RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
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RABGGTB-209ENST00000473406 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
RABGGTB-209ENST00000473406 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa10.88□□□□□ -0.67
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM117AQ9C073 453 aa10.88□□□□□ -0.67
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA2Q08379 1002 aa10.87□□□□□ -0.67
RABGGTB-209ENST00000473406 C1orf115Q9H7X2 142 aa10.87□□□□□ -0.67
RABGGTB-209ENST00000473406 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
RABGGTB-209ENST00000473406 DPYSL4O14531 572 aa10.85□□□□□ -0.67
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR37O15354 613 aa10.84□□□□□ -0.67
RABGGTB-209ENST00000473406 PDIA6Q15084 440 aa10.84□□□□□ -0.67
RABGGTB-209ENST00000473406 DDRGK1Q96HY6 314 aa10.84□□□□□ -0.67
RABGGTB-209ENST00000473406 POTEHQ6S545 545 aa10.83□□□□□ -0.68
RABGGTB-209ENST00000473406 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
RABGGTB-209ENST00000473406 HRCP23327 699 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGGTB-209ENST00000473406 FLIIQ13045 1269 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGGTB-209ENST00000473406 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.81□□□□□ -0.68
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RABGGTB-209ENST00000473406 ARID3CA6NKF2 412 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGGTB-209ENST00000473406 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
RABGGTB-209ENST00000473406 APBB1O00213 710 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC102AQ96A19 550 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM106CQ9BVX2 250 aa10.78□□□□□ -0.68
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP2K5Q13163 448 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-209ENST00000473406 AMHR2Q16671 573 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-209ENST00000473406 PARP9Q8IXQ6 854 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-209ENST00000473406 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-209ENST00000473406 IRF6O14896 467 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-209ENST00000473406 DSG2Q14126 1118 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-209ENST00000473406 NUTM2FA1L443 756 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-209ENST00000473406 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-209ENST00000473406 PHF12Q96QT6 1004 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-209ENST00000473406 GOPCQ9HD26 462 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ZRANB1Q9UGI0 708 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-209ENST00000473406 GRXCR2A6NFK2 248 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTB-209ENST00000473406 GNPATO15228 680 aa10.69□□□□□ -0.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
RABGGTB-209ENST00000473406 A6NJR5 290 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXK1P85037 733 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGGTB-209ENST00000473406 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
RABGGTB-209ENST00000473406 TMC2Q8TDI7 906 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBTB7CA1YPR0 619 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGGTB-209ENST00000473406 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
RABGGTB-209ENST00000473406 HIC1Q14526 733 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGGTB-209ENST00000473406 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.71e-7■□□□□ 10.5
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC82Q8N4S0 544 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-209ENST00000473406 TRPC6Q9Y210 931 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAK2O60296 914 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-209ENST00000473406 CLUAP1Q96AJ1 413 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-209ENST00000473406 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-209ENST00000473406 FCHSD2O94868 740 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-209ENST00000473406 CD44P16070 742 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-209ENST00000473406 OSBPP22059 807 aa10.61□□□□□ -0.71
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RABGGTB-209ENST00000473406 PLPP6Q8IY26 295 aa10.61□□□□□ -0.71
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RABGGTB-209ENST00000473406 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGGTB-209ENST00000473406 MS4A1P11836 297 aa10.58□□□□□ -0.72
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RABGGTB-209ENST00000473406 TIE1P35590 1138 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-209ENST00000473406 TTLL13PA6NNM8 815 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-209ENST00000473406 DPY19L2Q6NUT2 758 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-209ENST00000473406 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-209ENST00000473406 PIP4P2Q8N4L2 257 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGGTB-209ENST00000473406 PTGER2P43116 358 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGGTB-209ENST00000473406 NECTIN2Q92692 538 aa10.54□□□□□ -0.72
RABGGTB-209ENST00000473406 C2orf72A6NCS6 295 aa10.53□□□□□ -0.72
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX12PQ92771 950 aa10.53□□□□□ -0.72
RABGGTB-209ENST00000473406 PTGDRQ13258 359 aa10.52□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP10.52□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF3CO14782 793 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 CLCN1P35523 988 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 CHRDL2Q6WN34 429 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 RAD21O60216 631 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 OXER1Q8TDS5 423 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINA10Q9UK55 444 aa10.47□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D12O60347 775 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-209ENST00000473406 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-209ENST00000473406 TMUB1Q9BVT8 246 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAIPQ9BWF2 469 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-209ENST00000473406 GPCPD1Q9NPB8 672 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-209ENST00000473406 BOLA1Q9Y3E2 137 aa10.45□□□□□ -0.74
RABGGTB-209ENST00000473406 G3V3G9 751 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-209ENST00000473406 POM121Q96HA1 1249 aa10.44□□□□□ -0.74
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