RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-202ENST00000517309 CCER2I3L3R5 266 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-202ENST00000517309 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-202ENST00000517309 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-202ENST00000517309 STK26Q9P289 416 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-202ENST00000517309 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-202ENST00000517309 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-202ENST00000517309 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-202ENST00000517309 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-202ENST00000517309 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-202ENST00000517309 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-202ENST00000517309 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-202ENST00000517309 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS1-202ENST00000517309 FOXD1Q16676 465 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS1-202ENST00000517309 NPHP1O15259 732 aa22.48■■□□□ 1.19
PTDSS1-202ENST00000517309 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.48■■□□□ 1.19
PTDSS1-202ENST00000517309 PTPRGP23470 1445 aa22.47■■□□□ 1.19
PTDSS1-202ENST00000517309 NBR1Q14596 966 aa22.47■■□□□ 1.19
PTDSS1-202ENST00000517309 EID1Q9Y6B2 187 aa22.47■■□□□ 1.19
PTDSS1-202ENST00000517309 SOX12O15370 315 aa22.47■■□□□ 1.19
PTDSS1-202ENST00000517309 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PTDSS1-202ENST00000517309 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PTDSS1-202ENST00000517309 RALBP1Q15311 655 aa22.45■■□□□ 1.18
PTDSS1-202ENST00000517309 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTDSS1-202ENST00000517309 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PTDSS1-202ENST00000517309 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.41■■□□□ 1.18
PTDSS1-202ENST00000517309 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.4■■□□□ 1.18
PTDSS1-202ENST00000517309 OSCARQ8IYS5 282 aa22.4■■□□□ 1.18
PTDSS1-202ENST00000517309 RGS3P49796 1198 aa22.37■■□□□ 1.17
PTDSS1-202ENST00000517309 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTDSS1-202ENST00000517309 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-202ENST00000517309 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-202ENST00000517309 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-202ENST00000517309 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-202ENST00000517309 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-202ENST00000517309 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-202ENST00000517309 NCAPD3P42695 1498 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-202ENST00000517309 CFAP44Q96MT7 982 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-202ENST00000517309 GOLGA2Q08379 1002 aa22.32■■□□□ 1.16
PTDSS1-202ENST00000517309 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.32■■□□□ 1.16
PTDSS1-202ENST00000517309 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS1-202ENST00000517309 UACAQ9BZF9 1416 aa22.31■■□□□ 1.16
PTDSS1-202ENST00000517309 KCNJ4P48050 445 aa22.29■■□□□ 1.16
PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-202ENST00000517309 FGD1P98174 961 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-202ENST00000517309 IGF1RP08069 1367 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-202ENST00000517309 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-202ENST00000517309 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-202ENST00000517309 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-202ENST00000517309 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.24■■□□□ 1.15
PTDSS1-202ENST00000517309 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTDSS1-202ENST00000517309 NLRP13Q86W25 1043 aa22.22■■□□□ 1.15
PTDSS1-202ENST00000517309 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.21■■□□□ 1.15
PTDSS1-202ENST00000517309 MCCP23508 829 aa22.2■■□□□ 1.14
PTDSS1-202ENST00000517309 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-202ENST00000517309 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-202ENST00000517309 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.18■■□□□ 1.14
PTDSS1-202ENST00000517309 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTDSS1-202ENST00000517309 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.18■■□□□ 1.14
PTDSS1-202ENST00000517309 STK31Q9BXU1 1019 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-202ENST00000517309 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-202ENST00000517309 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-202ENST00000517309 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-202ENST00000517309 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-202ENST00000517309 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-202ENST00000517309 AMPHP49418 695 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-202ENST00000517309 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-202ENST00000517309 PDE3BQ13370 1112 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-202ENST00000517309 HSCBQ8IWL3 235 aa22.11■■□□□ 1.13
PTDSS1-202ENST00000517309 KIF15Q9NS87 1388 aa22.1■■□□□ 1.13
PTDSS1-202ENST00000517309 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTDSS1-202ENST00000517309 STAC3Q96MF2 364 aa22.1■■□□□ 1.13
PTDSS1-202ENST00000517309 EVC2Q86UK5 1308 aa22.09■■□□□ 1.13
PTDSS1-202ENST00000517309 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.09■■□□□ 1.13
PTDSS1-202ENST00000517309 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PTDSS1-202ENST00000517309 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTDSS1-202ENST00000517309 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.08■■□□□ 1.12
PTDSS1-202ENST00000517309 GRIN2BQ13224 1484 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS1-202ENST00000517309 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.128e-8■■■■■ 39.5
PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTDSS1-202ENST00000517309 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS1-202ENST00000517309 CUX1P39880 1505 aa22.06■■□□□ 1.12
PTDSS1-202ENST00000517309 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
PTDSS1-202ENST00000517309 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTDSS1-202ENST00000517309 HMMRO75330 724 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS1-202ENST00000517309 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.04■■□□□ 1.12
PTDSS1-202ENST00000517309 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.03■■□□□ 1.12
PTDSS1-202ENST00000517309 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.03■■□□□ 1.12
PTDSS1-202ENST00000517309 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTDSS1-202ENST00000517309 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
PTDSS1-202ENST00000517309 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTDSS1-202ENST00000517309 COG3Q96JB2 828 aa22.01■■□□□ 1.11
PTDSS1-202ENST00000517309 PANK3Q9H999 370 aa22.01■■□□□ 1.11
PTDSS1-202ENST00000517309 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.01■■□□□ 1.11
PTDSS1-202ENST00000517309 FGD6Q6ZV73 1430 aa22■■□□□ 1.11
PTDSS1-202ENST00000517309 NUTM2FA1L443 756 aa22■■□□□ 1.11
PTDSS1-202ENST00000517309 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PTDSS1-202ENST00000517309 TPRNQ4KMQ1 711 aa22■■□□□ 1.11
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