RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490316.6

MTMR1-211, Transcript of myotubularin related protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MTMR1, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1-211ENST00000490316 ADAMTSL3P82987 1691 aa47.13■■■■■ 5.14
MTMR1-211ENST00000490316 POGZQ7Z3K3 1410 aa47.13■■■■■ 5.13
MTMR1-211ENST00000490316 MAGI2Q86UL8 1455 aa47.11■■■■■ 5.13
MTMR1-211ENST00000490316 ARHGAP5Q13017 1502 aa47.1■■■■■ 5.13
MTMR1-211ENST00000490316 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa47.09■■■■■ 5.13
MTMR1-211ENST00000490316 BCORL1Q5H9F3 1711 aa47.08■■■■■ 5.13
MTMR1-211ENST00000490316 YEATS2Q9ULM3 1422 aa47.05■■■■■ 5.12
MTMR1-211ENST00000490316 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa47.02■■■■■ 5.12
MTMR1-211ENST00000490316 HECW2Q9P2P5 1572 aa46.98■■■■■ 5.11
MTMR1-211ENST00000490316 PTPRMP28827 1452 aa46.97■■■■■ 5.11
MTMR1-211ENST00000490316 PREX2Q70Z35 1606 aa46.97■■■■■ 5.11
MTMR1-211ENST00000490316 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa46.94■■■■■ 5.1
MTMR1-211ENST00000490316 MADDQ8WXG6 1647 aa46.94■■■■■ 5.1
MTMR1-211ENST00000490316 CEP162Q5TB80 1403 aa46.9■■■■■ 5.1
MTMR1-211ENST00000490316 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa46.89■■■■■ 5.1
MTMR1-211ENST00000490316 AFAP1Q8N556 730 aa46.87■■■■■ 5.09
MTMR1-211ENST00000490316 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa46.87■■■■■ 5.09
MTMR1-211ENST00000490316 ATP10AO60312 1499 aa46.85■■■■■ 5.09
MTMR1-211ENST00000490316 KDM5CP41229 1560 aa46.85■■■■■ 5.09
MTMR1-211ENST00000490316 ABCC1P33527 1531 aa46.79■■■■■ 5.08
MTMR1-211ENST00000490316 C9orf84Q5VXU9 1444 aa46.79■■■■■ 5.08
MTMR1-211ENST00000490316 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP46.78■■■■■ 5.08
MTMR1-211ENST00000490316 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa46.75■■■■■ 5.07
MTMR1-211ENST00000490316 MYT1LQ9UL68 1186 aa46.73■■■■■ 5.07
MTMR1-211ENST00000490316 ITSN2Q9NZM3 1697 aa46.73■■■■■ 5.07
MTMR1-211ENST00000490316 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP46.73■■■■■ 5.07
MTMR1-211ENST00000490316 MTUS2Q5JR59 1369 aa46.73■■■■■ 5.07
MTMR1-211ENST00000490316 MLECQ14165 292 aa46.72■■■■■ 5.07
MTMR1-211ENST00000490316 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa46.71■■■■■ 5.07
MTMR1-211ENST00000490316 MLH3Q9UHC1 1453 aa46.69■■■■■ 5.06
MTMR1-211ENST00000490316 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.68■■■■■ 5.06
MTMR1-211ENST00000490316 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP46.67■■■■■ 5.06
MTMR1-211ENST00000490316 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa46.64■■■■■ 5.06
MTMR1-211ENST00000490316 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa46.63■■■■■ 5.06
MTMR1-211ENST00000490316 CCNB3Q8WWL7 1395 aa46.62■■■■■ 5.05
MTMR1-211ENST00000490316 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa46.6■■■■■ 5.05
MTMR1-211ENST00000490316 ABCA6Q8N139 1617 aa46.58■■■■■ 5.05
MTMR1-211ENST00000490316 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP46.58■■■■■ 5.05
MTMR1-211ENST00000490316 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa46.58■■■■■ 5.05
MTMR1-211ENST00000490316 REREQ9P2R6 1566 aa46.57■■■■■ 5.05
MTMR1-211ENST00000490316 SYCP2Q9BX26 1530 aa46.54■■■■■ 5.04
MTMR1-211ENST00000490316 PLPPR3Q6T4P5 718 aa46.52■■■■■ 5.04
MTMR1-211ENST00000490316 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa46.51■■■■■ 5.04
MTMR1-211ENST00000490316 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP46.5■■■■■ 5.03
MTMR1-211ENST00000490316 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa46.49■■■■■ 5.03
MTMR1-211ENST00000490316 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa46.48■■■■■ 5.03
MTMR1-211ENST00000490316 TIAM1Q13009 1591 aa46.47■■■■■ 5.03
