RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517697.5

CA3-AS1-201, CA3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene CA3-AS1, Length 559 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA3-AS1-201ENST00000517697 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.49■■■□□ 2.63
CA3-AS1-201ENST00000517697 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.49■■■□□ 2.63
CA3-AS1-201ENST00000517697 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.49■■■□□ 2.63
CA3-AS1-201ENST00000517697 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.48■■■□□ 2.63
CA3-AS1-201ENST00000517697 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.48■■■□□ 2.63
CA3-AS1-201ENST00000517697 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.48■■■□□ 2.63
CA3-AS1-201ENST00000517697 TIAM1Q13009 1591 aa31.47■■■□□ 2.63
CA3-AS1-201ENST00000517697 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.43■■■□□ 2.62
CA3-AS1-201ENST00000517697 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.43■■■□□ 2.62
CA3-AS1-201ENST00000517697 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.42■■■□□ 2.62
CA3-AS1-201ENST00000517697 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.41■■■□□ 2.62
CA3-AS1-201ENST00000517697 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.39■■■□□ 2.62
CA3-AS1-201ENST00000517697 MAP3K1Q13233 1512 aa31.37■■■□□ 2.61
CA3-AS1-201ENST00000517697 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.37■■■□□ 2.61
CA3-AS1-201ENST00000517697 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.35■■■□□ 2.61
CA3-AS1-201ENST00000517697 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.35■■■□□ 2.61
CA3-AS1-201ENST00000517697 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
CA3-AS1-201ENST00000517697 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.35■■■□□ 2.61
CA3-AS1-201ENST00000517697 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
CA3-AS1-201ENST00000517697 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.32■■■□□ 2.6
CA3-AS1-201ENST00000517697 KDM5CP41229 1560 aa31.31■■■□□ 2.6
CA3-AS1-201ENST00000517697 ABCC1P33527 1531 aa31.31■■■□□ 2.6
CA3-AS1-201ENST00000517697 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.3■■■□□ 2.6
CA3-AS1-201ENST00000517697 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.29■■■□□ 2.6
CA3-AS1-201ENST00000517697 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.28■■■□□ 2.6
CA3-AS1-201ENST00000517697 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.26■■■□□ 2.6
CA3-AS1-201ENST00000517697 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.25■■■□□ 2.59
CA3-AS1-201ENST00000517697 NCOA2Q15596 1464 aa31.25■■■□□ 2.59
CA3-AS1-201ENST00000517697 MADDQ8WXG6 1647 aa31.24■■■□□ 2.59
CA3-AS1-201ENST00000517697 PTPRMP28827 1452 aa31.21■■■□□ 2.59
CA3-AS1-201ENST00000517697 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.19■■■□□ 2.58
CA3-AS1-201ENST00000517697 AFAP1Q8N556 730 aa31.19■■■□□ 2.58
CA3-AS1-201ENST00000517697 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
CA3-AS1-201ENST00000517697 ATP10AO60312 1499 aa31.19■■■□□ 2.58
CA3-AS1-201ENST00000517697 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.17■■■□□ 2.58
CA3-AS1-201ENST00000517697 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.17■■■□□ 2.58
CA3-AS1-201ENST00000517697 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
CA3-AS1-201ENST00000517697 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.17■■■□□ 2.58
CA3-AS1-201ENST00000517697 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
CA3-AS1-201ENST00000517697 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.16■■■□□ 2.58
CA3-AS1-201ENST00000517697 APLP2Q06481 763 aa31.16■■■□□ 2.58
CA3-AS1-201ENST00000517697 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.15■■■□□ 2.58
CA3-AS1-201ENST00000517697 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.14■■■□□ 2.58
CA3-AS1-201ENST00000517697 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
CA3-AS1-201ENST00000517697 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.13■■■□□ 2.57
CA3-AS1-201ENST00000517697 REREQ9P2R6 1566 aa31.12■■■□□ 2.57
CA3-AS1-201ENST00000517697 ABCA6Q8N139 1617 aa31.12■■■□□ 2.57
CA3-AS1-201ENST00000517697 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
CA3-AS1-201ENST00000517697 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.09■■■□□ 2.57
CA3-AS1-201ENST00000517697 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.05■■■□□ 2.56
CA3-AS1-201ENST00000517697 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.03■■■□□ 2.56
CA3-AS1-201ENST00000517697 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.02■■■□□ 2.56
CA3-AS1-201ENST00000517697 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.56
CA3-AS1-201ENST00000517697 MYT1LQ9UL68 1186 aa31■■■□□ 2.55
CA3-AS1-201ENST00000517697 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.99■■■□□ 2.55
CA3-AS1-201ENST00000517697 MBD5Q9P267 1494 aa30.99■■■□□ 2.55
CA3-AS1-201ENST00000517697 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
CA3-AS1-201ENST00000517697 AGLP35573 1532 aa30.98■■■□□ 2.55
CA3-AS1-201ENST00000517697 ATP7AQ04656 1500 aa30.96■■■□□ 2.55
CA3-AS1-201ENST00000517697 MIA2Q96PC5 1412 aa30.95■■■□□ 2.54
CA3-AS1-201ENST00000517697 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
CA3-AS1-201ENST00000517697 MLECQ14165 292 aa30.93■■■□□ 2.54
CA3-AS1-201ENST00000517697 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.92■■■□□ 2.54
CA3-AS1-201ENST00000517697 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.91■■■□□ 2.54
CA3-AS1-201ENST00000517697 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.89■■■□□ 2.54
CA3-AS1-201ENST00000517697 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.85■■■□□ 2.53
CA3-AS1-201ENST00000517697 PLXNC1O60486 1568 aa30.85■■■□□ 2.53
CA3-AS1-201ENST00000517697 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.85■■■□□ 2.53
CA3-AS1-201ENST00000517697 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.84■■■□□ 2.53
CA3-AS1-201ENST00000517697 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.83■■■□□ 2.53
CA3-AS1-201ENST00000517697 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.81■■■□□ 2.52
CA3-AS1-201ENST00000517697 A2MP01023 1474 aa30.77■■■□□ 2.52
CA3-AS1-201ENST00000517697 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.76■■■□□ 2.52
CA3-AS1-201ENST00000517697 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
CA3-AS1-201ENST00000517697 C3P01024 1663 aa30.75■■■□□ 2.51
CA3-AS1-201ENST00000517697 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.74■■■□□ 2.51
CA3-AS1-201ENST00000517697 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.72■■■□□ 2.51
CA3-AS1-201ENST00000517697 TSPY4P0CV99 314 aa30.71■■■□□ 2.51
CA3-AS1-201ENST00000517697 TSPY10P0CW01 314 aa30.71■■■□□ 2.51
CA3-AS1-201ENST00000517697 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
CA3-AS1-201ENST00000517697 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.7■■■□□ 2.51
CA3-AS1-201ENST00000517697 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
CA3-AS1-201ENST00000517697 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
CA3-AS1-201ENST00000517697 MROH2AA6NES4 1674 aa30.68■■■□□ 2.5
CA3-AS1-201ENST00000517697 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.68■■■□□ 2.5
CA3-AS1-201ENST00000517697 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.66■■■□□ 2.5
CA3-AS1-201ENST00000517697 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
CA3-AS1-201ENST00000517697 ABCC5O15440 1437 aa30.63■■■□□ 2.49
CA3-AS1-201ENST00000517697 DAPK1P53355 1430 aa30.62■■■□□ 2.49
CA3-AS1-201ENST00000517697 HSPA2P54652 639 aa30.6■■■□□ 2.49
CA3-AS1-201ENST00000517697 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CA3-AS1-201ENST00000517697 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
CA3-AS1-201ENST00000517697 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
CA3-AS1-201ENST00000517697 ZMYM3Q14202 1370 aa30.54■■■□□ 2.48
CA3-AS1-201ENST00000517697 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
CA3-AS1-201ENST00000517697 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.53■■■□□ 2.48
CA3-AS1-201ENST00000517697 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
CA3-AS1-201ENST00000517697 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.52■■■□□ 2.48
CA3-AS1-201ENST00000517697 NPATQ14207 1427 aa30.52■■■□□ 2.48
CA3-AS1-201ENST00000517697 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms