RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496725.1

KIDINS220-211, Transcript of kinase D interacting substrate 220, humanhuman

TSL 4

Gene KIDINS220, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIDINS220-211ENST00000496725 PREX2Q70Z35 1606 aa26.46■■□□□ 1.83
KIDINS220-211ENST00000496725 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.43■■□□□ 1.82
KIDINS220-211ENST00000496725 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.43■■□□□ 1.82
KIDINS220-211ENST00000496725 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.42■■□□□ 1.82
KIDINS220-211ENST00000496725 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.42■■□□□ 1.82
KIDINS220-211ENST00000496725 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.41■■□□□ 1.82
KIDINS220-211ENST00000496725 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.41■■□□□ 1.82
KIDINS220-211ENST00000496725 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.39■■□□□ 1.82
KIDINS220-211ENST00000496725 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.38■■□□□ 1.81
KIDINS220-211ENST00000496725 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.37■■□□□ 1.81
KIDINS220-211ENST00000496725 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
KIDINS220-211ENST00000496725 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.34■■□□□ 1.81
KIDINS220-211ENST00000496725 ABCC1P33527 1531 aa26.32■■□□□ 1.8
KIDINS220-211ENST00000496725 MAP3K1Q13233 1512 aa26.32■■□□□ 1.8
KIDINS220-211ENST00000496725 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.32■■□□□ 1.8
KIDINS220-211ENST00000496725 KDM5CP41229 1560 aa26.32■■□□□ 1.8
KIDINS220-211ENST00000496725 TIAM1Q13009 1591 aa26.32■■□□□ 1.8
KIDINS220-211ENST00000496725 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.28■■□□□ 1.8
KIDINS220-211ENST00000496725 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.27■■□□□ 1.8
KIDINS220-211ENST00000496725 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.27■■□□□ 1.8
KIDINS220-211ENST00000496725 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.26■■□□□ 1.79
KIDINS220-211ENST00000496725 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.25■■□□□ 1.79
KIDINS220-211ENST00000496725 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.24■■□□□ 1.79
KIDINS220-211ENST00000496725 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.24■■□□□ 1.79
KIDINS220-211ENST00000496725 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.23■■□□□ 1.79
KIDINS220-211ENST00000496725 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.23■■□□□ 1.79
KIDINS220-211ENST00000496725 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.23■■□□□ 1.79
KIDINS220-211ENST00000496725 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
KIDINS220-211ENST00000496725 AFAP1Q8N556 730 aa26.23■■□□□ 1.79
KIDINS220-211ENST00000496725 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
KIDINS220-211ENST00000496725 ATP10AO60312 1499 aa26.22■■□□□ 1.79
KIDINS220-211ENST00000496725 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.22■■□□□ 1.79
KIDINS220-211ENST00000496725 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.21■■□□□ 1.79
KIDINS220-211ENST00000496725 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.21■■□□□ 1.79
KIDINS220-211ENST00000496725 NCOA2Q15596 1464 aa26.18■■□□□ 1.78
KIDINS220-211ENST00000496725 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.17■■□□□ 1.78
KIDINS220-211ENST00000496725 REREQ9P2R6 1566 aa26.16■■□□□ 1.78
KIDINS220-211ENST00000496725 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.16■■□□□ 1.78
KIDINS220-211ENST00000496725 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.15■■□□□ 1.78
KIDINS220-211ENST00000496725 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
KIDINS220-211ENST00000496725 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
KIDINS220-211ENST00000496725 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.14■■□□□ 1.78
KIDINS220-211ENST00000496725 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.12■■□□□ 1.77
KIDINS220-211ENST00000496725 ABCA6Q8N139 1617 aa26.1■■□□□ 1.77
KIDINS220-211ENST00000496725 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.771e-7■■■■□ 26.4
KIDINS220-211ENST00000496725 MADDQ8WXG6 1647 aa26.08■■□□□ 1.77
KIDINS220-211ENST00000496725 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
