RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 PREX2Q70Z35 1606 aa39.99■■■■□ 3.99
HOXB3-210ENST00000489475 ASXL2Q76L83 1435 aa39.99■■■■□ 3.99
HOXB3-210ENST00000489475 SETD5Q9C0A6 1442 aa39.99■■■■□ 3.99
HOXB3-210ENST00000489475 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
HOXB3-210ENST00000489475 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
HOXB3-210ENST00000489475 DAPK1P53355 1430 aa39.92■■■■□ 3.98
HOXB3-210ENST00000489475 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.92■■■■□ 3.98
HOXB3-210ENST00000489475 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.92■■■■□ 3.98
HOXB3-210ENST00000489475 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa39.92■■■■□ 3.98
HOXB3-210ENST00000489475 ABCC5O15440 1437 aa39.89■■■■□ 3.98
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.88■■■■□ 3.97
HOXB3-210ENST00000489475 HFM1A2PYH4 1435 aa39.87■■■■□ 3.97
HOXB3-210ENST00000489475 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.86■■■■□ 3.97
HOXB3-210ENST00000489475 PLCH2O75038 1416 aa39.84■■■■□ 3.97
HOXB3-210ENST00000489475 AKNAQ7Z591 1439 aa39.8■■■■□ 3.96
HOXB3-210ENST00000489475 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.79■■■■□ 3.96
HOXB3-210ENST00000489475 NAIPQ13075 1403 aa39.78■■■■□ 3.96
HOXB3-210ENST00000489475 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.78■■■■□ 3.96
HOXB3-210ENST00000489475 ROCK1Q13464 1354 aa39.76■■■■□ 3.96
HOXB3-210ENST00000489475 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.75■■■■□ 3.95
HOXB3-210ENST00000489475 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.75■■■■□ 3.95
HOXB3-210ENST00000489475 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.74■■■■□ 3.95
HOXB3-210ENST00000489475 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.72■■■■□ 3.95
HOXB3-210ENST00000489475 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.72■■■■□ 3.95
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.71■■■■□ 3.95
HOXB3-210ENST00000489475 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
HOXB3-210ENST00000489475 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.71■■■■□ 3.952e-6■■■■□ 24.7
HOXB3-210ENST00000489475 MAPKBP1O60336 1514 aa39.7■■■■□ 3.95
HOXB3-210ENST00000489475 MBD5Q9P267 1494 aa39.69■■■■□ 3.94
HOXB3-210ENST00000489475 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.68■■■■□ 3.94
HOXB3-210ENST00000489475 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.68■■■■□ 3.94
HOXB3-210ENST00000489475 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.67■■■■□ 3.94
HOXB3-210ENST00000489475 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.66■■■■□ 3.94
HOXB3-210ENST00000489475 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.64■■■■□ 3.94
HOXB3-210ENST00000489475 TSPY4P0CV99 314 aa39.64■■■■□ 3.94
HOXB3-210ENST00000489475 TSPY10P0CW01 314 aa39.64■■■■□ 3.94
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.63■■■■□ 3.94
HOXB3-210ENST00000489475 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.63■■■■□ 3.93
HOXB3-210ENST00000489475 ADGRL2O95490 1459 aa39.62■■■■□ 3.93
HOXB3-210ENST00000489475 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.6■■■■□ 3.93
HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.59■■■■□ 3.93
HOXB3-210ENST00000489475 NCOA1Q15788 1441 aa39.59■■■■□ 3.93
HOXB3-210ENST00000489475 CLSPNQ9HAW4 1339 aa39.58■■■■□ 3.93
HOXB3-210ENST00000489475 FANCAO15360 1455 aa39.56■■■■□ 3.92
HOXB3-210ENST00000489475 ABCC1P33527 1531 aa39.55■■■■□ 3.92
HOXB3-210ENST00000489475 CD109Q6YHK3 1445 aa39.52■■■■□ 3.92
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.51■■■■□ 3.92
HOXB3-210ENST00000489475 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
HOXB3-210ENST00000489475 KDM6BO15054 1643 aa39.46■■■■□ 3.91
HOXB3-210ENST00000489475 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.44■■■■□ 3.9
