RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508769.1

SIMC1-210, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIMC1, Length 461 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-210ENST00000508769 MADDQ8WXG6 1647 aa37.95■■■■□ 3.67
SIMC1-210ENST00000508769 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.94■■■■□ 3.66
SIMC1-210ENST00000508769 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.93■■■■□ 3.66
SIMC1-210ENST00000508769 CLIP1P30622 1438 aa37.93■■■■□ 3.66
SIMC1-210ENST00000508769 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
SIMC1-210ENST00000508769 PTPRMP28827 1452 aa37.91■■■■□ 3.66
SIMC1-210ENST00000508769 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.89■■■■□ 3.66
SIMC1-210ENST00000508769 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.89■■■■□ 3.66
SIMC1-210ENST00000508769 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.87■■■■□ 3.65
SIMC1-210ENST00000508769 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.86■■■■□ 3.65
SIMC1-210ENST00000508769 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.85■■■■□ 3.65
SIMC1-210ENST00000508769 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.65
SIMC1-210ENST00000508769 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.82■■■■□ 3.64
SIMC1-210ENST00000508769 PREX2Q70Z35 1606 aa37.81■■■■□ 3.64
SIMC1-210ENST00000508769 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.76■■■■□ 3.64
SIMC1-210ENST00000508769 KDM5CP41229 1560 aa37.72■■■■□ 3.63
SIMC1-210ENST00000508769 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.7■■■■□ 3.63
SIMC1-210ENST00000508769 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.7■■■■□ 3.63
SIMC1-210ENST00000508769 AFAP1Q8N556 730 aa37.69■■■■□ 3.62
SIMC1-210ENST00000508769 ABCC1P33527 1531 aa37.68■■■■□ 3.62
SIMC1-210ENST00000508769 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.66■■■■□ 3.62
SIMC1-210ENST00000508769 ATP10AO60312 1499 aa37.66■■■■□ 3.62
SIMC1-210ENST00000508769 MLECQ14165 292 aa37.65■■■■□ 3.62
SIMC1-210ENST00000508769 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa37.65■■■■□ 3.62
SIMC1-210ENST00000508769 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.63■■■■□ 3.61
SIMC1-210ENST00000508769 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.63■■■■□ 3.61
SIMC1-210ENST00000508769 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.61■■■■□ 3.61
SIMC1-210ENST00000508769 ABCA6Q8N139 1617 aa37.6■■■■□ 3.61
SIMC1-210ENST00000508769 CEP162Q5TB80 1403 aa37.6■■■■□ 3.61
SIMC1-210ENST00000508769 PLPPR3Q6T4P5 718 aa37.58■■■■□ 3.61
SIMC1-210ENST00000508769 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.56■■■■□ 3.6
SIMC1-210ENST00000508769 LMTK3Q96Q04 1460 aa37.56■■■■□ 3.6
SIMC1-210ENST00000508769 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
SIMC1-210ENST00000508769 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.52■■■■□ 3.6
SIMC1-210ENST00000508769 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.5■■■■□ 3.59
SIMC1-210ENST00000508769 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.49■■■■□ 3.59
SIMC1-210ENST00000508769 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.48■■■■□ 3.59
SIMC1-210ENST00000508769 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
SIMC1-210ENST00000508769 REREQ9P2R6 1566 aa37.46■■■■□ 3.59
SIMC1-210ENST00000508769 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.43■■■■□ 3.58
SIMC1-210ENST00000508769 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
SIMC1-210ENST00000508769 TIAM1Q13009 1591 aa37.39■■■■□ 3.58
SIMC1-210ENST00000508769 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.39■■■■□ 3.58
SIMC1-210ENST00000508769 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.38■■■■□ 3.57
SIMC1-210ENST00000508769 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.37■■■■□ 3.57
SIMC1-210ENST00000508769 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.36■■■■□ 3.57
SIMC1-210ENST00000508769 HSPA2P54652 639 aa37.35■■■■□ 3.57
SIMC1-210ENST00000508769 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
SIMC1-210ENST00000508769 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
SIMC1-210ENST00000508769 AGLP35573 1532 aa37.32■■■■□ 3.57
SIMC1-210ENST00000508769 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
SIMC1-210ENST00000508769 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
SIMC1-210ENST00000508769 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.27■■■■□ 3.56
SIMC1-210ENST00000508769 ATP7AQ04656 1500 aa37.26■■■■□ 3.55
SIMC1-210ENST00000508769 PREX1Q8TCU6 1659 aa37.25■■■■□ 3.55
SIMC1-210ENST00000508769 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
SIMC1-210ENST00000508769 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.24■■■■□ 3.55
SIMC1-210ENST00000508769 C3P01024 1663 aa37.24■■■■□ 3.55
SIMC1-210ENST00000508769 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
SIMC1-210ENST00000508769 NCOA2Q15596 1464 aa37.17■■■■□ 3.54
SIMC1-210ENST00000508769 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.16■■■■□ 3.54
SIMC1-210ENST00000508769 PLXNC1O60486 1568 aa37.16■■■■□ 3.54
SIMC1-210ENST00000508769 MBD5Q9P267 1494 aa37.15■■■■□ 3.54
SIMC1-210ENST00000508769 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
SIMC1-210ENST00000508769 A2MP01023 1474 aa37.09■■■■□ 3.53
SIMC1-210ENST00000508769 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.06■■■■□ 3.52
SIMC1-210ENST00000508769 ADGBQ8N7X0 1667 aa37.05■■■■□ 3.52
SIMC1-210ENST00000508769 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.03■■■■□ 3.52
SIMC1-210ENST00000508769 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa37.02■■■■□ 3.52
SIMC1-210ENST00000508769 STRCQ7RTU9 1775 aa37.02■■■■□ 3.52
SIMC1-210ENST00000508769 MROH2AA6NES4 1674 aa37.02■■■■□ 3.52
SIMC1-210ENST00000508769 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
SIMC1-210ENST00000508769 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
SIMC1-210ENST00000508769 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.01■■■■□ 3.51
SIMC1-210ENST00000508769 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
SIMC1-210ENST00000508769 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.95■■■■□ 3.51
SIMC1-210ENST00000508769 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.93■■■■□ 3.5
SIMC1-210ENST00000508769 ZMYM3Q14202 1370 aa36.91■■■■□ 3.5
SIMC1-210ENST00000508769 GGT6Q6P531 493 aa36.9■■■■□ 3.5
SIMC1-210ENST00000508769 MAP3K1Q13233 1512 aa36.89■■■■□ 3.5
SIMC1-210ENST00000508769 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.87■■■■□ 3.49
SIMC1-210ENST00000508769 FBXO41Q8TF61 875 aa36.87■■■■□ 3.49
SIMC1-210ENST00000508769 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
SIMC1-210ENST00000508769 NPATQ14207 1427 aa36.83■■■■□ 3.49
SIMC1-210ENST00000508769 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.78■■■■□ 3.48
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SIMC1-210ENST00000508769 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.75■■■■□ 3.47
SIMC1-210ENST00000508769 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.73■■■■□ 3.47
SIMC1-210ENST00000508769 KIF3BO15066 747 aa36.72■■■■□ 3.47
SIMC1-210ENST00000508769 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
SIMC1-210ENST00000508769 NCOA1Q15788 1441 aa36.72■■■■□ 3.47
SIMC1-210ENST00000508769 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.71■■■■□ 3.47
SIMC1-210ENST00000508769 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.7■■■■□ 3.47
SIMC1-210ENST00000508769 CERKQ8TCT0 537 aa36.69■■■■□ 3.46
SIMC1-210ENST00000508769 MIA2Q96PC5 1412 aa36.67■■■■□ 3.46
SIMC1-210ENST00000508769 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
SIMC1-210ENST00000508769 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.66■■■■□ 3.46
SIMC1-210ENST00000508769 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.64■■■■□ 3.46
SIMC1-210ENST00000508769 TSPY4P0CV99 314 aa36.64■■■■□ 3.46
SIMC1-210ENST00000508769 TSPY10P0CW01 314 aa36.64■■■■□ 3.46
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