RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531092.5

GMDS-AS1-208, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 744 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.63■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.62■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HECW1Q76N89 1606 aa22.61■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.59■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ATP10AO60312 1499 aa22.54■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PTPRTO14522 1441 aa22.53■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.52■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-208ENST00000531092 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.51■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.51■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-208ENST00000531092 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.5■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PLCH2O75038 1416 aa22.46■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-208ENST00000531092 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.46■■□□□ 1.19
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-208ENST00000531092 C3P01024 1663 aa22.36■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NCOA1Q15788 1441 aa22.35■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-208ENST00000531092 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.35■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.35■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-208ENST00000531092 AFAP1Q8N556 730 aa22.33■■□□□ 1.17
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.32■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.32■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KDM5CP41229 1560 aa22.32■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.3■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-208ENST00000531092 REREQ9P2R6 1566 aa22.29■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.29■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-208ENST00000531092 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.28■■□□□ 1.16
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-208ENST00000531092 AGLP35573 1532 aa22.24■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.24■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ABCA6Q8N139 1617 aa22.24■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.23■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.22■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.21■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KIF14Q15058 1648 aa22.2■■□□□ 1.15
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.19■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.18■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NPATQ14207 1427 aa22.16■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HSPA1LP34931 641 aa22.12■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ZMYM3Q14202 1370 aa22.11■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PKD2Q13563 968 aa22.1■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.1■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MROH2AA6NES4 1674 aa22.1■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PLA2R1Q13018 1463 aa22.09■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.09■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ABCC1P33527 1531 aa22.07■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-208ENST00000531092 EEA1Q15075 1411 aa22.06■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FMN1Q68DA7 1419 aa22.05■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CLIP1P30622 1438 aa22.04■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.04■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.03■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PIP4K2BP78356 416 aa22.02■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.02■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PREX2Q70Z35 1606 aa22.01■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PTPRKQ15262 1439 aa22■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TOM1O60784 492 aa21.98■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.97■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.96■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.95■■□□□ 1.11
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CPS1P31327 1500 aa21.93■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.9■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.89■■□□□ 1.1
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ALKQ9UM73 1620 aa21.89■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PLXNC1O60486 1568 aa21.89■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-208ENST00000531092 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.89■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.87■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GGT6Q6P531 493 aa21.86■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-208ENST00000531092 A2MP01023 1474 aa21.85■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.85■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.091e-6■■■■□ 20.7
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ATP7AQ04656 1500 aa21.84■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-208ENST00000531092 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-208ENST00000531092 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
GMDS-AS1-208ENST00000531092 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.82■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-208ENST00000531092 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.81■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-208ENST00000531092 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.77■■□□□ 1.08
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.76■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.75■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.74■■□□□ 1.07
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