RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRIM41Q8WV44 630 aa9.48□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.46□□□□□ -0.89
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PKD2Q13563 968 aa9.42□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRDM2Q13029 1718 aa9.41□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTGER2P43116 358 aa9.39□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ERBB3P21860 1342 aa9.38□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.36□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.35□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.34□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa9.34□□□□□ -0.91
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GOLGA2Q08379 1002 aa9.34□□□□□ -0.92
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CFTRP13569 1480 aa9.33□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RGL2O15211 777 aa9.3□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYT1Q01538 1121 aa9.3□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DOK7Q18PE1 504 aa9.3□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.28□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PSEN1P49768 467 aa9.28□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NESP48681 1621 aa9.26□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.26□□□□□ -0.93
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FANCD2Q9BXW9 1451 aa9.25□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.24□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa9.23□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CEP164Q9UPV0 1460 aa9.23□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.2□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ERCC6Q03468 1493 aa9.19□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TOP2BQ02880 1626 aa9.19□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa9.19□□□□□ -0.94
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STK25O00506 426 aa9.17□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CABP2Q9NPB3 220 aa9.17□□□□□ -0.94
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.15□□□□□ -0.94
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STK24Q9Y6E0 443 aa9.14□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.14□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRC2Q9UBG0 1479 aa9.13□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TOPBP1Q92547 1522 aa9.12□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.11□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.1□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.1□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EEA1Q15075 1411 aa9.09□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FGD5Q6ZNL6 1462 aa9.09□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HCSTQ9UBK5 93 aa9.09□□□□□ -0.95
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SOGA1O94964 1423 aa9.07□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WDR62O43379 1518 aa9.07□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIF27Q86VH2 1401 aa9.05□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SOX12O15370 315 aa9.04□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CUX2O14529 1486 aa9.03□□□□□ -0.96
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.02□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.02□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPR153Q6NV75 609 aa9.01□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa9.01□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.01□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IFT140Q96RY7 1462 aa9.01□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WDR97A6NE52 1622 aa9.01□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NLRP6P59044 892 aa9□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MFRPQ9BY79 579 aa9□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.99□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RGS20O76081 388 aa8.98□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.97□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PBX2P40425 430 aa8.97□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.96□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PBRM1Q86U86 1689 aa8.96□□□□□ -0.97
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.96□□□□□ -0.98
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