RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525507.5

PPP5C-211, Transcript of protein phosphatase 5 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP5C, Length 1,300 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP5C-211ENST00000525507 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.12■■■■■ 5.45
PPP5C-211ENST00000525507 ABCC9O60706 1549 aa44.17■■■■■ 4.66
PPP5C-211ENST00000525507 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.1■■■■■ 4.65
PPP5C-211ENST00000525507 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.03■■■■■ 4.32
PPP5C-211ENST00000525507 NACADO15069 1562 aa41.75■■■■■ 4.27
PPP5C-211ENST00000525507 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.59■■■■■ 4.25
PPP5C-211ENST00000525507 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.46■■■■■ 4.23
PPP5C-211ENST00000525507 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.2■■■■■ 4.19
PPP5C-211ENST00000525507 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.13■■■■■ 4.173e-11■■■■□ 22.2
PPP5C-211ENST00000525507 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.02■■■■■ 4.16
PPP5C-211ENST00000525507 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.81■■■■■ 4.12
PPP5C-211ENST00000525507 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
PPP5C-211ENST00000525507 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.61■■■■■ 4.09
PPP5C-211ENST00000525507 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.32■■■■■ 4.04
PPP5C-211ENST00000525507 SCRIBQ14160 1630 aa40.11■■■■■ 4.01
PPP5C-211ENST00000525507 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.91■■■■□ 3.98
PPP5C-211ENST00000525507 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.83■■■■□ 3.97
PPP5C-211ENST00000525507 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
PPP5C-211ENST00000525507 NCAPD3P42695 1498 aa38.58■■■■□ 3.77
PPP5C-211ENST00000525507 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.41■■■■□ 3.74
PPP5C-211ENST00000525507 SMARCA4P51532 1647 aa38.31■■■■□ 3.72
PPP5C-211ENST00000525507 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.3■■■■□ 3.72
PPP5C-211ENST00000525507 SMARCA2P51531 1590 aa38.29■■■■□ 3.72
PPP5C-211ENST00000525507 HMGXB3Q12766 1538 aa38.24■■■■□ 3.71
PPP5C-211ENST00000525507 CUX2O14529 1486 aa38.17■■■■□ 3.7
PPP5C-211ENST00000525507 ERCC6Q03468 1493 aa38.15■■■■□ 3.7
PPP5C-211ENST00000525507 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.69
PPP5C-211ENST00000525507 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
PPP5C-211ENST00000525507 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.99■■■■□ 3.67
PPP5C-211ENST00000525507 NESP48681 1621 aa37.91■■■■□ 3.66
PPP5C-211ENST00000525507 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.82■■■■□ 3.64
PPP5C-211ENST00000525507 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.68■■■■□ 3.62
PPP5C-211ENST00000525507 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
PPP5C-211ENST00000525507 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.49■■■■□ 3.59
PPP5C-211ENST00000525507 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.39■■■■□ 3.58
PPP5C-211ENST00000525507 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.39■■■■□ 3.58
PPP5C-211ENST00000525507 WIZO95785 1651 aa37.33■■■■□ 3.57
PPP5C-211ENST00000525507 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.13■■■■□ 3.53
PPP5C-211ENST00000525507 WDR62O43379 1518 aa37.06■■■■□ 3.52
PPP5C-211ENST00000525507 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
PPP5C-211ENST00000525507 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.96■■■■□ 3.51
PPP5C-211ENST00000525507 CFTRP13569 1480 aa36.93■■■■□ 3.5
PPP5C-211ENST00000525507 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.92■■■■□ 3.5
PPP5C-211ENST00000525507 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
PPP5C-211ENST00000525507 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
PPP5C-211ENST00000525507 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.49■■■■□ 3.43
PPP5C-211ENST00000525507 TRIM41Q8WV44 630 aa36.48■■■■□ 3.43
