RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481220.5

SNHG12-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, human

TSL 3

Gene SNHG12, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG12-208	ENST00000481220	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		29.34	■■■□□ 2.29
SNHG12-208	ENST00000481220	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		29.32	■■■□□ 2.28
SNHG12-208	ENST00000481220	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		29.3	■■■□□ 2.28
SNHG12-208	ENST00000481220	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		29.29	■■■□□ 2.28
SNHG12-208	ENST00000481220	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		29.29	■■■□□ 2.28
SNHG12-208	ENST00000481220	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SNHG12-208	ENST00000481220	PREX2	Q70Z35	1606 aa		29.26	■■■□□ 2.27
SNHG12-208	ENST00000481220	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		29.25	■■■□□ 2.27
SNHG12-208	ENST00000481220	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		29.24	■■■□□ 2.27
SNHG12-208	ENST00000481220	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		29.2	■■■□□ 2.27
SNHG12-208	ENST00000481220	AFAP1	Q8N556	730 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SNHG12-208	ENST00000481220	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SNHG12-208	ENST00000481220	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SNHG12-208	ENST00000481220	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
SNHG12-208	ENST00000481220	KDM5C	P41229	1560 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SNHG12-208	ENST00000481220	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
SNHG12-208	ENST00000481220	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SNHG12-208	ENST00000481220	ABCC1	P33527	1531 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SNHG12-208	ENST00000481220	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SNHG12-208	ENST00000481220	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SNHG12-208	ENST00000481220	ATP10A	O60312	1499 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SNHG12-208	ENST00000481220	PTPRM	P28827	1452 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SNHG12-208	ENST00000481220	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SNHG12-208	ENST00000481220	MADD	Q8WXG6	1647 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SNHG12-208	ENST00000481220	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNHG12-208	ENST00000481220	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNHG12-208	ENST00000481220	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNHG12-208	ENST00000481220	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNHG12-208	ENST00000481220	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SNHG12-208	ENST00000481220	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SNHG12-208	ENST00000481220	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SNHG12-208	ENST00000481220	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
SNHG12-208	ENST00000481220	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SNHG12-208	ENST00000481220	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SNHG12-208	ENST00000481220	TIAM1	Q13009	1591 aa		29.01	■■■□□ 2.24
SNHG12-208	ENST00000481220	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SNHG12-208	ENST00000481220	RERE	Q9P2R6	1566 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SNHG12-208	ENST00000481220	ABCA6	Q8N139	1617 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SNHG12-208	ENST00000481220	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	28.98	■■■□□ 2.23
SNHG12-208	ENST00000481220	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SNHG12-208	ENST00000481220	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SNHG12-208	ENST00000481220	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
SNHG12-208	ENST00000481220	MLEC	Q14165	292 aa		28.95	■■■□□ 2.22
SNHG12-208	ENST00000481220	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
SNHG12-208	ENST00000481220	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SNHG12-208	ENST00000481220	MAP3K1	Q13233	1512 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SNHG12-208	ENST00000481220	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SNHG12-208	ENST00000481220	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
SNHG12-208	ENST00000481220	AGL	P35573	1532 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SNHG12-208	ENST00000481220	MBD5	Q9P267	1494 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SNHG12-208	ENST00000481220	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.21
SNHG12-208	ENST00000481220	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SNHG12-208	ENST00000481220	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SNHG12-208	ENST00000481220	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
SNHG12-208	ENST00000481220	ATP7A	Q04656	1500 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SNHG12-208	ENST00000481220	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SNHG12-208	ENST00000481220	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SNHG12-208	ENST00000481220	PLXNC1	O60486	1568 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SNHG12-208	ENST00000481220	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SNHG12-208	ENST00000481220	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SNHG12-208	ENST00000481220	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
SNHG12-208	ENST00000481220	A2M	P01023	1474 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SNHG12-208	ENST00000481220	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SNHG12-208	ENST00000481220	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SNHG12-208	ENST00000481220	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SNHG12-208	ENST00000481220	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SNHG12-208	ENST00000481220	MIA2	Q96PC5	1412 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SNHG12-208	ENST00000481220	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SNHG12-208	ENST00000481220	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SNHG12-208	ENST00000481220	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
SNHG12-208	ENST00000481220	C3	P01024	1663 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SNHG12-208	ENST00000481220	HSPA2	P54652	639 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SNHG12-208	ENST00000481220	APLP2	Q06481	763 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SNHG12-208	ENST00000481220	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
SNHG12-208	ENST00000481220	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.58	■■■□□ 2.16
SNHG12-208	ENST00000481220	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SNHG12-208	ENST00000481220	ZMYM3	Q14202	1370 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SNHG12-208	ENST00000481220	TSPY4	P0CV99	314 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SNHG12-208	ENST00000481220	TSPY10	P0CW01	314 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SNHG12-208	ENST00000481220	GGT6	Q6P531	493 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SNHG12-208	ENST00000481220	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SNHG12-208	ENST00000481220	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
SNHG12-208	ENST00000481220	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		28.53	■■■□□ 2.16
SNHG12-208	ENST00000481220	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.5	■■■□□ 2.15
SNHG12-208	ENST00000481220	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
SNHG12-208	ENST00000481220	NPAT	Q14207	1427 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SNHG12-208	ENST00000481220	KIF3B	O15066	747 aa		28.47	■■■□□ 2.15
SNHG12-208	ENST00000481220	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.45	■■■□□ 2.15
SNHG12-208	ENST00000481220	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		28.45	■■■□□ 2.14
SNHG12-208	ENST00000481220	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
SNHG12-208	ENST00000481220	ABCC5	O15440	1437 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SNHG12-208	ENST00000481220	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.43	■■■□□ 2.14
SNHG12-208	ENST00000481220	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		28.39	■■■□□ 2.13
SNHG12-208	ENST00000481220	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SNHG12-208	ENST00000481220	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SNHG12-208	ENST00000481220	DAPK1	P53355	1430 aa		28.36	■■■□□ 2.13
SNHG12-208	ENST00000481220	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	28.36	■■■□□ 2.13

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