RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.95■■■■□ 3.67
CTDSP1-211ENST00000492545 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.94■■■■□ 3.66
CTDSP1-211ENST00000492545 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.91■■■■□ 3.66
CTDSP1-211ENST00000492545 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
CTDSP1-211ENST00000492545 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.86■■■■□ 3.65
CTDSP1-211ENST00000492545 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.84■■■■□ 3.65
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.84■■■■□ 3.65
CTDSP1-211ENST00000492545 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.8■■■■□ 3.64
CTDSP1-211ENST00000492545 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.8■■■■□ 3.64
CTDSP1-211ENST00000492545 PREX2Q70Z35 1606 aa37.79■■■■□ 3.64
CTDSP1-211ENST00000492545 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.78■■■■□ 3.64
CTDSP1-211ENST00000492545 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.77■■■■□ 3.64
CTDSP1-211ENST00000492545 AFAP1Q8N556 730 aa37.77■■■■□ 3.64
CTDSP1-211ENST00000492545 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.73■■■■□ 3.63
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP10AO60312 1499 aa37.72■■■■□ 3.63
CTDSP1-211ENST00000492545 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
CTDSP1-211ENST00000492545 KDM5CP41229 1560 aa37.7■■■■□ 3.63
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPRMP28827 1452 aa37.69■■■■□ 3.62
CTDSP1-211ENST00000492545 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.68■■■■□ 3.62
CTDSP1-211ENST00000492545 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.68■■■■□ 3.62
CTDSP1-211ENST00000492545 ABCC1P33527 1531 aa37.67■■■■□ 3.62
CTDSP1-211ENST00000492545 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
CTDSP1-211ENST00000492545 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.66■■■■□ 3.62
CTDSP1-211ENST00000492545 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.66■■■■□ 3.62
CTDSP1-211ENST00000492545 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.65■■■■□ 3.62
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
CTDSP1-211ENST00000492545 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.63■■■■□ 3.61
CTDSP1-211ENST00000492545 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.62■■■■□ 3.61
CTDSP1-211ENST00000492545 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.61■■■■□ 3.61
CTDSP1-211ENST00000492545 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.61■■■■□ 3.61
CTDSP1-211ENST00000492545 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.59■■■■□ 3.61
CTDSP1-211ENST00000492545 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.58■■■■□ 3.61
CTDSP1-211ENST00000492545 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.58■■■■□ 3.61
CTDSP1-211ENST00000492545 MADDQ8WXG6 1647 aa37.58■■■■□ 3.61
CTDSP1-211ENST00000492545 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.54■■■■□ 3.6
CTDSP1-211ENST00000492545 MLECQ14165 292 aa37.53■■■■□ 3.6
CTDSP1-211ENST00000492545 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.52■■■■□ 3.6
CTDSP1-211ENST00000492545 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.51■■■■□ 3.6
CTDSP1-211ENST00000492545 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.5■■■■□ 3.59
CTDSP1-211ENST00000492545 REREQ9P2R6 1566 aa37.49■■■■□ 3.59
CTDSP1-211ENST00000492545 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.47■■■■□ 3.59
CTDSP1-211ENST00000492545 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
CTDSP1-211ENST00000492545 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.46■■■■□ 3.59
CTDSP1-211ENST00000492545 TIAM1Q13009 1591 aa37.45■■■■□ 3.59
CTDSP1-211ENST00000492545 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
CTDSP1-211ENST00000492545 MAP3K1Q13233 1512 aa37.41■■■■□ 3.58
CTDSP1-211ENST00000492545 NCOA2Q15596 1464 aa37.4■■■■□ 3.58
CTDSP1-211ENST00000492545 ABCA6Q8N139 1617 aa37.4■■■■□ 3.58
