RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530613.5

SERGEF-213, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 5

Gene SERGEF, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-213ENST00000530613 PTPRMP28827 1452 aa35.86■■■■□ 3.33
SERGEF-213ENST00000530613 CLIP1P30622 1438 aa35.86■■■■□ 3.33
SERGEF-213ENST00000530613 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.86■■■■□ 3.33
SERGEF-213ENST00000530613 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.83■■■■□ 3.33
SERGEF-213ENST00000530613 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.83■■■■□ 3.33
SERGEF-213ENST00000530613 MADDQ8WXG6 1647 aa35.83■■■■□ 3.33
SERGEF-213ENST00000530613 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.83■■■■□ 3.33
SERGEF-213ENST00000530613 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.82■■■■□ 3.32
SERGEF-213ENST00000530613 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.81■■■■□ 3.32
SERGEF-213ENST00000530613 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.8■■■■□ 3.32
SERGEF-213ENST00000530613 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.78■■■■□ 3.32
SERGEF-213ENST00000530613 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.74■■■■□ 3.31
SERGEF-213ENST00000530613 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
SERGEF-213ENST00000530613 AFAP1Q8N556 730 aa35.68■■■■□ 3.3
SERGEF-213ENST00000530613 PREX2Q70Z35 1606 aa35.68■■■■□ 3.3
SERGEF-213ENST00000530613 ATP10AO60312 1499 aa35.67■■■■□ 3.3
SERGEF-213ENST00000530613 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.66■■■■□ 3.3
SERGEF-213ENST00000530613 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.65■■■■□ 3.3
SERGEF-213ENST00000530613 MLECQ14165 292 aa35.64■■■■□ 3.3
SERGEF-213ENST00000530613 KDM5CP41229 1560 aa35.62■■■■□ 3.29
SERGEF-213ENST00000530613 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.58■■■■□ 3.29
SERGEF-213ENST00000530613 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.58■■■■□ 3.29
SERGEF-213ENST00000530613 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.58■■■■□ 3.29
SERGEF-213ENST00000530613 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.55■■■■□ 3.28
SERGEF-213ENST00000530613 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.55■■■■□ 3.28
SERGEF-213ENST00000530613 ABCC1P33527 1531 aa35.55■■■■□ 3.28
SERGEF-213ENST00000530613 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.55■■■■□ 3.28
SERGEF-213ENST00000530613 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.54■■■■□ 3.28
SERGEF-213ENST00000530613 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.5■■■■□ 3.27
SERGEF-213ENST00000530613 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.49■■■■□ 3.27
SERGEF-213ENST00000530613 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.49■■■■□ 3.27
SERGEF-213ENST00000530613 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
SERGEF-213ENST00000530613 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
SERGEF-213ENST00000530613 ABCA6Q8N139 1617 aa35.46■■■■□ 3.27
SERGEF-213ENST00000530613 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
SERGEF-213ENST00000530613 CEP162Q5TB80 1403 aa35.45■■■■□ 3.27
SERGEF-213ENST00000530613 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.43■■■■□ 3.26
SERGEF-213ENST00000530613 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.43■■■■□ 3.26
SERGEF-213ENST00000530613 REREQ9P2R6 1566 aa35.41■■■■□ 3.26
SERGEF-213ENST00000530613 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.4■■■■□ 3.26
SERGEF-213ENST00000530613 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.37■■■■□ 3.257e-7■■■□□ 17
SERGEF-213ENST00000530613 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
SERGEF-213ENST00000530613 HSPA2P54652 639 aa35.35■■■■□ 3.25
SERGEF-213ENST00000530613 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
SERGEF-213ENST00000530613 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.35■■■■□ 3.25
SERGEF-213ENST00000530613 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.35■■■■□ 3.25
SERGEF-213ENST00000530613 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.32■■■■□ 3.24