HOXB3-210ENST00000489475 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.39■■■■□ 3.9
HOXB3-210ENST00000489475 GLI2P10070 1586 aa39.39■■■■□ 3.9
HOXB3-210ENST00000489475 ADGRL1O94910 1474 aa39.39■■■■□ 3.9
HOXB3-210ENST00000489475 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.39■■■■□ 3.9
HOXB3-210ENST00000489475 KIF15Q9NS87 1388 aa39.37■■■■□ 3.89
HOXB3-210ENST00000489475 TRIM52Q96A61 297 aa39.37■■■■□ 3.89
HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.35■■■■□ 3.89
HOXB3-210ENST00000489475 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.34■■■■□ 3.89
HOXB3-210ENST00000489475 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.32■■■■□ 3.88
HOXB3-210ENST00000489475 DIP2BQ9P265 1576 aa39.3■■■■□ 3.88
HOXB3-210ENST00000489475 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.29■■■■□ 3.88
HOXB3-210ENST00000489475 AFAP1Q8N556 730 aa39.29■■■■□ 3.88
HOXB3-210ENST00000489475 PLXNC1O60486 1568 aa39.28■■■■□ 3.88
HOXB3-210ENST00000489475 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
HOXB3-210ENST00000489475 NEO1Q92859 1461 aa39.25■■■■□ 3.87
HOXB3-210ENST00000489475 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.24■■■■□ 3.87
HOXB3-210ENST00000489475 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.17■■■■□ 3.86
HOXB3-210ENST00000489475 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.17■■■■□ 3.86
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.17■■■■□ 3.86
HOXB3-210ENST00000489475 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.16■■■■□ 3.86
HOXB3-210ENST00000489475 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.13■■■■□ 3.85
HOXB3-210ENST00000489475 ATP7AQ04656 1500 aa39.12■■■■□ 3.85
HOXB3-210ENST00000489475 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.11■■■■□ 3.85
HOXB3-210ENST00000489475 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.09■■■■□ 3.85
HOXB3-210ENST00000489475 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.08■■■■□ 3.85
HOXB3-210ENST00000489475 ERBINQ96RT1 1412 aa39.07■■■■□ 3.85
HOXB3-210ENST00000489475 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
HOXB3-210ENST00000489475 PZPP20742 1482 aa39.05■■■■□ 3.84
HOXB3-210ENST00000489475 NUP155O75694 1391 aa39.04■■■■□ 3.84
HOXB3-210ENST00000489475 KDM5CP41229 1560 aa39.03■■■■□ 3.84
HOXB3-210ENST00000489475 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.03■■■■□ 3.84
HOXB3-210ENST00000489475 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.02■■■■□ 3.84
HOXB3-210ENST00000489475 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.01■■■■□ 3.84
HOXB3-210ENST00000489475 KDM5DQ9BY66 1539 aa39■■■■□ 3.83
HOXB3-210ENST00000489475 TSPOAP1O95153 1857 aa39■■■■□ 3.83
HOXB3-210ENST00000489475 NEUROD1Q13562 356 aa39■■■■□ 3.83
HOXB3-210ENST00000489475 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa38.97■■■■□ 3.83
HOXB3-210ENST00000489475 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.96■■■■□ 3.83
HOXB3-210ENST00000489475 MLH3Q9UHC1 1453 aa38.96■■■■□ 3.83
HOXB3-210ENST00000489475 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.95■■■■□ 3.83
HOXB3-210ENST00000489475 UNC13BO14795 1591 aa38.94■■■■□ 3.82
HOXB3-210ENST00000489475 RAPGEF3O95398 923 aa38.94■■■■□ 3.82
HOXB3-210ENST00000489475 HECW2Q9P2P5 1572 aa38.93■■■■□ 3.82
HOXB3-210ENST00000489475 FOXD1Q16676 465 aa38.91■■■■□ 3.82
HOXB3-210ENST00000489475 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa38.91■■■■□ 3.82
HOXB3-210ENST00000489475 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
HOXB3-210ENST00000489475 RICTORQ6R327 1708 aa38.89■■■■□ 3.82
HOXB3-210ENST00000489475 PKD2Q13563 968 aa38.87■■■■□ 3.81
HOXB3-210ENST00000489475 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.86■■■■□ 3.81
HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa38.86■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms