RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520986.5

DENND3-215, Transcript of DENN domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene DENND3, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND3-215ENST00000520986 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.66■■■■□ 3.62
DENND3-215ENST00000520986 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.64■■■■□ 3.62
DENND3-215ENST00000520986 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
DENND3-215ENST00000520986 ADGRL1O94910 1474 aa37.62■■■■□ 3.61
DENND3-215ENST00000520986 RICTORQ6R327 1708 aa37.61■■■■□ 3.61
DENND3-215ENST00000520986 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.57■■■■□ 3.6
DENND3-215ENST00000520986 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
DENND3-215ENST00000520986 MAP3K1Q13233 1512 aa37.56■■■■□ 3.6
DENND3-215ENST00000520986 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.51■■■■□ 3.59
DENND3-215ENST00000520986 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.51■■■■□ 3.59
DENND3-215ENST00000520986 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.5■■■■□ 3.59
DENND3-215ENST00000520986 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.49■■■■□ 3.59
DENND3-215ENST00000520986 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.47■■■■□ 3.59
DENND3-215ENST00000520986 ABCC1P33527 1531 aa37.45■■■■□ 3.59
DENND3-215ENST00000520986 NCOA2Q15596 1464 aa37.45■■■■□ 3.59
DENND3-215ENST00000520986 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
DENND3-215ENST00000520986 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.42■■■■□ 3.58
DENND3-215ENST00000520986 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.41■■■■□ 3.58
DENND3-215ENST00000520986 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.41■■■■□ 3.58
DENND3-215ENST00000520986 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
DENND3-215ENST00000520986 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.38■■■■□ 3.57
DENND3-215ENST00000520986 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.57
DENND3-215ENST00000520986 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.38■■■■□ 3.57
DENND3-215ENST00000520986 APLP2Q06481 763 aa37.36■■■■□ 3.57
DENND3-215ENST00000520986 KDM5CP41229 1560 aa37.35■■■■□ 3.57
DENND3-215ENST00000520986 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.35■■■■□ 3.57
DENND3-215ENST00000520986 AFAP1Q8N556 730 aa37.34■■■■□ 3.57
DENND3-215ENST00000520986 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.34■■■■□ 3.57
DENND3-215ENST00000520986 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.33■■■■□ 3.57
DENND3-215ENST00000520986 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.33■■■■□ 3.57
DENND3-215ENST00000520986 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.32■■■■□ 3.56
DENND3-215ENST00000520986 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.31■■■■□ 3.56
DENND3-215ENST00000520986 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.27■■■■□ 3.56
DENND3-215ENST00000520986 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.26■■■■□ 3.55
DENND3-215ENST00000520986 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.25■■■■□ 3.55
DENND3-215ENST00000520986 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
DENND3-215ENST00000520986 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.23■■■■□ 3.55
DENND3-215ENST00000520986 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.2■■■■□ 3.55
DENND3-215ENST00000520986 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.16■■■■□ 3.54
DENND3-215ENST00000520986 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.15■■■■□ 3.54
DENND3-215ENST00000520986 ATP10AO60312 1499 aa37.14■■■■□ 3.54
DENND3-215ENST00000520986 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.14■■■■□ 3.54
DENND3-215ENST00000520986 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.14■■■■□ 3.54
DENND3-215ENST00000520986 MBD5Q9P267 1494 aa37.13■■■■□ 3.54
DENND3-215ENST00000520986 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.13■■■■□ 3.53
DENND3-215ENST00000520986 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.13■■■■□ 3.53
DENND3-215ENST00000520986 ABCA6Q8N139 1617 aa37.13■■■■□ 3.53
DENND3-215ENST00000520986 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
DENND3-215ENST00000520986 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.1■■■■□ 3.53
DENND3-215ENST00000520986 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.09■■■■□ 3.53
DENND3-215ENST00000520986 MIA2Q96PC5 1412 aa37.07■■■■□ 3.52
DENND3-215ENST00000520986 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
DENND3-215ENST00000520986 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
DENND3-215ENST00000520986 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.05■■■■□ 3.52
DENND3-215ENST00000520986 ATP7AQ04656 1500 aa37.04■■■■□ 3.52
DENND3-215ENST00000520986 REREQ9P2R6 1566 aa37.02■■■■□ 3.52
DENND3-215ENST00000520986 CCDC141Q6ZP82 1450 aa37■■■■□ 3.51
DENND3-215ENST00000520986 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.99■■■■□ 3.51
DENND3-215ENST00000520986 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.94■■■■□ 3.5
DENND3-215ENST00000520986 MADDQ8WXG6 1647 aa36.94■■■■□ 3.5
DENND3-215ENST00000520986 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.92■■■■□ 3.5
DENND3-215ENST00000520986 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.92■■■■□ 3.5
DENND3-215ENST00000520986 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.91■■■■□ 3.5
DENND3-215ENST00000520986 AGLP35573 1532 aa36.9■■■■□ 3.5
DENND3-215ENST00000520986 MLECQ14165 292 aa36.89■■■■□ 3.5
DENND3-215ENST00000520986 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
DENND3-215ENST00000520986 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.84■■■■□ 3.49
DENND3-215ENST00000520986 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
DENND3-215ENST00000520986 PLXNC1O60486 1568 aa36.83■■■■□ 3.49
DENND3-215ENST00000520986 A2MP01023 1474 aa36.83■■■■□ 3.49
DENND3-215ENST00000520986 PTPRMP28827 1452 aa36.83■■■■□ 3.49
DENND3-215ENST00000520986 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.81■■■■□ 3.48
DENND3-215ENST00000520986 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
DENND3-215ENST00000520986 TSPY4P0CV99 314 aa36.8■■■■□ 3.48
DENND3-215ENST00000520986 TSPY10P0CW01 314 aa36.8■■■■□ 3.48
DENND3-215ENST00000520986 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.79■■■■□ 3.48
DENND3-215ENST00000520986 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.74■■■■□ 3.47
DENND3-215ENST00000520986 ABCC5O15440 1437 aa36.73■■■■□ 3.47
DENND3-215ENST00000520986 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
DENND3-215ENST00000520986 DAPK1P53355 1430 aa36.7■■■■□ 3.47
DENND3-215ENST00000520986 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
DENND3-215ENST00000520986 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.69■■■■□ 3.46
DENND3-215ENST00000520986 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
DENND3-215ENST00000520986 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.57■■■■□ 3.44
DENND3-215ENST00000520986 GGT6Q6P531 493 aa36.56■■■■□ 3.44
DENND3-215ENST00000520986 KIF3BO15066 747 aa36.54■■■■□ 3.44
DENND3-215ENST00000520986 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
DENND3-215ENST00000520986 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.52■■■■□ 3.44
DENND3-215ENST00000520986 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.51■■■■□ 3.44
DENND3-215ENST00000520986 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.44
DENND3-215ENST00000520986 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.51■■■■□ 3.44
DENND3-215ENST00000520986 KIF15Q9NS87 1388 aa36.51■■■■□ 3.43
DENND3-215ENST00000520986 C3P01024 1663 aa36.5■■■■□ 3.43
DENND3-215ENST00000520986 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
DENND3-215ENST00000520986 MROH2AA6NES4 1674 aa36.48■■■■□ 3.43
DENND3-215ENST00000520986 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
DENND3-215ENST00000520986 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.48■■■■□ 3.43
DENND3-215ENST00000520986 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.46■■■■□ 3.43
DENND3-215ENST00000520986 ADGRL2O95490 1459 aa36.45■■■■□ 3.43
DENND3-215ENST00000520986 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms