RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525507.5

PPP5C-211, Transcript of protein phosphatase 5 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP5C, Length 1,300 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP5C-211	ENST00000525507	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.2	■■■□□ 2.74
PPP5C-211	ENST00000525507	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
PPP5C-211	ENST00000525507	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
PPP5C-211	ENST00000525507	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PPP5C-211	ENST00000525507	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP5C-211	ENST00000525507	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP5C-211	ENST00000525507	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
PPP5C-211	ENST00000525507	KIF14	Q15058	1648 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PPP5C-211	ENST00000525507	ATP10A	O60312	1499 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PPP5C-211	ENST00000525507	CLIP1	P30622	1438 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PPP5C-211	ENST00000525507	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PPP5C-211	ENST00000525507	MLEC	Q14165	292 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PPP5C-211	ENST00000525507	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PPP5C-211	ENST00000525507	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PPP5C-211	ENST00000525507	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PPP5C-211	ENST00000525507	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PPP5C-211	ENST00000525507	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32	■■■□□ 2.71
PPP5C-211	ENST00000525507	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP5C-211	ENST00000525507	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP5C-211	ENST00000525507	AFAP1	Q8N556	730 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP5C-211	ENST00000525507	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PPP5C-211	ENST00000525507	KDM5C	P41229	1560 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PPP5C-211	ENST00000525507	HSPA2	P54652	639 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PPP5C-211	ENST00000525507	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PPP5C-211	ENST00000525507	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PPP5C-211	ENST00000525507	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PPP5C-211	ENST00000525507	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PPP5C-211	ENST00000525507	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PPP5C-211	ENST00000525507	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PPP5C-211	ENST00000525507	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PPP5C-211	ENST00000525507	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.82	■■■□□ 2.69
PPP5C-211	ENST00000525507	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
PPP5C-211	ENST00000525507	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PPP5C-211	ENST00000525507	ABCC1	P33527	1531 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PPP5C-211	ENST00000525507	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PPP5C-211	ENST00000525507	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PPP5C-211	ENST00000525507	AGL	P35573	1532 aa		31.76	■■■□□ 2.68
PPP5C-211	ENST00000525507	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PPP5C-211	ENST00000525507	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PPP5C-211	ENST00000525507	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
PPP5C-211	ENST00000525507	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PPP5C-211	ENST00000525507	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
PPP5C-211	ENST00000525507	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PPP5C-211	ENST00000525507	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PPP5C-211	ENST00000525507	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
PPP5C-211	ENST00000525507	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
PPP5C-211	ENST00000525507	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PPP5C-211	ENST00000525507	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PPP5C-211	ENST00000525507	C3	P01024	1663 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PPP5C-211	ENST00000525507	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP5C-211	ENST00000525507	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP5C-211	ENST00000525507	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.59	■■■□□ 2.65
PPP5C-211	ENST00000525507	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PPP5C-211	ENST00000525507	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PPP5C-211	ENST00000525507	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65
PPP5C-211	ENST00000525507	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
PPP5C-211	ENST00000525507	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PPP5C-211	ENST00000525507	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PPP5C-211	ENST00000525507	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PPP5C-211	ENST00000525507	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PPP5C-211	ENST00000525507	PTPRT	O14522	1441 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PPP5C-211	ENST00000525507	NPAT	Q14207	1427 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PPP5C-211	ENST00000525507	MROH2A	A6NES4	1674 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PPP5C-211	ENST00000525507	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.46	■■■□□ 2.63
PPP5C-211	ENST00000525507	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.45	■■■□□ 2.63
PPP5C-211	ENST00000525507	A2M	P01023	1474 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PPP5C-211	ENST00000525507	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PPP5C-211	ENST00000525507	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
PPP5C-211	ENST00000525507	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PPP5C-211	ENST00000525507	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PPP5C-211	ENST00000525507	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PPP5C-211	ENST00000525507	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
PPP5C-211	ENST00000525507	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PPP5C-211	ENST00000525507	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PPP5C-211	ENST00000525507	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PPP5C-211	ENST00000525507	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PPP5C-211	ENST00000525507	GGT6	Q6P531	493 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PPP5C-211	ENST00000525507	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PPP5C-211	ENST00000525507	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	31.32	■■■□□ 2.6
PPP5C-211	ENST00000525507	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PPP5C-211	ENST00000525507	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PPP5C-211	ENST00000525507	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.29	■■■□□ 2.6
PPP5C-211	ENST00000525507	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PPP5C-211	ENST00000525507	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.59
PPP5C-211	ENST00000525507	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PPP5C-211	ENST00000525507	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PPP5C-211	ENST00000525507	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
PPP5C-211	ENST00000525507	NCOA2	Q15596	1464 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PPP5C-211	ENST00000525507	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PPP5C-211	ENST00000525507	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PPP5C-211	ENST00000525507	PLA2R1	Q13018	1463 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PPP5C-211	ENST00000525507	PKD2	Q13563	968 aa		31.2	■■■□□ 2.58
PPP5C-211	ENST00000525507	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
PPP5C-211	ENST00000525507	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PPP5C-211	ENST00000525507	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PPP5C-211	ENST00000525507	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
PPP5C-211	ENST00000525507	KIF3B	O15066	747 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PPP5C-211	ENST00000525507	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PPP5C-211	ENST00000525507	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PPP5C-211	ENST00000525507	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	31.08	■■■□□ 2.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms