RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498439.1

CHTF18-213, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 673 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-213ENST00000498439 MADDQ8WXG6 1647 aa29.79■■■□□ 2.36
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CHTF18-213ENST00000498439 KIF14Q15058 1648 aa29.71■■■□□ 2.35
CHTF18-213ENST00000498439 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
CHTF18-213ENST00000498439 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.7■■■□□ 2.35
CHTF18-213ENST00000498439 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.7■■■□□ 2.34
CHTF18-213ENST00000498439 MLECQ14165 292 aa29.69■■■□□ 2.34
CHTF18-213ENST00000498439 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
CHTF18-213ENST00000498439 ATP10AO60312 1499 aa29.68■■■□□ 2.34
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CHTF18-213ENST00000498439 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.62■■■□□ 2.33
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CHTF18-213ENST00000498439 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.61■■■□□ 2.33
CHTF18-213ENST00000498439 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.58■■■□□ 2.33
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CHTF18-213ENST00000498439 AFAP1Q8N556 730 aa29.57■■■□□ 2.32
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CHTF18-213ENST00000498439 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.49■■■□□ 2.31
CHTF18-213ENST00000498439 KDM5CP41229 1560 aa29.49■■■□□ 2.31
CHTF18-213ENST00000498439 HSPA2P54652 639 aa29.49■■■□□ 2.31
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CHTF18-213ENST00000498439 REREQ9P2R6 1566 aa29.42■■■□□ 2.3
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CHTF18-213ENST00000498439 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.36■■■□□ 2.29
CHTF18-213ENST00000498439 AGLP35573 1532 aa29.35■■■□□ 2.29
CHTF18-213ENST00000498439 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.34■■■□□ 2.29
CHTF18-213ENST00000498439 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.34■■■□□ 2.29
CHTF18-213ENST00000498439 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.34■■■□□ 2.29
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CHTF18-213ENST00000498439 ABCA6Q8N139 1617 aa29.29■■■□□ 2.28
CHTF18-213ENST00000498439 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.28■■■□□ 2.28
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CHTF18-213ENST00000498439 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.26■■■□□ 2.28
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CHTF18-213ENST00000498439 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.16■■■□□ 2.26
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CHTF18-213ENST00000498439 STRCQ7RTU9 1775 aa29.1■■■□□ 2.25
CHTF18-213ENST00000498439 NPATQ14207 1427 aa29.1■■■□□ 2.25
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CHTF18-213ENST00000498439 A2MP01023 1474 aa29.08■■■□□ 2.25
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CHTF18-213ENST00000498439 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.06■■■□□ 2.24
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CHTF18-213ENST00000498439 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.02■■■□□ 2.24
CHTF18-213ENST00000498439 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.24
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CHTF18-213ENST00000498439 PLXNC1O60486 1568 aa28.97■■■□□ 2.23
CHTF18-213ENST00000498439 TIAM1Q13009 1591 aa28.96■■■□□ 2.23
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CHTF18-213ENST00000498439 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
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CHTF18-213ENST00000498439 TSPY10P0CW01 314 aa28.92■■■□□ 2.22
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CHTF18-213ENST00000498439 KIF3BO15066 747 aa28.86■■■□□ 2.21
CHTF18-213ENST00000498439 NCOA2Q15596 1464 aa28.85■■■□□ 2.21
CHTF18-213ENST00000498439 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.85■■■□□ 2.21
CHTF18-213ENST00000498439 PLA2R1Q13018 1463 aa28.85■■■□□ 2.21
CHTF18-213ENST00000498439 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.84■■■□□ 2.21
CHTF18-213ENST00000498439 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
CHTF18-213ENST00000498439 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.81■■■□□ 2.2
CHTF18-213ENST00000498439 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.8■■■□□ 2.2
CHTF18-213ENST00000498439 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.8■■■□□ 2.2
CHTF18-213ENST00000498439 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.8■■■□□ 2.2
CHTF18-213ENST00000498439 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CHTF18-213ENST00000498439 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.79■■■□□ 2.2
CHTF18-213ENST00000498439 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.76■■■□□ 2.19
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