RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482320.5

TNPO3-204, Transcript of transportin 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNPO3, Length 3,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNPO3-204	ENST00000482320	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TNPO3-204	ENST00000482320	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TNPO3-204	ENST00000482320	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TNPO3-204	ENST00000482320	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TNPO3-204	ENST00000482320	DEPDC5	O75140	1603 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TNPO3-204	ENST00000482320	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TNPO3-204	ENST00000482320	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TNPO3-204	ENST00000482320	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TNPO3-204	ENST00000482320	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	IFT172	Q9UG01	1749 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	ATP10B	O94823	1461 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	TRIM52	Q96A61	297 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	CEP152	O94986	1710 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	NBR1	Q14596	966 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	TSPY4	P0CV99	314 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	TSPY10	P0CW01	314 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	11.6	□□□□□ -0.55	1e-6	■■■■□ 20.8
TNPO3-204	ENST00000482320	NCOA2	Q15596	1464 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TNPO3-204	ENST00000482320	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	UNC13B	O14795	1591 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	NEFL	P07196	543 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	MBD5	Q9P267	1494 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		11.56	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	SLC24A1	O60721	1099 aa		11.56	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	ABCC2	Q92887	1545 aa		11.55	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		11.55	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	PLXNC1	O60486	1568 aa		11.55	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		11.55	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		11.54	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		11.54	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		11.54	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	ASXL2	Q76L83	1435 aa		11.54	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	ABCA8	O94911	1581 aa		11.53	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		11.53	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	ADGRL2	O95490	1459 aa		11.53	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		11.53	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.56
TNPO3-204	ENST00000482320	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	11.51	□□□□□ -0.57	2e-6	■■■■■ 28.5
TNPO3-204	ENST00000482320	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	AFAP1	Q8N556	730 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	MSH5	O43196	834 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	CD109	Q6YHK3	1445 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	ABCA6	Q8N139	1617 aa		11.46	□□□□□ -0.57
TNPO3-204	ENST00000482320	PREX2	Q70Z35	1606 aa		11.46	□□□□□ -0.58
TNPO3-204	ENST00000482320	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		11.46	□□□□□ -0.58
TNPO3-204	ENST00000482320	RAPGEF3	O95398	923 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TNPO3-204	ENST00000482320	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TNPO3-204	ENST00000482320	KIF14	Q15058	1648 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TNPO3-204	ENST00000482320	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TNPO3-204	ENST00000482320	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TNPO3-204	ENST00000482320	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TNPO3-204	ENST00000482320	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TNPO3-204	ENST00000482320	MIA2	Q96PC5	1412 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TNPO3-204	ENST00000482320	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TNPO3-204	ENST00000482320	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TNPO3-204	ENST00000482320	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
TNPO3-204	ENST00000482320	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TNPO3-204	ENST00000482320	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TNPO3-204	ENST00000482320	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
TNPO3-204	ENST00000482320	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		11.4	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		11.4	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	MLEC	Q14165	292 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	PLCH2	O75038	1416 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	GGT6	Q6P531	493 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TNPO3-204	ENST00000482320	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		11.39	□□□□□ -0.59

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