KIDINS220-211ENST00000496725 MBD5Q9P267 1494 aa26.08■■□□□ 1.77
KIDINS220-211ENST00000496725 PTPRMP28827 1452 aa26.07■■□□□ 1.76
KIDINS220-211ENST00000496725 AGLP35573 1532 aa26.07■■□□□ 1.76
KIDINS220-211ENST00000496725 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
KIDINS220-211ENST00000496725 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
KIDINS220-211ENST00000496725 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
KIDINS220-211ENST00000496725 APLP2Q06481 763 aa26.03■■□□□ 1.76
KIDINS220-211ENST00000496725 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.03■■□□□ 1.76
KIDINS220-211ENST00000496725 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.02■■□□□ 1.76
KIDINS220-211ENST00000496725 ATP7AQ04656 1500 aa26.02■■□□□ 1.76
KIDINS220-211ENST00000496725 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26■■□□□ 1.75
KIDINS220-211ENST00000496725 MIA2Q96PC5 1412 aa26■■□□□ 1.75
KIDINS220-211ENST00000496725 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.99■■□□□ 1.75
KIDINS220-211ENST00000496725 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
KIDINS220-211ENST00000496725 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.97■■□□□ 1.75
KIDINS220-211ENST00000496725 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.97■■□□□ 1.75
KIDINS220-211ENST00000496725 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.97■■□□□ 1.75
KIDINS220-211ENST00000496725 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.96■■□□□ 1.75
KIDINS220-211ENST00000496725 PLXNC1O60486 1568 aa25.94■■□□□ 1.74
KIDINS220-211ENST00000496725 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.93■■□□□ 1.74
KIDINS220-211ENST00000496725 MLECQ14165 292 aa25.92■■□□□ 1.74
KIDINS220-211ENST00000496725 A2MP01023 1474 aa25.91■■□□□ 1.74
KIDINS220-211ENST00000496725 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.85■■□□□ 1.73
KIDINS220-211ENST00000496725 TSPY4P0CV99 314 aa25.83■■□□□ 1.73
KIDINS220-211ENST00000496725 TSPY10P0CW01 314 aa25.83■■□□□ 1.73
KIDINS220-211ENST00000496725 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
KIDINS220-211ENST00000496725 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.82■■□□□ 1.72
KIDINS220-211ENST00000496725 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
KIDINS220-211ENST00000496725 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.8■■□□□ 1.72
KIDINS220-211ENST00000496725 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.8■■□□□ 1.72
KIDINS220-211ENST00000496725 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.79■■□□□ 1.72
KIDINS220-211ENST00000496725 MROH2AA6NES4 1674 aa25.77■■□□□ 1.72
KIDINS220-211ENST00000496725 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.72
KIDINS220-211ENST00000496725 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.76■■□□□ 1.71
KIDINS220-211ENST00000496725 C3P01024 1663 aa25.75■■□□□ 1.71
KIDINS220-211ENST00000496725 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
KIDINS220-211ENST00000496725 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.73■■□□□ 1.71
KIDINS220-211ENST00000496725 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.71■■□□□ 1.71
KIDINS220-211ENST00000496725 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.71■■□□□ 1.71
KIDINS220-211ENST00000496725 ABCC5O15440 1437 aa25.71■■□□□ 1.71
KIDINS220-211ENST00000496725 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
KIDINS220-211ENST00000496725 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
KIDINS220-211ENST00000496725 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.7■■□□□ 1.7
KIDINS220-211ENST00000496725 ZMYM3Q14202 1370 aa25.67■■□□□ 1.7
KIDINS220-211ENST00000496725 DAPK1P53355 1430 aa25.66■■□□□ 1.7
KIDINS220-211ENST00000496725 GGT6Q6P531 493 aa25.66■■□□□ 1.7
KIDINS220-211ENST00000496725 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
KIDINS220-211ENST00000496725 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
KIDINS220-211ENST00000496725 NPATQ14207 1427 aa25.65■■□□□ 1.7
KIDINS220-211ENST00000496725 KIF3BO15066 747 aa25.64■■□□□ 1.7
KIDINS220-211ENST00000496725 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.64■■□□□ 1.7
KIDINS220-211ENST00000496725 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.63■■□□□ 1.69
KIDINS220-211ENST00000496725 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms