RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519070.5

FAM49B-211, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM49B, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49B-211ENST00000519070 RICTORQ6R327 1708 aa25.63■■□□□ 1.69
FAM49B-211ENST00000519070 RAPGEF3O95398 923 aa25.62■■□□□ 1.69
FAM49B-211ENST00000519070 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.59■■□□□ 1.69
FAM49B-211ENST00000519070 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
FAM49B-211ENST00000519070 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.59■■□□□ 1.69
FAM49B-211ENST00000519070 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.58■■□□□ 1.69
FAM49B-211ENST00000519070 ADGRL1O94910 1474 aa25.58■■□□□ 1.69
FAM49B-211ENST00000519070 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
FAM49B-211ENST00000519070 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.56■■□□□ 1.68
FAM49B-211ENST00000519070 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.55■■□□□ 1.68
FAM49B-211ENST00000519070 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.53■■□□□ 1.68
FAM49B-211ENST00000519070 NCOA2Q15596 1464 aa25.53■■□□□ 1.68
FAM49B-211ENST00000519070 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.53■■□□□ 1.68
FAM49B-211ENST00000519070 ABCC1P33527 1531 aa25.52■■□□□ 1.68
FAM49B-211ENST00000519070 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.51■■□□□ 1.67
FAM49B-211ENST00000519070 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
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FAM49B-211ENST00000519070 KDM5CP41229 1560 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM49B-211ENST00000519070 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.46■■□□□ 1.67
FAM49B-211ENST00000519070 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.45■■□□□ 1.67
FAM49B-211ENST00000519070 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.43■■□□□ 1.66
FAM49B-211ENST00000519070 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.43■■□□□ 1.66
FAM49B-211ENST00000519070 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.42■■□□□ 1.66
FAM49B-211ENST00000519070 AFAP1Q8N556 730 aa25.42■■□□□ 1.66
FAM49B-211ENST00000519070 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
FAM49B-211ENST00000519070 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.41■■□□□ 1.66
FAM49B-211ENST00000519070 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.41■■□□□ 1.66
FAM49B-211ENST00000519070 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.41■■□□□ 1.66
FAM49B-211ENST00000519070 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
FAM49B-211ENST00000519070 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.39■■□□□ 1.66
FAM49B-211ENST00000519070 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.39■■□□□ 1.65
FAM49B-211ENST00000519070 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.37■■□□□ 1.65
FAM49B-211ENST00000519070 MBD5Q9P267 1494 aa25.37■■□□□ 1.65
FAM49B-211ENST00000519070 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
FAM49B-211ENST00000519070 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.35■■□□□ 1.65
FAM49B-211ENST00000519070 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.65
FAM49B-211ENST00000519070 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.34■■□□□ 1.65
FAM49B-211ENST00000519070 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.33■■□□□ 1.65
FAM49B-211ENST00000519070 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.32■■□□□ 1.64
FAM49B-211ENST00000519070 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM49B-211ENST00000519070 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM49B-211ENST00000519070 APLP2Q06481 763 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM49B-211ENST00000519070 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM49B-211ENST00000519070 ABCA6Q8N139 1617 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM49B-211ENST00000519070 ATP10AO60312 1499 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM49B-211ENST00000519070 MIA2Q96PC5 1412 aa25.27■■□□□ 1.64
FAM49B-211ENST00000519070 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
FAM49B-211ENST00000519070 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.24■■□□□ 1.63
FAM49B-211ENST00000519070 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.23■■□□□ 1.63
FAM49B-211ENST00000519070 REREQ9P2R6 1566 aa25.23■■□□□ 1.63
FAM49B-211ENST00000519070 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.22■■□□□ 1.63
FAM49B-211ENST00000519070 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.22■■□□□ 1.63
FAM49B-211ENST00000519070 ATP7AQ04656 1500 aa25.2■■□□□ 1.62
FAM49B-211ENST00000519070 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
FAM49B-211ENST00000519070 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.18■■□□□ 1.62
FAM49B-211ENST00000519070 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.17■■□□□ 1.62
FAM49B-211ENST00000519070 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
FAM49B-211ENST00000519070 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.15■■□□□ 1.62
FAM49B-211ENST00000519070 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.15■■□□□ 1.62
FAM49B-211ENST00000519070 AGLP35573 1532 aa25.14■■□□□ 1.62
FAM49B-211ENST00000519070 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.13■■□□□ 1.61
FAM49B-211ENST00000519070 PLXNC1O60486 1568 aa25.13■■□□□ 1.61
FAM49B-211ENST00000519070 MADDQ8WXG6 1647 aa25.12■■□□□ 1.61
FAM49B-211ENST00000519070 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
FAM49B-211ENST00000519070 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.1■■□□□ 1.61
FAM49B-211ENST00000519070 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
FAM49B-211ENST00000519070 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.08■■□□□ 1.61
FAM49B-211ENST00000519070 ABCC5O15440 1437 aa25.08■■□□□ 1.61
FAM49B-211ENST00000519070 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.07■■□□□ 1.6
FAM49B-211ENST00000519070 A2MP01023 1474 aa25.07■■□□□ 1.6
FAM49B-211ENST00000519070 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
FAM49B-211ENST00000519070 PTPRMP28827 1452 aa25.04■■□□□ 1.6
FAM49B-211ENST00000519070 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
FAM49B-211ENST00000519070 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.03■■□□□ 1.6
FAM49B-211ENST00000519070 MLECQ14165 292 aa25.02■■□□□ 1.6
FAM49B-211ENST00000519070 DAPK1P53355 1430 aa25.01■■□□□ 1.59
FAM49B-211ENST00000519070 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
FAM49B-211ENST00000519070 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
FAM49B-211ENST00000519070 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25■■□□□ 1.59
FAM49B-211ENST00000519070 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.99■■□□□ 1.59
FAM49B-211ENST00000519070 TSPY4P0CV99 314 aa24.98■■□□□ 1.59
FAM49B-211ENST00000519070 TSPY10P0CW01 314 aa24.98■■□□□ 1.59
FAM49B-211ENST00000519070 PTPRKQ15262 1439 aa24.93■■□□□ 1.58
FAM49B-211ENST00000519070 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.575e-6■■■□□ 14.8
FAM49B-211ENST00000519070 ADGRL2O95490 1459 aa24.89■■□□□ 1.57
FAM49B-211ENST00000519070 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
FAM49B-211ENST00000519070 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
FAM49B-211ENST00000519070 NCOA1Q15788 1441 aa24.86■■□□□ 1.57
FAM49B-211ENST00000519070 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.86■■□□□ 1.57
FAM49B-211ENST00000519070 KIF15Q9NS87 1388 aa24.84■■□□□ 1.57
FAM49B-211ENST00000519070 C3P01024 1663 aa24.84■■□□□ 1.57
FAM49B-211ENST00000519070 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.83■■□□□ 1.57
FAM49B-211ENST00000519070 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
FAM49B-211ENST00000519070 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
FAM49B-211ENST00000519070 KIF3BO15066 747 aa24.83■■□□□ 1.57
FAM49B-211ENST00000519070 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
FAM49B-211ENST00000519070 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.83■■□□□ 1.57
FAM49B-211ENST00000519070 MROH2AA6NES4 1674 aa24.82■■□□□ 1.56
FAM49B-211ENST00000519070 GGT6Q6P531 493 aa24.82■■□□□ 1.56
FAM49B-211ENST00000519070 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.81■■□□□ 1.56
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