MTMR1-211ENST00000490316 LMTK3Q96Q04 1460 aa46.45■■■■■ 5.03
MTMR1-211ENST00000490316 AGLP35573 1532 aa46.42■■■■■ 5.02
MTMR1-211ENST00000490316 VPS8Q8N3P4 1428 aa46.41■■■■■ 5.02
MTMR1-211ENST00000490316 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
MTMR1-211ENST00000490316 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP46.33■■■■■ 5.01
MTMR1-211ENST00000490316 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP46.31■■■■■ 5
MTMR1-211ENST00000490316 ATP7AQ04656 1500 aa46.3■■■■■ 5
MTMR1-211ENST00000490316 NCOA2Q15596 1464 aa46.3■■■■■ 5
MTMR1-211ENST00000490316 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP46.28■■■■■ 5
MTMR1-211ENST00000490316 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP46.27■■■■■ 5
MTMR1-211ENST00000490316 MBD5Q9P267 1494 aa46.23■■■■■ 4.99
MTMR1-211ENST00000490316 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP46.22■■■■■ 4.99
MTMR1-211ENST00000490316 HSPA2P54652 639 aa46.21■■■■■ 4.99
MTMR1-211ENST00000490316 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa46.19■■■■■ 4.98
MTMR1-211ENST00000490316 PREX1Q8TCU6 1659 aa46.15■■■■■ 4.98
MTMR1-211ENST00000490316 A2MP01023 1474 aa46.14■■■■■ 4.98
MTMR1-211ENST00000490316 MAP3K1Q13233 1512 aa46.13■■■■■ 4.98
MTMR1-211ENST00000490316 C3P01024 1663 aa46.12■■■■■ 4.97
MTMR1-211ENST00000490316 PLXNC1O60486 1568 aa46.12■■■■■ 4.97
MTMR1-211ENST00000490316 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP46.11■■■■■ 4.97
MTMR1-211ENST00000490316 CNTLNQ9NXG0 1405 aa46.11■■■■■ 4.97
MTMR1-211ENST00000490316 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa46.1■■■■■ 4.97
MTMR1-211ENST00000490316 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa46.08■■■■■ 4.97
MTMR1-211ENST00000490316 ADGBQ8N7X0 1667 aa46.08■■■■■ 4.97
MTMR1-211ENST00000490316 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP46.05■■■■■ 4.96
MTMR1-211ENST00000490316 RSPH4AQ5TD94 716 aa46.04■■■■■ 4.96
MTMR1-211ENST00000490316 CCDC141Q6ZP82 1450 aa46.03■■■■■ 4.96
MTMR1-211ENST00000490316 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
MTMR1-211ENST00000490316 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa46■■■■■ 4.95
MTMR1-211ENST00000490316 MROH2AA6NES4 1674 aa45.97■■■■■ 4.95
MTMR1-211ENST00000490316 GGT6Q6P531 493 aa45.93■■■■■ 4.94
MTMR1-211ENST00000490316 ARHGEF5Q12774 1597 aa45.92■■■■■ 4.94
MTMR1-211ENST00000490316 ZMYM3Q14202 1370 aa45.91■■■■■ 4.94
MTMR1-211ENST00000490316 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP45.91■■■■■ 4.94
MTMR1-211ENST00000490316 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP45.88■■■■■ 4.94
MTMR1-211ENST00000490316 APLP2Q06481 763 aa45.87■■■■■ 4.93
MTMR1-211ENST00000490316 PPP6R1Q9UPN7 881 aa45.86■■■■■ 4.93
MTMR1-211ENST00000490316 TSPY4P0CV99 314 aa45.85■■■■■ 4.93
MTMR1-211ENST00000490316 TSPY10P0CW01 314 aa45.85■■■■■ 4.93
MTMR1-211ENST00000490316 MYOM3Q5VTT5 1437 aa45.84■■■■■ 4.93
MTMR1-211ENST00000490316 NPATQ14207 1427 aa45.83■■■■■ 4.93
MTMR1-211ENST00000490316 MIA2Q96PC5 1412 aa45.83■■■■■ 4.93
MTMR1-211ENST00000490316 STRCQ7RTU9 1775 aa45.75■■■■■ 4.91
MTMR1-211ENST00000490316 KIF3BO15066 747 aa45.74■■■■■ 4.91
MTMR1-211ENST00000490316 DMRT2Q9Y5R5 561 aa45.7■■■■■ 4.91
MTMR1-211ENST00000490316 MAST1Q9Y2H9 1570 aa45.7■■■■■ 4.91
MTMR1-211ENST00000490316 FBXO41Q8TF61 875 aa45.69■■■■■ 4.9
MTMR1-211ENST00000490316 PTPRKQ15262 1439 aa45.68■■■■■ 4.9
MTMR1-211ENST00000490316 FAM135AQ9P2D6 1515 aa45.59■■■■■ 4.89
MTMR1-211ENST00000490316 KDM5DQ9BY66 1539 aa45.57■■■■■ 4.88
MTMR1-211ENST00000490316 MYO3AQ8NEV4 1616 aa45.56■■■■■ 4.88
MTMR1-211ENST00000490316 PTPN23Q9H3S7 1636 aa45.55■■■■■ 4.88
MTMR1-211ENST00000490316 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa45.54■■■■■ 4.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.2 ms