RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514128.1

SIMC1-211, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 697 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-211ENST00000514128 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.65■■■■□ 3.94
SIMC1-211ENST00000514128 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.64■■■■□ 3.94
SIMC1-211ENST00000514128 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.63■■■■□ 3.93
SIMC1-211ENST00000514128 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.62■■■■□ 3.93
SIMC1-211ENST00000514128 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.62■■■■□ 3.93
SIMC1-211ENST00000514128 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.61■■■■□ 3.93
SIMC1-211ENST00000514128 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.61■■■■□ 3.93
SIMC1-211ENST00000514128 MADDQ8WXG6 1647 aa39.58■■■■□ 3.93
SIMC1-211ENST00000514128 PTPRMP28827 1452 aa39.56■■■■□ 3.92
SIMC1-211ENST00000514128 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.54■■■■□ 3.92
SIMC1-211ENST00000514128 PREX2Q70Z35 1606 aa39.49■■■■□ 3.91
SIMC1-211ENST00000514128 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.48■■■■□ 3.91
SIMC1-211ENST00000514128 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.47■■■■□ 3.91
SIMC1-211ENST00000514128 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
SIMC1-211ENST00000514128 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.43■■■■□ 3.9
SIMC1-211ENST00000514128 KDM5CP41229 1560 aa39.38■■■■□ 3.9
SIMC1-211ENST00000514128 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.38■■■■□ 3.89
SIMC1-211ENST00000514128 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.37■■■■□ 3.89
SIMC1-211ENST00000514128 ATP10AO60312 1499 aa39.37■■■■□ 3.89
SIMC1-211ENST00000514128 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.34■■■■□ 3.89
SIMC1-211ENST00000514128 ABCC1P33527 1531 aa39.34■■■■□ 3.89
SIMC1-211ENST00000514128 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.32■■■■□ 3.88
SIMC1-211ENST00000514128 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.31■■■■□ 3.88
SIMC1-211ENST00000514128 MLECQ14165 292 aa39.28■■■■□ 3.88
SIMC1-211ENST00000514128 AFAP1Q8N556 730 aa39.28■■■■□ 3.88
SIMC1-211ENST00000514128 CEP162Q5TB80 1403 aa39.24■■■■□ 3.87
SIMC1-211ENST00000514128 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.23■■■■□ 3.87
SIMC1-211ENST00000514128 ABCA6Q8N139 1617 aa39.2■■■■□ 3.87
SIMC1-211ENST00000514128 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.2■■■■□ 3.87
SIMC1-211ENST00000514128 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.19■■■■□ 3.86
SIMC1-211ENST00000514128 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.19■■■■□ 3.86
SIMC1-211ENST00000514128 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.19■■■■□ 3.86
SIMC1-211ENST00000514128 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.19■■■■□ 3.86
SIMC1-211ENST00000514128 REREQ9P2R6 1566 aa39.16■■■■□ 3.86
SIMC1-211ENST00000514128 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.16■■■■□ 3.86
SIMC1-211ENST00000514128 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
SIMC1-211ENST00000514128 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.15■■■■□ 3.86
SIMC1-211ENST00000514128 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
SIMC1-211ENST00000514128 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.11■■■■□ 3.85
SIMC1-211ENST00000514128 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.11■■■■□ 3.85
SIMC1-211ENST00000514128 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.11■■■■□ 3.85
SIMC1-211ENST00000514128 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.09■■■■□ 3.85
SIMC1-211ENST00000514128 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.05■■■■□ 3.84
SIMC1-211ENST00000514128 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.04■■■■□ 3.84
SIMC1-211ENST00000514128 AGLP35573 1532 aa39.01■■■■□ 3.84
SIMC1-211ENST00000514128 TIAM1Q13009 1591 aa38.99■■■■□ 3.83
SIMC1-211ENST00000514128 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa38.97■■■■□ 3.83
SIMC1-211ENST00000514128 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP38.96■■■■□ 3.83
SIMC1-211ENST00000514128 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
SIMC1-211ENST00000514128 PREX1Q8TCU6 1659 aa38.95■■■■□ 3.83
SIMC1-211ENST00000514128 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP38.94■■■■□ 3.82
SIMC1-211ENST00000514128 ATP7AQ04656 1500 aa38.93■■■■□ 3.82
SIMC1-211ENST00000514128 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP38.91■■■■□ 3.82
SIMC1-211ENST00000514128 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP38.91■■■■□ 3.82
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SIMC1-211ENST00000514128 HSPA2P54652 639 aa38.89■■■■□ 3.82
SIMC1-211ENST00000514128 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP38.86■■■■□ 3.81
SIMC1-211ENST00000514128 C3P01024 1663 aa38.85■■■■□ 3.81
SIMC1-211ENST00000514128 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.83■■■■□ 3.81
SIMC1-211ENST00000514128 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.83■■■■□ 3.81
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SIMC1-211ENST00000514128 CNTLNQ9NXG0 1405 aa38.8■■■■□ 3.8
SIMC1-211ENST00000514128 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.77■■■■□ 3.8
SIMC1-211ENST00000514128 PLXNC1O60486 1568 aa38.77■■■■□ 3.8
SIMC1-211ENST00000514128 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.77■■■■□ 3.8
SIMC1-211ENST00000514128 A2MP01023 1474 aa38.76■■■■□ 3.8
SIMC1-211ENST00000514128 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP38.76■■■■□ 3.8
SIMC1-211ENST00000514128 MROH2AA6NES4 1674 aa38.72■■■■□ 3.79
SIMC1-211ENST00000514128 MBD5Q9P267 1494 aa38.71■■■■□ 3.79
SIMC1-211ENST00000514128 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa38.69■■■■□ 3.78
SIMC1-211ENST00000514128 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.66■■■■□ 3.78
SIMC1-211ENST00000514128 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.65■■■■□ 3.78
SIMC1-211ENST00000514128 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.77
SIMC1-211ENST00000514128 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa38.63■■■■□ 3.77
SIMC1-211ENST00000514128 MAP3K1Q13233 1512 aa38.59■■■■□ 3.77
SIMC1-211ENST00000514128 FBXO41Q8TF61 875 aa38.57■■■■□ 3.76
SIMC1-211ENST00000514128 NPATQ14207 1427 aa38.55■■■■□ 3.76
SIMC1-211ENST00000514128 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.54■■■■□ 3.76
SIMC1-211ENST00000514128 GGT6Q6P531 493 aa38.54■■■■□ 3.76
SIMC1-211ENST00000514128 STRCQ7RTU9 1775 aa38.54■■■■□ 3.76
SIMC1-211ENST00000514128 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.53■■■■□ 3.76
SIMC1-211ENST00000514128 ZMYM3Q14202 1370 aa38.53■■■■□ 3.76
SIMC1-211ENST00000514128 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
SIMC1-211ENST00000514128 DMRT2Q9Y5R5 561 aa38.48■■■■□ 3.75
SIMC1-211ENST00000514128 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.45■■■■□ 3.75
SIMC1-211ENST00000514128 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
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SIMC1-211ENST00000514128 TSPY4P0CV99 314 aa38.41■■■■□ 3.74
SIMC1-211ENST00000514128 TSPY10P0CW01 314 aa38.41■■■■□ 3.74
SIMC1-211ENST00000514128 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.4■■■■□ 3.74
SIMC1-211ENST00000514128 APLP2Q06481 763 aa38.4■■■■□ 3.74
SIMC1-211ENST00000514128 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP38.38■■■■□ 3.73
SIMC1-211ENST00000514128 MIA2Q96PC5 1412 aa38.38■■■■□ 3.73
SIMC1-211ENST00000514128 PTPRKQ15262 1439 aa38.37■■■■□ 3.73
SIMC1-211ENST00000514128 KIF3BO15066 747 aa38.36■■■■□ 3.73
SIMC1-211ENST00000514128 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.36■■■■□ 3.73
SIMC1-211ENST00000514128 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.35■■■■□ 3.73
SIMC1-211ENST00000514128 NCOA1Q15788 1441 aa38.34■■■■□ 3.73
SIMC1-211ENST00000514128 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.34■■■■□ 3.73
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