SERGEF-213ENST00000530613 AGLP35573 1532 aa35.31■■■■□ 3.24
SERGEF-213ENST00000530613 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
SERGEF-213ENST00000530613 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.27■■■■□ 3.24
SERGEF-213ENST00000530613 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.27■■■■□ 3.24
SERGEF-213ENST00000530613 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
SERGEF-213ENST00000530613 TIAM1Q13009 1591 aa35.25■■■■□ 3.23
SERGEF-213ENST00000530613 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.25■■■■□ 3.23
SERGEF-213ENST00000530613 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.23■■■■□ 3.23
SERGEF-213ENST00000530613 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
SERGEF-213ENST00000530613 C3P01024 1663 aa35.2■■■■□ 3.23
SERGEF-213ENST00000530613 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
SERGEF-213ENST00000530613 ATP7AQ04656 1500 aa35.17■■■■□ 3.22
SERGEF-213ENST00000530613 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
SERGEF-213ENST00000530613 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
SERGEF-213ENST00000530613 MBD5Q9P267 1494 aa35.1■■■■□ 3.21
SERGEF-213ENST00000530613 NCOA2Q15596 1464 aa35.09■■■■□ 3.21
SERGEF-213ENST00000530613 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.07■■■■□ 3.21
SERGEF-213ENST00000530613 A2MP01023 1474 aa35.07■■■■□ 3.2
SERGEF-213ENST00000530613 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.06■■■■□ 3.2
SERGEF-213ENST00000530613 PLXNC1O60486 1568 aa35.05■■■■□ 3.2
SERGEF-213ENST00000530613 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.05■■■■□ 3.2
SERGEF-213ENST00000530613 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.03■■■■□ 3.2
SERGEF-213ENST00000530613 FBXO41Q8TF61 875 aa35.03■■■■□ 3.2
SERGEF-213ENST00000530613 STRCQ7RTU9 1775 aa35.02■■■■□ 3.2
SERGEF-213ENST00000530613 MROH2AA6NES4 1674 aa35.01■■■■□ 3.19
SERGEF-213ENST00000530613 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
SERGEF-213ENST00000530613 ZMYM3Q14202 1370 aa34.97■■■■□ 3.19
SERGEF-213ENST00000530613 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.97■■■■□ 3.19
SERGEF-213ENST00000530613 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.97■■■■□ 3.19
SERGEF-213ENST00000530613 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.96■■■■□ 3.19
SERGEF-213ENST00000530613 GGT6Q6P531 493 aa34.95■■■■□ 3.19
SERGEF-213ENST00000530613 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
SERGEF-213ENST00000530613 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.9■■■■□ 3.18
SERGEF-213ENST00000530613 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.89■■■■□ 3.18
SERGEF-213ENST00000530613 NPATQ14207 1427 aa34.88■■■■□ 3.17
SERGEF-213ENST00000530613 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
SERGEF-213ENST00000530613 MAP3K1Q13233 1512 aa34.87■■■■□ 3.17
SERGEF-213ENST00000530613 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.85■■■■□ 3.17
SERGEF-213ENST00000530613 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.83■■■■□ 3.17
SERGEF-213ENST00000530613 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.83■■■■□ 3.17
SERGEF-213ENST00000530613 CERKQ8TCT0 537 aa34.82■■■■□ 3.16
SERGEF-213ENST00000530613 KIF3BO15066 747 aa34.78■■■■□ 3.16
SERGEF-213ENST00000530613 PTPRKQ15262 1439 aa34.78■■■■□ 3.16
SERGEF-213ENST00000530613 TSPY4P0CV99 314 aa34.77■■■■□ 3.16
SERGEF-213ENST00000530613 TSPY10P0CW01 314 aa34.77■■■■□ 3.16
SERGEF-213ENST00000530613 PTPRTO14522 1441 aa34.74■■■■□ 3.15
SERGEF-213ENST00000530613 NCOA1Q15788 1441 aa34.72■■■■□ 3.15
SERGEF-213ENST00000530613 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.72■■■■□ 3.15
SERGEF-213ENST00000530613 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.71■■■■□ 3.15
SERGEF-213ENST00000530613 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.71■■■■□ 3.15
SERGEF-213ENST00000530613 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
SERGEF-213ENST00000530613 MIA2Q96PC5 1412 aa34.68■■■■□ 3.14
SERGEF-213ENST00000530613 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.66■■■■□ 3.14
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