RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486204.5

SSR4-211, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 658 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-211ENST00000486204 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.92■□□□□ 0.94
SSR4-211ENST00000486204 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.92■□□□□ 0.94
SSR4-211ENST00000486204 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.89■□□□□ 0.94
SSR4-211ENST00000486204 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.88■□□□□ 0.93
SSR4-211ENST00000486204 RICTORQ6R327 1708 aa20.87■□□□□ 0.93
SSR4-211ENST00000486204 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SSR4-211ENST00000486204 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.84■□□□□ 0.93
SSR4-211ENST00000486204 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.83■□□□□ 0.93
SSR4-211ENST00000486204 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.83■□□□□ 0.92
SSR4-211ENST00000486204 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.83■□□□□ 0.92
SSR4-211ENST00000486204 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.82■□□□□ 0.92
SSR4-211ENST00000486204 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.82■□□□□ 0.92
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SSR4-211ENST00000486204 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.81■□□□□ 0.92
SSR4-211ENST00000486204 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.81■□□□□ 0.92
SSR4-211ENST00000486204 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.78■□□□□ 0.92
SSR4-211ENST00000486204 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.77■□□□□ 0.92
SSR4-211ENST00000486204 STRCQ7RTU9 1775 aa20.77■□□□□ 0.91
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SSR4-211ENST00000486204 ATP10AO60312 1499 aa20.73■□□□□ 0.91
SSR4-211ENST00000486204 PTPRTO14522 1441 aa20.72■□□□□ 0.91
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SSR4-211ENST00000486204 KIF14Q15058 1648 aa20.71■□□□□ 0.91
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SSR4-211ENST00000486204 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.66■□□□□ 0.9
SSR4-211ENST00000486204 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.64■□□□□ 0.89
SSR4-211ENST00000486204 PLCH2O75038 1416 aa20.64■□□□□ 0.89
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SSR4-211ENST00000486204 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SSR4-211ENST00000486204 TIAM1Q13009 1591 aa20.61■□□□□ 0.89
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SSR4-211ENST00000486204 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.59■□□□□ 0.89
SSR4-211ENST00000486204 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.58■□□□□ 0.89
SSR4-211ENST00000486204 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.57■□□□□ 0.88
SSR4-211ENST00000486204 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.57■□□□□ 0.88
SSR4-211ENST00000486204 PREX2Q70Z35 1606 aa20.56■□□□□ 0.88
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SSR4-211ENST00000486204 AFAP1Q8N556 730 aa20.55■□□□□ 0.88
SSR4-211ENST00000486204 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.54■□□□□ 0.88
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SSR4-211ENST00000486204 C3P01024 1663 aa20.5■□□□□ 0.87
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SSR4-211ENST00000486204 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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SSR4-211ENST00000486204 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.43■□□□□ 0.86
SSR4-211ENST00000486204 REREQ9P2R6 1566 aa20.43■□□□□ 0.86
SSR4-211ENST00000486204 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.41■□□□□ 0.86
SSR4-211ENST00000486204 AGLP35573 1532 aa20.41■□□□□ 0.86
SSR4-211ENST00000486204 HSPA1LP34931 641 aa20.4■□□□□ 0.86
SSR4-211ENST00000486204 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
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SSR4-211ENST00000486204 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.39■□□□□ 0.85
SSR4-211ENST00000486204 NCOA2Q15596 1464 aa20.38■□□□□ 0.85
SSR4-211ENST00000486204 PKD2Q13563 968 aa20.38■□□□□ 0.85
SSR4-211ENST00000486204 ABCA6Q8N139 1617 aa20.38■□□□□ 0.85
SSR4-211ENST00000486204 ABCC1P33527 1531 aa20.37■□□□□ 0.85
SSR4-211ENST00000486204 NPATQ14207 1427 aa20.37■□□□□ 0.85
SSR4-211ENST00000486204 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SSR4-211ENST00000486204 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SSR4-211ENST00000486204 PIP4K2BP78356 416 aa20.35■□□□□ 0.85
SSR4-211ENST00000486204 ZMYM3Q14202 1370 aa20.34■□□□□ 0.85
SSR4-211ENST00000486204 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SSR4-211ENST00000486204 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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SSR4-211ENST00000486204 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.3■□□□□ 0.84
SSR4-211ENST00000486204 PLA2R1Q13018 1463 aa20.3■□□□□ 0.84
SSR4-211ENST00000486204 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.28■□□□□ 0.84
SSR4-211ENST00000486204 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SSR4-211ENST00000486204 MROH2AA6NES4 1674 aa20.25■□□□□ 0.83
SSR4-211ENST00000486204 APLP2Q06481 763 aa20.23■□□□□ 0.83
SSR4-211ENST00000486204 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.23■□□□□ 0.83
SSR4-211ENST00000486204 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.22■□□□□ 0.83
SSR4-211ENST00000486204 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.22■□□□□ 0.83
SSR4-211ENST00000486204 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.22■□□□□ 0.83
SSR4-211ENST00000486204 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SSR4-211ENST00000486204 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SSR4-211ENST00000486204 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.2■□□□□ 0.82
SSR4-211ENST00000486204 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SSR4-211ENST00000486204 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.2■□□□□ 0.82
SSR4-211ENST00000486204 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SSR4-211ENST00000486204 PTPRKQ15262 1439 aa20.19■□□□□ 0.82
SSR4-211ENST00000486204 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.18■□□□□ 0.82
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