RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516666.1

RNU6-1332P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1332, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1332P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CFAP44Q96MT7 982 aa7.73□□□□□ -1.17
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RNU6-1332P-201ENST00000516666 C2orf72A6NCS6 295 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PDE4AP27815 886 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-1332P-201ENST00000516666 DOK7Q18PE1 504 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RIMBP2O15034 1052 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FOXK1P85037 733 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLC34A2O95436 690 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ST18O60284 1047 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MFSD10Q14728 455 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PLCB2Q00722 1185 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-1332P-201ENST00000516666 DSG2Q14126 1118 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PLPP6Q8IY26 295 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-1332P-201ENST00000516666 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RNU6-1332P-201ENST00000516666 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RNU6-1332P-201ENST00000516666 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GPR153Q6NV75 609 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TBC1D12O60347 775 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-1332P-201ENST00000516666 POTEMA6NI47 508 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1332P-201ENST00000516666 EMP3P54852 163 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1332P-201ENST00000516666 POTEGQ6S5H5 508 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CAMK2BQ13554 666 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1332P-201ENST00000516666 OXER1Q8TDS5 423 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1332P-201ENST00000516666 WDR70Q9NW82 654 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ARSIQ5FYB1 569 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MARVELD3Q96A59 401 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ERBB3P21860 1342 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1332P-201ENST00000516666 E2F4Q16254 413 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NUDT7P0C024 238 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MAP3K9P80192 1104 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1332P-201ENST00000516666 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1332P-201ENST00000516666 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FAM205CA6NFA0 338 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RNU6-1332P-201ENST00000516666 EVI5O60447 810 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 LHX6Q9UPM6 363 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 P3H3Q8IVL6 736 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 POTEB3A0JP26 581 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 DPYSL4O14531 572 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PBX2P40425 430 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 POTEBQ6S5H4 581 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PDIA6Q15084 440 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 JPH4Q96JJ6 628 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PTGER2P43116 358 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FOSBP53539 338 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PHF14O94880 888 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1332P-201ENST00000516666 EPAS1Q99814 870 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FBXW7Q969H0 707 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KCNH8Q96L42 1107 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ARHGAP33O14559 1287 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1332P-201ENST00000516666 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PTPREP23469 700 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1332P-201ENST00000516666 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1332P-201ENST00000516666 POTEEQ6S8J3 1075 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1332P-201ENST00000516666 DDX12PQ92771 950 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TK2O00142 265 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1332P-201ENST00000516666 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NBR1Q14596 966 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KCNK17Q96T54 332 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1332P-201ENST00000516666 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.5 ms