RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 STAC3Q96MF2 364 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARHGAP33O14559 1287 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 CABP2Q9NPB3 220 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 MICALL2Q8IY33 904 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-162P-201ENST00000516228 HRO43593 1189 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-162P-201ENST00000516228 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRAF7Q6Q0C0 670 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM92Q6UXU6 159 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-162P-201ENST00000516228 CSRNP3Q8WYN3 585 aa4.87□□□□□ -1.63
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RNU6-162P-201ENST00000516228 AXIN2Q9Y2T1 843 aa4.86□□□□□ -1.63
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RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-162P-201ENST00000516228 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-162P-201ENST00000516228 KIF3CO14782 793 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-162P-201ENST00000516228 PSEN2P49810 448 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-162P-201ENST00000516228 WNT2BQ93097 391 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-162P-201ENST00000516228 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa4.72□□□□□ -1.65
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RNU6-162P-201ENST00000516228 MS4A4AQ96JQ5 239 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-162P-201ENST00000516228 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-162P-201ENST00000516228 KCNC4Q03721 635 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-162P-201ENST00000516228 NBPF3Q9H094 633 aa4.68□□□□□ -1.66
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RNU6-162P-201ENST00000516228 NLRP6P59044 892 aa4.67□□□□□ -1.66
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RNU6-162P-201ENST00000516228 V9GY48 417 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
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RNU6-162P-201ENST00000516228 TREML4Q6UXN2 200 aa4.62□□□□□ -1.67
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RNU6-162P-201ENST00000516228 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-162P-201ENST00000516228 LAPTM4BQ86VI4 370 aa4.57□□□□□ -1.68
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RNU6-162P-201ENST00000516228 WIPF1O43516 503 aa4.53□□□□□ -1.68
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RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF454Q8N9F8 522 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-162P-201ENST00000516228 FOXK1P85037 733 aa4.51□□□□□ -1.69
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RNU6-162P-201ENST00000516228 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-162P-201ENST00000516228 BCAMP50895 628 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-162P-201ENST00000516228 FOSBP53539 338 aa4.49□□□□□ -1.69
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RNU6-162P-201ENST00000516228 WBP1LQ9NX94 342 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-162P-201ENST00000516228 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-162P-201ENST00000516228 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-162P-201ENST00000516228 GGCXP38435 758 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-162P-201ENST00000516228 MYT1Q01538 1121 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-162P-201ENST00000516228 PLPP6Q8IY26 295 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-162P-201ENST00000516228 JPH4Q96JJ6 628 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-162P-201ENST00000516228 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-162P-201ENST00000516228 MFRPQ9BY79 579 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-162P-201ENST00000516228 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
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