CTDSP1-211ENST00000492545 AGLP35573 1532 aa37.4■■■■□ 3.58
CTDSP1-211ENST00000492545 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.38■■■■□ 3.57
CTDSP1-211ENST00000492545 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
CTDSP1-211ENST00000492545 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.36■■■■□ 3.57
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
CTDSP1-211ENST00000492545 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa37.33■■■■□ 3.57
CTDSP1-211ENST00000492545 RSPH4AQ5TD94 716 aa37.33■■■■□ 3.57
CTDSP1-211ENST00000492545 MBD5Q9P267 1494 aa37.31■■■■□ 3.56
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP7AQ04656 1500 aa37.28■■■■□ 3.56
CTDSP1-211ENST00000492545 PLPPR3Q6T4P5 718 aa37.27■■■■□ 3.56
CTDSP1-211ENST00000492545 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
CTDSP1-211ENST00000492545 APLP2Q06481 763 aa37.26■■■■□ 3.56
CTDSP1-211ENST00000492545 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
CTDSP1-211ENST00000492545 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.23■■■■□ 3.55
CTDSP1-211ENST00000492545 LMTK3Q96Q04 1460 aa37.23■■■■□ 3.55
CTDSP1-211ENST00000492545 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
CTDSP1-211ENST00000492545 A2MP01023 1474 aa37.2■■■■□ 3.54
CTDSP1-211ENST00000492545 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.18■■■■□ 3.54
CTDSP1-211ENST00000492545 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.18■■■■□ 3.54
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC141Q6ZP82 1450 aa37.16■■■■□ 3.54
CTDSP1-211ENST00000492545 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
CTDSP1-211ENST00000492545 TSPY4P0CV99 314 aa37.12■■■■□ 3.53
CTDSP1-211ENST00000492545 TSPY10P0CW01 314 aa37.12■■■■□ 3.53
CTDSP1-211ENST00000492545 PLXNC1O60486 1568 aa37.12■■■■□ 3.53
CTDSP1-211ENST00000492545 MIA2Q96PC5 1412 aa37.11■■■■□ 3.53
CTDSP1-211ENST00000492545 PPP6R1Q9UPN7 881 aa37.11■■■■□ 3.53
CTDSP1-211ENST00000492545 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.08■■■■□ 3.53
CTDSP1-211ENST00000492545 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.53
CTDSP1-211ENST00000492545 ADGBQ8N7X0 1667 aa37.06■■■■□ 3.52
CTDSP1-211ENST00000492545 ARHGEF5Q12774 1597 aa37.06■■■■□ 3.52
CTDSP1-211ENST00000492545 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
CTDSP1-211ENST00000492545 HSPA2P54652 639 aa37.03■■■■□ 3.52
CTDSP1-211ENST00000492545 GGT6Q6P531 493 aa37.02■■■■□ 3.52
CTDSP1-211ENST00000492545 ZMYM3Q14202 1370 aa36.98■■■■□ 3.51
CTDSP1-211ENST00000492545 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.98■■■■□ 3.51
CTDSP1-211ENST00000492545 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.97■■■■□ 3.51
CTDSP1-211ENST00000492545 C3P01024 1663 aa36.96■■■■□ 3.51
CTDSP1-211ENST00000492545 NPATQ14207 1427 aa36.93■■■■□ 3.5
CTDSP1-211ENST00000492545 MROH2AA6NES4 1674 aa36.93■■■■□ 3.5
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF3BO15066 747 aa36.91■■■■□ 3.5
CTDSP1-211ENST00000492545 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.87■■■■□ 3.49
CTDSP1-211ENST00000492545 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.81■■■■□ 3.48
CTDSP1-211ENST00000492545 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.8■■■■□ 3.48
CTDSP1-211ENST00000492545 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.79■■■■□ 3.48
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPRKQ15262 1439 aa36.76■■■■□ 3.48
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.76■■■■□ 3.48
CTDSP1-211ENST00000492545 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.76■■■■□ 3.47
CTDSP1-211ENST00000492545 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
CTDSP1-211ENST00000492545 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
CTDSP1-211ENST00000492545 ABCC5O15440 1437 aa36.73■■■■□ 3.47
CTDSP1-211ENST00000492545 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.73■■■■□ 3.47
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