RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 TIAM1Q13009 1591 aa29.95■■■□□ 2.39
SYF2-203ENST00000474160 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.95■■■□□ 2.39
SYF2-203ENST00000474160 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.94■■■□□ 2.38
SYF2-203ENST00000474160 RICTORQ6R327 1708 aa29.93■■■□□ 2.38
SYF2-203ENST00000474160 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.93■■■□□ 2.38
SYF2-203ENST00000474160 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.91■■■□□ 2.38
SYF2-203ENST00000474160 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.91■■■□□ 2.38
SYF2-203ENST00000474160 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.91■■■□□ 2.38
SYF2-203ENST00000474160 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.9■■■□□ 2.38
SYF2-203ENST00000474160 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
SYF2-203ENST00000474160 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.89■■■□□ 2.37
SYF2-203ENST00000474160 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.86■■■□□ 2.37
SYF2-203ENST00000474160 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.85■■■□□ 2.37
SYF2-203ENST00000474160 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
SYF2-203ENST00000474160 ABCC1P33527 1531 aa29.82■■■□□ 2.36
SYF2-203ENST00000474160 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.81■■■□□ 2.36
SYF2-203ENST00000474160 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.81■■■□□ 2.36
SYF2-203ENST00000474160 APLP2Q06481 763 aa29.81■■■□□ 2.36
SYF2-203ENST00000474160 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
SYF2-203ENST00000474160 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.81■■■□□ 2.36
SYF2-203ENST00000474160 NCOA2Q15596 1464 aa29.79■■■□□ 2.36
SYF2-203ENST00000474160 KDM5CP41229 1560 aa29.78■■■□□ 2.36
SYF2-203ENST00000474160 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.78■■■□□ 2.36
SYF2-203ENST00000474160 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
SYF2-203ENST00000474160 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.76■■■□□ 2.36
SYF2-203ENST00000474160 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.74■■■□□ 2.35
SYF2-203ENST00000474160 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.73■■■□□ 2.35
SYF2-203ENST00000474160 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.71■■■□□ 2.35
SYF2-203ENST00000474160 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.71■■■□□ 2.35
SYF2-203ENST00000474160 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
SYF2-203ENST00000474160 AFAP1Q8N556 730 aa29.69■■■□□ 2.34
SYF2-203ENST00000474160 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.69■■■□□ 2.34
SYF2-203ENST00000474160 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.69■■■□□ 2.34
SYF2-203ENST00000474160 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.68■■■□□ 2.34
SYF2-203ENST00000474160 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
SYF2-203ENST00000474160 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.66■■■□□ 2.34
SYF2-203ENST00000474160 ATP10AO60312 1499 aa29.65■■■□□ 2.34
SYF2-203ENST00000474160 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.62■■■□□ 2.33
SYF2-203ENST00000474160 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.61■■■□□ 2.33
SYF2-203ENST00000474160 MIA2Q96PC5 1412 aa29.6■■■□□ 2.33
SYF2-203ENST00000474160 REREQ9P2R6 1566 aa29.6■■■□□ 2.33
SYF2-203ENST00000474160 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.59■■■□□ 2.33
SYF2-203ENST00000474160 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
SYF2-203ENST00000474160 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.58■■■□□ 2.33
SYF2-203ENST00000474160 MBD5Q9P267 1494 aa29.57■■■□□ 2.32
SYF2-203ENST00000474160 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.57■■■□□ 2.32
SYF2-203ENST00000474160 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
SYF2-203ENST00000474160 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.56■■■□□ 2.32
SYF2-203ENST00000474160 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.55■■■□□ 2.32
SYF2-203ENST00000474160 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.55■■■□□ 2.32
SYF2-203ENST00000474160 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.53■■■□□ 2.32
SYF2-203ENST00000474160 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
SYF2-203ENST00000474160 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.53■■■□□ 2.32
SYF2-203ENST00000474160 ABCA6Q8N139 1617 aa29.51■■■□□ 2.31
SYF2-203ENST00000474160 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.5■■■□□ 2.31
SYF2-203ENST00000474160 ATP7AQ04656 1500 aa29.5■■■□□ 2.31
SYF2-203ENST00000474160 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.49■■■□□ 2.31
SYF2-203ENST00000474160 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.49■■■□□ 2.31
SYF2-203ENST00000474160 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
SYF2-203ENST00000474160 AGLP35573 1532 aa29.48■■■□□ 2.31
SYF2-203ENST00000474160 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.44■■■□□ 2.3
SYF2-203ENST00000474160 TSPY4P0CV99 314 aa29.4■■■□□ 2.3
SYF2-203ENST00000474160 TSPY10P0CW01 314 aa29.4■■■□□ 2.3
SYF2-203ENST00000474160 MADDQ8WXG6 1647 aa29.39■■■□□ 2.3
SYF2-203ENST00000474160 PTPRMP28827 1452 aa29.38■■■□□ 2.29
SYF2-203ENST00000474160 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.37■■■□□ 2.29
SYF2-203ENST00000474160 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.37■■■□□ 2.29
SYF2-203ENST00000474160 A2MP01023 1474 aa29.36■■■□□ 2.29
SYF2-203ENST00000474160 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.35■■■□□ 2.29
SYF2-203ENST00000474160 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
SYF2-203ENST00000474160 PLXNC1O60486 1568 aa29.35■■■□□ 2.29
SYF2-203ENST00000474160 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.34■■■□□ 2.29
SYF2-203ENST00000474160 MLECQ14165 292 aa29.32■■■□□ 2.28
SYF2-203ENST00000474160 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.3■■■□□ 2.28
SYF2-203ENST00000474160 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
SYF2-203ENST00000474160 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
SYF2-203ENST00000474160 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.28■■■□□ 2.28
SYF2-203ENST00000474160 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.25■■■□□ 2.27
SYF2-203ENST00000474160 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.25■■■□□ 2.27
SYF2-203ENST00000474160 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
SYF2-203ENST00000474160 ABCC5O15440 1437 aa29.21■■■□□ 2.27
SYF2-203ENST00000474160 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
SYF2-203ENST00000474160 DAPK1P53355 1430 aa29.2■■■□□ 2.27
SYF2-203ENST00000474160 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.18■■■□□ 2.26
SYF2-203ENST00000474160 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.15■■■□□ 2.26
SYF2-203ENST00000474160 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.13■■■□□ 2.25
SYF2-203ENST00000474160 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.12■■■□□ 2.25
SYF2-203ENST00000474160 MROH2AA6NES4 1674 aa29.12■■■□□ 2.25
SYF2-203ENST00000474160 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
SYF2-203ENST00000474160 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
SYF2-203ENST00000474160 GGT6Q6P531 493 aa29.1■■■□□ 2.25
SYF2-203ENST00000474160 KIF3BO15066 747 aa29.09■■■□□ 2.25
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.09■■■□□ 2.25
SYF2-203ENST00000474160 KIF15Q9NS87 1388 aa29.08■■■□□ 2.25
SYF2-203ENST00000474160 ADGRL2O95490 1459 aa29.06■■■□□ 2.24
SYF2-203ENST00000474160 ERBINQ96RT1 1412 aa29.06■■■□□ 2.24
SYF2-203ENST00000474160 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
SYF2-203ENST00000474160 ZMYM3Q14202 1370 aa29.03■■■□□ 2.24
SYF2-203ENST00000474160 C3P01024 1663 aa29.03■■■□□ 2.24
SYF2-203ENST00000474160 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms