKRD49-208ENST00000544253 PLA2R1Q13018 1463 aa9.39□□□□□ -0.91
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ANKRD49-208ENST00000544253 FBXO41Q8TF61 875 aa9.36□□□□□ -0.91
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ANKRD49-208ENST00000544253 DEPDC5O75140 1603 aa9.35□□□□□ -0.91
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ANKRD49-208ENST00000544253 ARID3CA6NKF2 412 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD49-208ENST00000544253 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.34□□□□□ -0.91
ANKRD49-208ENST00000544253 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
ANKRD49-208ENST00000544253 NCOA1Q15788 1441 aa9.33□□□□□ -0.92
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ANKRD49-208ENST00000544253 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
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ANKRD49-208ENST00000544253 PZPP20742 1482 aa9.32□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 LTBP4Q8N2S1 1624 aa9.31□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.31□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 A2ML1A8K2U0 1454 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 NLRP1Q9C000 1473 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 LMTK2Q8IWU2 1503 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 DUOX2Q9NRD8 1548 aa9.29□□□□□ -0.92
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