RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480189.5

CREB1-215, Transcript of cAMP responsive element binding protein 1, human

TSL 4

Gene CREB1, Length 569 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CREB1-215	ENST00000480189	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CREB1-215	ENST00000480189	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CREB1-215	ENST00000480189	CLIP1	P30622	1438 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CREB1-215	ENST00000480189	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CREB1-215	ENST00000480189	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CREB1-215	ENST00000480189	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CREB1-215	ENST00000480189	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CREB1-215	ENST00000480189	PTPRM	P28827	1452 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CREB1-215	ENST00000480189	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CREB1-215	ENST00000480189	MADD	Q8WXG6	1647 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CREB1-215	ENST00000480189	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CREB1-215	ENST00000480189	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CREB1-215	ENST00000480189	KDM5C	P41229	1560 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CREB1-215	ENST00000480189	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CREB1-215	ENST00000480189	PREX2	Q70Z35	1606 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CREB1-215	ENST00000480189	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CREB1-215	ENST00000480189	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CREB1-215	ENST00000480189	ABCC1	P33527	1531 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CREB1-215	ENST00000480189	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CREB1-215	ENST00000480189	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CREB1-215	ENST00000480189	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CREB1-215	ENST00000480189	ATP10A	O60312	1499 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CREB1-215	ENST00000480189	AFAP1	Q8N556	730 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CREB1-215	ENST00000480189	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
CREB1-215	ENST00000480189	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CREB1-215	ENST00000480189	CEP162	Q5TB80	1403 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CREB1-215	ENST00000480189	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CREB1-215	ENST00000480189	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CREB1-215	ENST00000480189	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CREB1-215	ENST00000480189	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CREB1-215	ENST00000480189	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CREB1-215	ENST00000480189	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CREB1-215	ENST00000480189	RERE	Q9P2R6	1566 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CREB1-215	ENST00000480189	ABCA6	Q8N139	1617 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CREB1-215	ENST00000480189	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CREB1-215	ENST00000480189	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CREB1-215	ENST00000480189	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CREB1-215	ENST00000480189	MLEC	Q14165	292 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CREB1-215	ENST00000480189	AGL	P35573	1532 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CREB1-215	ENST00000480189	TIAM1	Q13009	1591 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CREB1-215	ENST00000480189	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CREB1-215	ENST00000480189	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CREB1-215	ENST00000480189	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CREB1-215	ENST00000480189	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CREB1-215	ENST00000480189	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CREB1-215	ENST00000480189	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CREB1-215	ENST00000480189	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	13.68	□□□□□ -0.22
CREB1-215	ENST00000480189	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CREB1-215	ENST00000480189	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CREB1-215	ENST00000480189	MBD5	Q9P267	1494 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CREB1-215	ENST00000480189	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CREB1-215	ENST00000480189	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CREB1-215	ENST00000480189	PLXNC1	O60486	1568 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CREB1-215	ENST00000480189	ATP7A	Q04656	1500 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CREB1-215	ENST00000480189	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CREB1-215	ENST00000480189	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CREB1-215	ENST00000480189	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CREB1-215	ENST00000480189	HSPA2	P54652	639 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CREB1-215	ENST00000480189	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CREB1-215	ENST00000480189	NCOA2	Q15596	1464 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CREB1-215	ENST00000480189	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CREB1-215	ENST00000480189	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CREB1-215	ENST00000480189	C3	P01024	1663 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CREB1-215	ENST00000480189	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CREB1-215	ENST00000480189	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CREB1-215	ENST00000480189	A2M	P01023	1474 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CREB1-215	ENST00000480189	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CREB1-215	ENST00000480189	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CREB1-215	ENST00000480189	MAP3K1	Q13233	1512 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CREB1-215	ENST00000480189	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CREB1-215	ENST00000480189	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CREB1-215	ENST00000480189	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CREB1-215	ENST00000480189	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB1-215	ENST00000480189	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB1-215	ENST00000480189	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB1-215	ENST00000480189	FOXD1	Q16676	465 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB1-215	ENST00000480189	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CREB1-215	ENST00000480189	STRC	Q7RTU9	1775 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB1-215	ENST00000480189	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB1-215	ENST00000480189	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB1-215	ENST00000480189	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CREB1-215	ENST00000480189	NPAT	Q14207	1427 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CREB1-215	ENST00000480189	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CREB1-215	ENST00000480189	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
CREB1-215	ENST00000480189	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CREB1-215	ENST00000480189	FBXO41	Q8TF61	875 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CREB1-215	ENST00000480189	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CREB1-215	ENST00000480189	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CREB1-215	ENST00000480189	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CREB1-215	ENST00000480189	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CREB1-215	ENST00000480189	GGT6	Q6P531	493 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CREB1-215	ENST00000480189	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CREB1-215	ENST00000480189	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CREB1-215	ENST00000480189	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CREB1-215	ENST00000480189	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CREB1-215	ENST00000480189	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CREB1-215	ENST00000480189	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CREB1-215	ENST00000480189	PTPRT	O14522	1441 aa		13.46	□□□□□ -0.26
CREB1-215	ENST00000480189	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CREB1-215	ENST00000480189	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.44	□□□□□ -0.26

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