RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.2■■□□□ 1.46
TOM1-216ENST00000492723 KDM6BO15054 1643 aa24.18■■□□□ 1.46
TOM1-216ENST00000492723 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TOM1-216ENST00000492723 ROCK1Q13464 1354 aa24.18■■□□□ 1.46
TOM1-216ENST00000492723 TRIM52Q96A61 297 aa24.17■■□□□ 1.46
TOM1-216ENST00000492723 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.15■■□□□ 1.46
TOM1-216ENST00000492723 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.13■■□□□ 1.45
TOM1-216ENST00000492723 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.1■■□□□ 1.45
TOM1-216ENST00000492723 TONSLQ96HA7 1378 aa24.1■■□□□ 1.45
TOM1-216ENST00000492723 MIER1Q8N108 512 aa24.1■■□□□ 1.45
TOM1-216ENST00000492723 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.09■■□□□ 1.45
TOM1-216ENST00000492723 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
TOM1-216ENST00000492723 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.06■■□□□ 1.44
TOM1-216ENST00000492723 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
TOM1-216ENST00000492723 ABCC2Q92887 1545 aa24.04■■□□□ 1.44
TOM1-216ENST00000492723 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
TOM1-216ENST00000492723 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.03■■□□□ 1.44
TOM1-216ENST00000492723 NCOA1Q15788 1441 aa24.03■■□□□ 1.44
TOM1-216ENST00000492723 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.02■■□□□ 1.44
TOM1-216ENST00000492723 ADGRL2O95490 1459 aa23.99■■□□□ 1.43
TOM1-216ENST00000492723 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.98■■□□□ 1.43
TOM1-216ENST00000492723 FOXD1Q16676 465 aa23.96■■□□□ 1.43
TOM1-216ENST00000492723 PREX2Q70Z35 1606 aa23.93■■□□□ 1.42
TOM1-216ENST00000492723 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
TOM1-216ENST00000492723 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
TOM1-216ENST00000492723 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.93■■□□□ 1.42
TOM1-216ENST00000492723 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.93■■□□□ 1.42
TOM1-216ENST00000492723 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.92■■□□□ 1.42
TOM1-216ENST00000492723 TSPY4P0CV99 314 aa23.92■■□□□ 1.42
TOM1-216ENST00000492723 TSPY10P0CW01 314 aa23.92■■□□□ 1.42
TOM1-216ENST00000492723 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.91■■□□□ 1.42
TOM1-216ENST00000492723 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.42
TOM1-216ENST00000492723 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.89■■□□□ 1.42
TOM1-216ENST00000492723 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.89■■□□□ 1.42
TOM1-216ENST00000492723 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
TOM1-216ENST00000492723 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.89■■□□□ 1.41
TOM1-216ENST00000492723 KCNH8Q96L42 1107 aa23.89■■□□□ 1.41
TOM1-216ENST00000492723 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.88■■□□□ 1.41
TOM1-216ENST00000492723 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.88■■□□□ 1.41
TOM1-216ENST00000492723 MBD5Q9P267 1494 aa23.88■■□□□ 1.41
TOM1-216ENST00000492723 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
TOM1-216ENST00000492723 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.87■■□□□ 1.41
TOM1-216ENST00000492723 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
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TOM1-216ENST00000492723 PZPP20742 1482 aa23.86■■□□□ 1.41
TOM1-216ENST00000492723 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
TOM1-216ENST00000492723 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.84■■□□□ 1.41
TOM1-216ENST00000492723 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.81■■□□□ 1.4
TOM1-216ENST00000492723 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.81■■□□□ 1.4
TOM1-216ENST00000492723 KIF15Q9NS87 1388 aa23.81■■□□□ 1.4
TOM1-216ENST00000492723 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
TOM1-216ENST00000492723 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.8■■□□□ 1.4
TOM1-216ENST00000492723 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.79■■□□□ 1.4
TOM1-216ENST00000492723 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
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TOM1-216ENST00000492723 NUP155O75694 1391 aa23.75■■□□□ 1.39
TOM1-216ENST00000492723 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.75■■□□□ 1.39
TOM1-216ENST00000492723 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
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TOM1-216ENST00000492723 PLCH2O75038 1416 aa23.73■■□□□ 1.39
TOM1-216ENST00000492723 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.7■■□□□ 1.39
TOM1-216ENST00000492723 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.7■■□□□ 1.38
TOM1-216ENST00000492723 OSCARQ8IYS5 282 aa23.7■■□□□ 1.38
TOM1-216ENST00000492723 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.69■■□□□ 1.38
TOM1-216ENST00000492723 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.68■■□□□ 1.38
TOM1-216ENST00000492723 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.67■■□□□ 1.38
TOM1-216ENST00000492723 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.64■■□□□ 1.38
TOM1-216ENST00000492723 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
TOM1-216ENST00000492723 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.62■■□□□ 1.37
TOM1-216ENST00000492723 ABCC1P33527 1531 aa23.61■■□□□ 1.37
TOM1-216ENST00000492723 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
TOM1-216ENST00000492723 PLXNC1O60486 1568 aa23.61■■□□□ 1.37
TOM1-216ENST00000492723 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.58■■□□□ 1.36
TOM1-216ENST00000492723 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.57■■□□□ 1.36
TOM1-216ENST00000492723 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.57■■□□□ 1.36
TOM1-216ENST00000492723 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
TOM1-216ENST00000492723 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.54■■□□□ 1.36
TOM1-216ENST00000492723 ASXL2Q76L83 1435 aa23.54■■□□□ 1.36
TOM1-216ENST00000492723 UNC13BO14795 1591 aa23.53■■□□□ 1.36
TOM1-216ENST00000492723 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.52■■□□□ 1.36
TOM1-216ENST00000492723 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.51■■□□□ 1.35
TOM1-216ENST00000492723 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
TOM1-216ENST00000492723 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TOM1-216ENST00000492723 AFAP1Q8N556 730 aa23.5■■□□□ 1.35
TOM1-216ENST00000492723 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TOM1-216ENST00000492723 FANCAO15360 1455 aa23.5■■□□□ 1.35
TOM1-216ENST00000492723 ANP32CO43423 234 aa23.49■■□□□ 1.35
TOM1-216ENST00000492723 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.49■■□□□ 1.35
TOM1-216ENST00000492723 ERBINQ96RT1 1412 aa23.49■■□□□ 1.35
TOM1-216ENST00000492723 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.45■■□□□ 1.34
TOM1-216ENST00000492723 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.44■■□□□ 1.34
TOM1-216ENST00000492723 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.43■■□□□ 1.34
TOM1-216ENST00000492723 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.42■■□□□ 1.34
TOM1-216ENST00000492723 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.42■■□□□ 1.34
TOM1-216ENST00000492723 ADGRL1O94910 1474 aa23.41■■□□□ 1.34
TOM1-216ENST00000492723 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.41■■□□□ 1.34
TOM1-216ENST00000492723 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TOM1-216ENST00000492723 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.4■■□□□ 1.34
TOM1-216ENST00000492723 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.4■■□□□ 1.34
TOM1-216ENST00000492723 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.39■■□□□ 1.34
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