PPP5C-211ENST00000525507 PRDM2Q13029 1718 aa36.47■■■■□ 3.43
PPP5C-211ENST00000525507 OSCARQ8IYS5 282 aa36.44■■■■□ 3.42
PPP5C-211ENST00000525507 IFT140Q96RY7 1462 aa36.26■■■■□ 3.39
PPP5C-211ENST00000525507 TOPBP1Q92547 1522 aa36.21■■■■□ 3.39
PPP5C-211ENST00000525507 ABCC8Q09428 1581 aa36.18■■■■□ 3.38
PPP5C-211ENST00000525507 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
PPP5C-211ENST00000525507 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.06■■■■□ 3.36
PPP5C-211ENST00000525507 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
PPP5C-211ENST00000525507 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.89■■■■□ 3.34
PPP5C-211ENST00000525507 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.89■■■■□ 3.34
PPP5C-211ENST00000525507 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
PPP5C-211ENST00000525507 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.89■■■■□ 3.34
PPP5C-211ENST00000525507 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.85■■■■□ 3.337e-9■■■■■ 39.2
PPP5C-211ENST00000525507 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
PPP5C-211ENST00000525507 ARHGEF11O15085 1522 aa35.78■■■■□ 3.32
PPP5C-211ENST00000525507 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.69■■■■□ 3.3
PPP5C-211ENST00000525507 SOGA1O94964 1423 aa35.69■■■■□ 3.3
PPP5C-211ENST00000525507 CHD1O14646 1710 aa35.67■■■■□ 3.3
PPP5C-211ENST00000525507 FBLN2P98095 1184 aa35.61■■■■□ 3.29
PPP5C-211ENST00000525507 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
PPP5C-211ENST00000525507 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.58■■■■□ 3.29
PPP5C-211ENST00000525507 WDR97A6NE52 1622 aa35.56■■■■□ 3.28
PPP5C-211ENST00000525507 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.56■■■■□ 3.28
PPP5C-211ENST00000525507 CUX1P39880 1505 aa35.53■■■■□ 3.28
PPP5C-211ENST00000525507 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.45■■■■□ 3.27
PPP5C-211ENST00000525507 ARAP1Q96P48 1450 aa35.43■■■■□ 3.26
PPP5C-211ENST00000525507 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
PPP5C-211ENST00000525507 GRIN2BQ13224 1484 aa35.38■■■■□ 3.25
PPP5C-211ENST00000525507 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
PPP5C-211ENST00000525507 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.33■■■■□ 3.25
PPP5C-211ENST00000525507 SYNJ1O43426 1573 aa35.29■■■■□ 3.24
PPP5C-211ENST00000525507 SYNJ2O15056 1496 aa35.28■■■■□ 3.24
PPP5C-211ENST00000525507 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
PPP5C-211ENST00000525507 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.24■■■■□ 3.23
PPP5C-211ENST00000525507 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.21■■■■□ 3.23
PPP5C-211ENST00000525507 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
PPP5C-211ENST00000525507 PBRM1Q86U86 1689 aa35.17■■■■□ 3.22
PPP5C-211ENST00000525507 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.12■■■■□ 3.21
PPP5C-211ENST00000525507 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.05■■■■□ 3.2
PPP5C-211ENST00000525507 TOP2BQ02880 1626 aa34.95■■■■□ 3.19
PPP5C-211ENST00000525507 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.93■■■■□ 3.18
PPP5C-211ENST00000525507 GRIN2AQ12879 1464 aa34.92■■■■□ 3.18
PPP5C-211ENST00000525507 ADAMTS12P58397 1594 aa34.85■■■■□ 3.17
PPP5C-211ENST00000525507 NUP160Q12769 1436 aa34.83■■■■□ 3.17
PPP5C-211ENST00000525507 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.81■■■■□ 3.16
PPP5C-211ENST00000525507 CEP170Q5SW79 1584 aa34.77■■■■□ 3.16
PPP5C-211ENST00000525507 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.76■■■■□ 3.16
PPP5C-211ENST00000525507 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.73■■■■□ 3.15
PPP5C-211ENST00000525507 SHROOM2Q13796 1616 aa34.67■■■■□ 3.14
PPP5C-211ENST00000525507 JPH4Q96JJ6 628 aa34.5■■■■□ 3.11
PPP5C-211ENST00000525507 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
PPP5C-211ENST00000525507 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.36■■■■□ 3.09
PPP5C-211ENST00000525507 IGF1RP08069 1367 aa34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms