RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481120.1

LAMA5-209, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 386 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-209ENST00000481120 RICTORQ6R327 1708 aa36.29■■■■□ 3.4
LAMA5-209ENST00000481120 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.27■■■■□ 3.4
LAMA5-209ENST00000481120 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.25■■■■□ 3.39
LAMA5-209ENST00000481120 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.24■■■■□ 3.39
LAMA5-209ENST00000481120 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
LAMA5-209ENST00000481120 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.18■■■■□ 3.38
LAMA5-209ENST00000481120 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.16■■■■□ 3.38
LAMA5-209ENST00000481120 PREX2Q70Z35 1606 aa36.16■■■■□ 3.38
LAMA5-209ENST00000481120 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.15■■■■□ 3.38
LAMA5-209ENST00000481120 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.14■■■■□ 3.38
LAMA5-209ENST00000481120 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.14■■■■□ 3.38
LAMA5-209ENST00000481120 AFAP1Q8N556 730 aa36.13■■■■□ 3.37
LAMA5-209ENST00000481120 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.12■■■■□ 3.37
LAMA5-209ENST00000481120 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
LAMA5-209ENST00000481120 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
LAMA5-209ENST00000481120 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.07■■■■□ 3.36
LAMA5-209ENST00000481120 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.07■■■■□ 3.36
LAMA5-209ENST00000481120 ATP10AO60312 1499 aa36.06■■■■□ 3.36
LAMA5-209ENST00000481120 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.06■■■■□ 3.36
LAMA5-209ENST00000481120 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
LAMA5-209ENST00000481120 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.06■■■■□ 3.36
LAMA5-209ENST00000481120 KDM5CP41229 1560 aa36.02■■■■□ 3.36
LAMA5-209ENST00000481120 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.02■■■■□ 3.36
LAMA5-209ENST00000481120 ABCC1P33527 1531 aa36.01■■■■□ 3.36
LAMA5-209ENST00000481120 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36■■■■□ 3.35
LAMA5-209ENST00000481120 MLH3Q9UHC1 1453 aa36■■■■□ 3.35
LAMA5-209ENST00000481120 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.99■■■■□ 3.35
LAMA5-209ENST00000481120 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.98■■■■□ 3.35
LAMA5-209ENST00000481120 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.98■■■■□ 3.35
LAMA5-209ENST00000481120 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.96■■■■□ 3.35
LAMA5-209ENST00000481120 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.96■■■■□ 3.35
LAMA5-209ENST00000481120 MAP3K1Q13233 1512 aa35.94■■■■□ 3.34
LAMA5-209ENST00000481120 TIAM1Q13009 1591 aa35.93■■■■□ 3.34
LAMA5-209ENST00000481120 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.92■■■■□ 3.34
LAMA5-209ENST00000481120 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.91■■■■□ 3.34
LAMA5-209ENST00000481120 APLP2Q06481 763 aa35.91■■■■□ 3.34
LAMA5-209ENST00000481120 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.91■■■■□ 3.34
LAMA5-209ENST00000481120 PTPRMP28827 1452 aa35.9■■■■□ 3.34
LAMA5-209ENST00000481120 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.89■■■■□ 3.34
LAMA5-209ENST00000481120 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
LAMA5-209ENST00000481120 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
LAMA5-209ENST00000481120 NCOA2Q15596 1464 aa35.86■■■■□ 3.33
LAMA5-209ENST00000481120 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.86■■■■□ 3.33
LAMA5-209ENST00000481120 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.85■■■■□ 3.33
LAMA5-209ENST00000481120 MLECQ14165 292 aa35.83■■■■□ 3.33
LAMA5-209ENST00000481120 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.83■■■■□ 3.33
LAMA5-209ENST00000481120 REREQ9P2R6 1566 aa35.82■■■■□ 3.32
LAMA5-209ENST00000481120 MADDQ8WXG6 1647 aa35.79■■■■□ 3.32
LAMA5-209ENST00000481120 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.78■■■■□ 3.32
LAMA5-209ENST00000481120 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
LAMA5-209ENST00000481120 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
LAMA5-209ENST00000481120 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.74■■■■□ 3.31
LAMA5-209ENST00000481120 AGLP35573 1532 aa35.73■■■■□ 3.31
LAMA5-209ENST00000481120 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.73■■■■□ 3.31
LAMA5-209ENST00000481120 MBD5Q9P267 1494 aa35.71■■■■□ 3.31
LAMA5-209ENST00000481120 ABCA6Q8N139 1617 aa35.71■■■■□ 3.31
LAMA5-209ENST00000481120 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
LAMA5-209ENST00000481120 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
LAMA5-209ENST00000481120 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.67■■■■□ 3.3
LAMA5-209ENST00000481120 ATP7AQ04656 1500 aa35.66■■■■□ 3.3
LAMA5-209ENST00000481120 TSPY4P0CV99 314 aa35.63■■■■□ 3.29
LAMA5-209ENST00000481120 TSPY10P0CW01 314 aa35.63■■■■□ 3.29
LAMA5-209ENST00000481120 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.62■■■■□ 3.29
LAMA5-209ENST00000481120 MIA2Q96PC5 1412 aa35.62■■■■□ 3.29
LAMA5-209ENST00000481120 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.6■■■■□ 3.29
LAMA5-209ENST00000481120 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
LAMA5-209ENST00000481120 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.59■■■■□ 3.29
LAMA5-209ENST00000481120 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.57■■■■□ 3.29
LAMA5-209ENST00000481120 A2MP01023 1474 aa35.57■■■■□ 3.28
LAMA5-209ENST00000481120 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.57■■■■□ 3.28
LAMA5-209ENST00000481120 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.54■■■■□ 3.28
LAMA5-209ENST00000481120 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.54■■■■□ 3.28
LAMA5-209ENST00000481120 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.51■■■■□ 3.28
LAMA5-209ENST00000481120 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
LAMA5-209ENST00000481120 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.49■■■■□ 3.27
LAMA5-209ENST00000481120 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
LAMA5-209ENST00000481120 PLXNC1O60486 1568 aa35.46■■■■□ 3.27
LAMA5-209ENST00000481120 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
LAMA5-209ENST00000481120 GGT6Q6P531 493 aa35.43■■■■□ 3.26
LAMA5-209ENST00000481120 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.42■■■■□ 3.26
LAMA5-209ENST00000481120 ZMYM3Q14202 1370 aa35.36■■■■□ 3.25
LAMA5-209ENST00000481120 KIF3BO15066 747 aa35.34■■■■□ 3.25
LAMA5-209ENST00000481120 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.31■■■■□ 3.24
LAMA5-209ENST00000481120 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.31■■■■□ 3.24
LAMA5-209ENST00000481120 MROH2AA6NES4 1674 aa35.29■■■■□ 3.24
LAMA5-209ENST00000481120 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.29■■■■□ 3.24
LAMA5-209ENST00000481120 C3P01024 1663 aa35.28■■■■□ 3.24
LAMA5-209ENST00000481120 NPATQ14207 1427 aa35.28■■■■□ 3.24
LAMA5-209ENST00000481120 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.27■■■■□ 3.24
LAMA5-209ENST00000481120 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.26■■■■□ 3.24
LAMA5-209ENST00000481120 HSPA2P54652 639 aa35.26■■■■□ 3.24
LAMA5-209ENST00000481120 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
LAMA5-209ENST00000481120 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.22■■■■□ 3.23
LAMA5-209ENST00000481120 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.21■■■■□ 3.23
LAMA5-209ENST00000481120 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.21■■■■□ 3.23
LAMA5-209ENST00000481120 ABCC5O15440 1437 aa35.2■■■■□ 3.23
LAMA5-209ENST00000481120 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.18■■■■□ 3.22
LAMA5-209ENST00000481120 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
LAMA5-209ENST00000481120 DAPK1P53355 1430 aa35.15■■■■□ 3.22
LAMA5-209ENST00000481120 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.13■■■■□ 3.21
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